Une nouvelle étude offre la possibilité de démasquer des mutations génétiques dans un organe bien avant que les techniques de dépistage couramment utilisées ne détectent des signes de cancer. Le secret réside dans la chasse à travers des tissus apparemment sains pour le codage génétique derrière les tumeurs, en utilisant des méthodes développées au KTH Royal Institute of Technology à Stockholm.
Le professeur Joakim Lundeberg du KTH explique que le criblage des organes a été effectué avec la transcriptomique spatiale, qui cartographie les tissus sans les briser, tout en plongeant profondément dans les cellules pour exposer l’activité génétique dans l’environnement cellulaire plus large d’un organe.
Publié aujourd’hui dans Nature, Lundeberg et ses collaborateurs de l’Université d’Oxford, du Karolinska Institutet et du centre de recherche conjoint Science for Life Laboratory (SciLifeLab) à Stockholm ont fait état d’une découverte sans précédent. Dans des coupes transversales d’organes de la prostate, les altérations génétiques dans des cellules apparemment saines et non affectées correspondaient étonnamment à celles des cellules tumorales.
« Ce fut une telle surprise », a déclaré Lundeberg. « Vous ne saisiriez pas cela dans des examens microscopiques de routine. Nous voyons des choses en dehors de la tumeur, et ce qui est si excitant, c’est que nous pourrions comprendre l’évolution des tissus sains vers l’établissement de la tumeur.
« Il est possible maintenant que nous puissions réellement identifier les premiers événements de la progression du cancer. Imaginez si nous pouvions définir ces signatures moléculaires pour développer des biomarqueurs pour dépister et identifier les patients avant qu’une tumeur ne se développe. »
La transcriptomique spatiale diffère fortement de l’échantillonnage histologique, dans lequel une couche de tissu est examinée visuellement au microscope et notée par un pathologiste. « C’est comme regarder sous un lampadaire en se concentrant uniquement sur la tumeur, mais pas dans les zones environnantes, et c’est un type de science très subjectif », explique Lundeberg.
En revanche, la transcriptomique spatiale est impartiale et beaucoup plus étendue que la microscopie, bien que pour une utilisation généralisée dans la pratique clinique, les mesures des altérations génétiques doivent être réduites en coût. Lundeberg dit que la loi de Moore pourrait commencer à s’imposer à mesure qu’une communauté plus large d’oncologues se familiarisera avec la méthodologie.
L’un des premiers champions est le propre co-auteur de l’étude, Alastair Lamb, un urologue qui se concentre sur le traitement chirurgical des patients atteints de cancer de la prostate au sein du département Nuffield des sciences chirurgicales de l’Université d’Oxford.
« Nous n’avons jamais eu ce niveau de résolution disponible auparavant », a déclaré Lamb dans un communiqué de presse d’Oxford. « Par exemple, nous avons découvert que de nombreux événements de nombre de copies que nous pensions auparavant être spécifiquement liés au cancer sont en fait déjà présents dans les tissus bénins. Cela a de grandes implications pour le diagnostic et aussi potentiellement pour décider quels éléments d’un cancer doivent être traités. «
