L’infection à Clostridioides difficile (rCDI) survient dans l’intestin et est causée par la bactérie anaérobie Gram-positive sporulée, C. difficile, lorsque ses spores se fixent aux matières fécales et sont transférées de la main à la bouche par les agents de santé.
Les patients sous traitement antibiotique sont particulièrement sensibles car les micro-organismes qui maintiennent un intestin sain sont fortement endommagés par les antibiotiques.
Le traitement du rCDI implique le retrait des antibiotiques responsables et l’initiation d’un traitement antibiotique, bien que cela puisse être très difficile. La transplantation de microbiote fécal (FMT) est considérée comme une thérapie alternative efficace car elle aborde le problème de A à Z en remplaçant la microflore endommagée par une microflore saine grâce à une greffe de selles.
Cependant, deux décès causés par des infections bactériennes résistantes aux antibiotiques après la FMT ont été signalés en 2019, ce qui suggère qu’une modification de la FMT ou des alternatives sont nécessaires pour résoudre les problèmes de sécurité entourant le traitement.
Des chercheurs de l’Université d’Osaka et de l’Institut des sciences médicales de l’Université de Tokyo ont relevé ce défi de front dans une grande étude maintenant publiée en gastro-entérologie.
En utilisant leur pipeline d’analyse original rapporté en 2020, les chercheurs ont obtenu des informations sur les métagénomes bactériens et viraux intestinaux à partir d’échantillons fécaux de neuf patients rCDI de l’hôpital Brigham and Women’s de Boston qui ont eu avec succès une FMT. Ils ont révélé les bactéries et phages impliqués dans la pathogenèse de la rCDI et les voies remarquables importantes pour la récupération de la fonction de la flore intestinale.
En révélant comment le bactériome et le virome dans l’intestin fonctionnent ensemble en tant qu’organe, l’équipe de recherche a pu montrer comment la FMT peut être aussi sûre que de remplacer un mauvais organe par un bon.
Le microbiote intestinal doit définitivement être traité comme un «organe». La FMT a radicalement changé le bactériome et le virome intestinaux et est sûre de restaurer les fonctions bactériennes et virales intestinales. «
Satoshi Uematsu, professeur et chercheur principal, Université de la ville d’Osaka
Dans le monde post-COVID-19, le rCDI deviendra l’une des maladies internationales les plus urgentes. Il ne fait aucun doute que la FMT est une stratégie thérapeutique importante pour le rCDI. « En plus d’une variété d’enquêtes cliniques, une analyse métagénomique complète est très importante pour considérer la sécurité de la FMT. » disent le Dr Kosuke Fujimoto et le professeur Seiya Imoto.
La source:
Référence du journal:
Fujimoto, K., et al. (2021) Restauration fonctionnelle des bactéries et viromes par transplantation de microbiote fécal. Gastroentérologie. doi.org/10.1053/j.gastro.2021.02.013.
