Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de préimpression, les chercheurs ont évalué l’efficacité des vaccinations contre les variantes préoccupantes du coronavirus 2 (SARS-CoV-2) Delta et Omicron du syndrome respiratoire aigu sévère (COV).
Sommaire
Arrière plan
Des études antérieures ont rapporté que les vaccinations ont fourni une protection significative contre la souche originale du SRAS-CoV-2 (Wuhan-Hu-1) ; cependant, les souches de SRAS-CoV-2 récemment apparues ont démontré un plus grand potentiel de provoquer des infections de percée vaccinale. Omicron s’est avéré contenir plusieurs mutations responsables de son infectivité accrue, de son évasion immunitaire accrue et de l’efficacité réduite des anticorps monoclonaux et des transferts d’anticorps plasmatiques.
À propos de l’étude
Les chercheurs ont évalué l’efficacité de la vaccination contre Delta et Omicron dans la présente étude cas-témoin.
Pour l’analyse, l’ensemble de données de séquence génomique de l’État de New York (NYS) a été lié aux données de vaccination et démographiques des participants. Les associations ajustées de l’âge, du type de vaccination (Moderna, Janssen, Pfizer), du statut de la vaccination et du temps écoulé depuis la vaccination avec les souches du SRAS-CoV-2 ont été évaluées à l’aide des rapports de cotes (OR). Les données ont été analysées à l’aide de modèles de régression logistique de l’onde Delta et de l’onde Omicron, et les meilleurs modèles d’ajustement ont été décidés à l’aide du système de notation du critère d’information d’Akaike (AIC).
Des écouvillons respiratoires ont été obtenus des participants à l’étude pour une analyse PCR en temps réel, après quoi des écouvillons positifs au SRAS-CoV-2 ont été soumis à un séquençage du génome entier (WGS) pour la surveillance génomique. Les échantillons ont été liés aux données démographiques du système de surveillance électronique des maladies transmissibles (CDESS) et aux dossiers de vaccination du système de vaccination du NYS (NYSIIS).
L’analyse d’émergence d’Omicron a été réalisée entre le 28 novembre 2021 et le 24 janvier 2022. Les individus infectés par Omicron (toutes les sous-lignées BA) (cas, n = 1439) ont été appariés à des individus infectés par toute autre souche (témoins, n = 728) pendant la période de prédominance d’Omicron. Les cas ont été appariés aux témoins en fonction de la date de prélèvement des échantillons, du sexe, de l’âge et des régions économiques.
L’analyse d’émergence Delta a été réalisée entre le 19 mars 2021 et le 15 août 2021, pour lesquels les cas (n = 603) comprenaient des individus infectés par Delta (toutes les sous-lignées AY) et ceux affectés par toute autre souche de SRAS-CoV-2 à l’exception de Delta durant la période de prédominance Delta ont été considérés comme témoins (n=1816). Les variables associées à la vaccination de rappel ont été exclues de l’analyse d’émergence Delta car les doses de rappel n’étaient pas facilement disponibles pendant cette période.
Résultats
Dans l’analyse d’émergence d’Omicron, la plupart des participants (> 80 %) étaient âgés de 18 à 69 ans, 22 % et 8 % des cas et des témoins, respectivement, avaient reçu des rappels de vaccination, et les proportions correspondantes d’individus non vaccinés étaient de 30 % et 56 %, respectivement. Parmi les personnes vaccinées, 177, 109 et 22 ont reçu respectivement les vaccins Pfizer, Moderna et Janssen. Tous les contrôles de l’ensemble de données ont été infectés par Delta.
Les vaccinations complètes et les vaccinations de rappel étaient substantiellement associées aux infections à Omicron, avec des valeurs OR de 3,1 et 6,7, respectivement. Le risque d’infections à Omicron par rapport aux infections à Delta a montré une tendance à la baisse avec l’âge (OR 0,96). La probabilité plus élevée d’infections à Omicron chez les jeunes par rapport aux adultes pourrait être due à une plus grande socialisation et à d’autres facteurs de risque comportementaux chez les personnes âgées de 18 à 29 ans.
En limitant l’analyse aux seuls individus qui ont été vaccinés, la probabilité d’infections à Omicron a diminué avec l’augmentation du temps écoulé depuis la dernière vaccination (OR 0,99). De plus, la probabilité d’infections par Omicron était plus faible avec les vaccinations Janssen (OR 0,35) par rapport aux vaccinations Pfizer ; (OR 0,4) par rapport à toute vaccination par l’acide ribonucléique messager (ARNm).
Dans l’analyse d’émergence Delta, la plupart des individus (75 %) étaient également âgés de 18 à 69 ans, et 61,8 % et 75 % des cas et des témoins, respectivement, n’étaient pas vaccinés. Parmi les témoins, 62 %, 20 %, 3,5 % et 1 % des individus étaient infectés par les souches Alpha, Iota, Gamma et Beta, respectivement, et les autres étaient infectés par d’autres souches non COV du SRAS-CoV-2. .
Ni le type de vaccination ni le temps écoulé depuis la dernière vaccination n’ont montré une association significative avec une probabilité plus élevée d’infections Delta par rapport à l’infection par toute autre souche de SRAS-CoV-2. Cependant, lorsque l’âge n’était pas pris en compte pour l’appariement des cas et des témoins, les personnes qui ont reçu des vaccins Pfizer étaient 7,3 fois plus susceptibles de développer des infections Delta par rapport à toute autre infection par la souche SARS-CoV-2.
conclusion
Dans l’ensemble, les résultats de l’étude ont montré qu’Omicron était plus immuno-évasif que Delta et pouvait percer la protection du vaccin contre le SRAS-CoV-2 (y compris les doses de rappel) plus efficacement que Delta, bien que Delta puisse être mieux en mesure de percer les vaccins que le SRAS précédent. -Souches de CoV-2 telles que Alpha.
Cependant, l’effet du temps écoulé depuis la vaccination n’a pas été évalué en stratifiant les individus en fonction de la réception ou de la non-réception de doses de rappel. L’échantillon de population de l’étude était petit pour évaluer les effets de la vaccination par type de vaccin. Par conséquent, des recherches supplémentaires avec des échantillons plus importants et une comparaison entre les types de vaccins et entre les individus boostés et non boostés sont nécessaires pour mieux informer les développeurs de vaccins.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
