Une nouvelle approche peut aider à identifier les patients à risque de cancer de l’œsophage

Selon une nouvelle étude menée par des chercheurs du Johns Hopkins Kimmel Cancer Center et Case Western, une combinaison de brossage de l’œsophage et d’un séquençage génétique approfondi de l’échantillon collecté peut détecter des altérations chromosomiques chez les personnes atteintes de l’œsophage de Barrett, identifiant les patients à risque de progresser vers un cancer de l’œsophage Université de réserve.

Dans l’œsophage de Barrett (BE), le reflux acide chronique de l’estomac endommage les cellules tapissant l’œsophage inférieur, les faisant ressembler davantage à des cellules du système digestif inférieur. Les cellules de l’œsophage inférieur progressent à travers plusieurs stades précancéreux avant de se développer parfois en adénocarcinome œsophagien, un cancer dont le taux de survie à cinq ans est inférieur à 20%. BE est le seul précurseur connu de l’adénocarcinome de l’œsophage.

Les cliniciens peuvent détecter ces états progressifs en BE en recherchant des altérations chromosomiques appelées aneuploïdie – une caractéristique commune dans la plupart des cellules cancéreuses – mais jusqu’à présent, le processus a impliqué de multiples biopsies.

Un seul brossage œsophagien associé à la technique de séquençage appelée RealSeqS est suffisamment sensible et spécifique pour identifier l’aneuploïdie à plusieurs stades de la progression de l’EB, et peut même correspondre à des types spécifiques d’aneuploïdie avec des stades spécifiques de la maladie, selon les chercheurs.

L’aneuploïdie a longtemps été impliquée dans le développement, l’initiation ou la progression du cancer de l’œsophage, mais les dosages ou les méthodes expérimentales pour le détecter n’ont pas été aussi faciles à réaliser ou à un débit aussi élevé que nous aurions souhaité permettre une mise en œuvre clinique. « 

Chetan Bettegowda, MD, Ph.D., auteur principal de l’étude et professeur de neurochirurgie Jennison et Novak Families, Kimmel Cancer Center

La méthode pourrait aider les cliniciens à identifier les personnes présentant un risque plus élevé de progression de l’EB vers un adénocarcinome de l’œsophage, « instaurant un suivi plus intensif de ces patients ou instituant des traitements aux stades précoces de la maladie », explique Bettegowda.

Les résultats ont été publiés en ligne le 21 janvier dans la revue Gastroentérologie.

Le brossage œsophagien utilise une brosse douce pour un endoscope afin de collecter les cellules de la muqueuse œsophagienne. La méthode peut échantillonner des cellules d’une plus grande surface de l’œsophage qu’une biopsie habituelle. L’endoscopie, souvent avec brossage, «fait partie de la norme de soins pour les personnes atteintes de la maladie de Barrett», dit Bettegowda, donc incorporer la méthode de détection de l’aneuploïdie ne changerait pas substantiellement la pratique clinique.

Cependant, seules quelques cellules sur des centaines échantillonnées par brossage peuvent démontrer une aneuploïdie, donc combiner le brossage avec un séquençage massivement parallèle est la clé pour trouver ces cellules. Les chercheurs ont utilisé une technique appelée RealSeqS pour examiner plus de 350 000 régions du génome afin d’identifier des altérations spécifiques du bras chromosomique. RealSeqS peut généralement détecter l’aneuploïdie au niveau d’environ 1 cellule sur 200, ce qui est nécessaire lorsque de grandes parties du brossage œsophagien sont dérivées de cellules normales, explique l’auteur principal de l’étude Christopher Douville, le chercheur du Kimmel Center qui a conçu RealSeqS.

«La méthode est rapide et peut traiter des centaines d’échantillons de manière rentable, ce qui en fait un choix idéal pour la recherche BE», déclare Douville.

Les chercheurs ont obtenu des brossages œsophagiens de patients sans BE, avec BE et sans cellules anormales, avec BE et des anomalies cellulaires de bas ou de haut grade, et des patients atteints d’adénocarcinome œsophagien. Ils ont formé leur système d’identification pour distinguer les brossages des patients BE sans anomalies cellulaires de ceux atteints d’adénocarcinome en utilisant des échantillons de 79 patients. L’équipe de recherche a ensuite examiné des échantillons de 268 patients pour tester si la méthode pouvait distinguer différents stades de progression de l’EB.

Bettegowda, Douville et leurs collègues ont identifié un seuil d’aneuploïdie qui distingue les patients présentant des anomalies cellulaires de haut grade et un adénocarcinome des patients BE sans anomalies cellulaires. À ce seuil, la méthode a identifié des patients à haut risque dans 232 soit 86,7% des cas.

La méthode a également identifié des modifications chromosomiques spécifiques du bras à chaque étape de la progression de BE vers l’adénocarcinome. Certains de ces changements spécifiques ont déjà été liés aux stades de la maladie par des recherches antérieures, « mais ils n’étaient pas suffisamment complets pour être utilisés de manière diagnostique ou pronostique », explique Douville.

Les chercheurs ont utilisé ces changements pour développer un outil d’évaluation qu’ils ont appelé BAD (Barrett’s Aneuploidy Decision), pour distinguer les étapes de la progression BE. L’outil pourrait être particulièrement utile pour identifier les individus à haut risque lorsque les biopsies cellulaires semblent bénignes, car l’outil BAD souligne les changements moléculaires qui sont liés à une maladie plus agressive, dit Bettegowda.

«L’aneuploïdie est un biomarqueur aussi universel que celui que nous pouvons trouver actuellement pour le cancer, nous sommes donc ravis de voir comment nous pouvons utiliser cette technologie pour une multitude de cancers», dit-il. « Nous sommes optimistes que compte tenu de la polyvalence du test RealSeqS, nous pourrions étudier d’autres processus pathologiques, d’autres types de cancer et potentiellement trouver d’autres moyens d’intervenir plus tôt. »