Le risque de transmission du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) peut être évalué en déterminant l’évolution temporelle de l’excrétion à l’aide d’indicateurs de diagnostic tels que les valeurs de seuil de cycle (Ct) grâce à la récupération du SRAS-CoV-2 à partir d’une culture virale et les tests de réaction en chaîne par polymérase de transcription inverse (RT-PCR).
Selon des études précédentes, les résultats de la RT-PCR sont restés positifs jusqu’à 4 semaines après que les personnes infectées par le SRAS-CoV-2 aient présenté des symptômes. Cependant, la récupération du virus viable n’a pas pu se produire dix jours après le test positif initial. On a observé que les personnes vaccinées infectées par la variante Delta avaient des valeurs de Ct similaires mais des titres viraux inférieurs à ceux des personnes non vaccinées. Cependant, ces enquêtes impliquaient le recrutement de participants au début des symptômes ou peu de temps après, limitant leur description de l’excrétion virale pendant la période pré-symptomatique.
Une nouvelle étude des Centers for Disease Control and Prevention (CDC) publiée dans le Vaccin revue visant à analyser la chronologie de l’excrétion virale et de la conversion des personnes infectées par le SRAS-CoV-2 à partir de l’exposition à l’infection et de l’apparition des symptômes pendant une période d’épidémie de Delta dans une prison fédérale du Texas.
Communication courte : excrétion virale du SRAS-CoV-2 chez les personnes vaccinées et non vaccinées : une série de cas. Crédit d’image : NIAID
À propos de l’étude
L’étude impliquait la collecte d’écouvillons nasaux de personnes incarcérées pour la réaction en chaîne par polymérase à transcription inverse (RT-PCR) et le test d’antigène tous les deux jours après l’exposition. Les personnes exposées ont été placées en quarantaine. Ceux dont les tests antigéniques étaient positifs ont été placés en isolement médical. Un seul écouvillon a été prélevé quotidiennement sur les personnes infectées pendant dix jours et testé par culture virale et RT-PCR. Après dix jours, tous les participants infectés devaient remplir un questionnaire sur les symptômes.
Des informations sur les antécédents médicaux, les caractéristiques démographiques, les antécédents d’infection par le SRAS-CoV-2 et le statut vaccinal ont été obtenus pour tous les participants. La culture virale a été réalisée aux jours 0, 3, 5, 7 et 9 après le premier test positif en utilisant des cellules Vero-E6. L’incubation des cellules infectées par l’échantillon a eu lieu à 37 Cin 5 % de CO2 et a été observée pour l’effet cytopathique. Si l’effet cytopathique était observé, il était défini comme virus isolé ; si l’effet cytopathique n’était pas observé, il était défini comme virus non isolé.
Résultats de l’étude
Au total, 12 personnes ont été identifiées comme éligibles pour cette analyse de séries de cas. Tous étaient des hommes et tous identifiés comme blancs non hispaniques. L’âge médian était de 43 ans. Sur 12 participants, 3 n’ont jamais eu de test antigénique positif. Sur les 9 participants avec des tests antigéniques positifs, 5 avaient des résultats de culture virale positifs à partir d’échantillons prélevés le même jour que le test antigénique positif, tandis que 2 avaient des résultats de culture virale positifs mais un test antigénique négatif le même jour.
Dix participants auraient terminé une série de vaccinations primaires contre la COVID-19 avant l’épidémie. Parmi eux, 2 avaient déjà été infectés par le SRAS-CoV-2 et auraient été vaccinés à la suite de celle-ci. Le SRAS-CoV-2 a été récupéré en culture virale chez 9 participants dans un délai moyen de 6 jours. L’ARN du SRAS-CoV-2 a été détecté chez les 12 participants. De plus, on a observé que les valeurs seuils du cycle augmentaient avec le nombre de jours à compter de la première date de test positif. Les échantillons avec des résultats de culture positifs ont montré des valeurs Ct inférieures à celles avec des résultats de culture négatifs.
Onze participants ont signalé au moins une condition médicale sous-jacente, le surpoids et des antécédents de trouble du tabagisme étant les plus courants. Des informations sur les symptômes étaient disponibles pour 10 participants, dont 4 étaient asymptomatiques. Cependant, 3 de ces 4 participants avaient au moins un résultat de culture virale positif après la première RT-PCR positive. La durée médiane d’apparition des symptômes était de 7 jours. Parmi les participants ayant signalé des symptômes, 3 avaient des résultats de culture virale positifs et un test RT-PCR positif avant l’apparition des symptômes.
Par conséquent, l’étude actuelle a indiqué que les individus vaccinés et non vaccinés étaient capables de transmettre le SRAS-CoV-2. Les résultats de cette étude suggèrent que la transmission se produit tôt après l’infection et avant l’apparition des symptômes. Ils soulignent également la nécessité d’interventions non pharmaceutiques pour réduire la transmission du SRAS-CoV-2 dans les milieux à forte transmission. Des recherches supplémentaires sont nécessaires pour comprendre dans quelle mesure les personnes vaccinées infectées par le SRAS-CoV-2 peuvent être capables d’infecter d’autres personnes et de corréler l’excrétion virale avec la maladie chez les personnes non vaccinées et vaccinées.
Limites
Il y a certaines limites à l’étude. Premièrement, cette étude se limite aux infections causées par la variante Delta du virus, qui pourrait se comporter différemment des autres variantes. Deuxièmement, les individus vaccinés et non vaccinés n’ont pas été directement comparés. Une troisième limite de l’étude est qu’elle ne peut pas être généralisée à des contextes où les taux de vaccination sont faibles et les dynamiques de transmission différentes. Quatrièmement, la récupération du SRAS-CoV-2 dans une culture virale peut ne pas prédire la transmissibilité du SRAS-CoV-2. Enfin, les résultats positifs aux antigènes n’ont pas pu être corrélés avec l’infectiosité tout au long de la maladie.
