Une nouvelle recherche majeure publiée aujourd’hui identifie de nouvelles façons potentielles de traiter le type de cancer de l’intestin le plus courant en Irlande. L’étude menée par une équipe de recherche internationale dirigée par l’Université de médecine et des sciences de la santé RCSI et l’Institut de recherche sur le cancer de Londres fournit une feuille de route claire pour réutiliser les médicaments existants et en développer de nouveaux, afin de créer des traitements plus efficaces et personnalisés pour des milliers de patients qui disposent actuellement d’options limitées.
Sur les 2 500 nouveaux cas de cancer de l’intestin diagnostiqués chaque année en Irlande, le cancer colorectal microsatellite stable (MSS) représente 80 à 85 % d’entre eux, mais reste difficile à traiter, avec une réponse limitée à de nombreux traitements plus récents. Les essais combinant la chimiothérapie avec de nouveaux médicaments ciblés ou immunothérapies n’ont apporté que des améliorations modestes par rapport aux traitements standards actuels.
Aujourd’hui, les chercheurs ont découvert les vulnérabilités de ces tumeurs et identifié les combinaisons de médicaments, y compris des médicaments déjà approuvés pour traiter d’autres types de tumeurs. – qui pourrait être utilisé pour les cibler, conduisant ainsi à des traitements plus efficaces contre le cancer de l’intestin.
À l’aide d’échantillons de tumeurs de 2 000 patients, les chercheurs ont analysé les données génétiques, métaboliques et cliniques à l’aide d’outils d’intelligence artificielle (IA), révélant des façons jusqu’alors méconnues par lesquelles les cellules cancéreuses se divisent, se développent, s’adaptent et interagissent avec leur environnement.
Pour ce faire, l’équipe a développé une approche d’IA appelée iPhenMap, capable de créer une carte biologique de la tumeur. Grâce à cette carte, ils ont pu repérer des liens entre les différents éléments de la tumeur – tels que les caractéristiques génétiques et métaboliques – qui avaient été manqués dans les études précédentes qui examinaient les données de manière isolée.
Surtout, ils ont découvert des vulnérabilités jusqu’alors non identifiées dans les tumeurs. Ils ont ensuite testé ces vulnérabilités sur des modèles de laboratoire et ont montré que certaines combinaisons de médicaments pouvaient bien fonctionner pour les cibler et traiter le cancer.
Par exemple, le médicament ciblé trametinib – approuvé pour traiter divers cancers, notamment le mélanome, le cancer du poumon et le cancer de la thyroïde, avec une mutation spécifique – s’est avéré réduire considérablement la croissance tumorale et prolonger la survie dans les modèles de laboratoire lorsqu’il est associé à d’autres médicaments.
Les chercheurs espèrent que ces travaux accéléreront les tests cliniques de nouvelles stratégies de traitement du cancer de l’intestin, en utilisant des médicaments déjà développés et approuvés. En outre, l’équipe pense que son approche par l’IA pourrait être utilisée pour identifier des médicaments plus efficaces pour d’autres types de tumeurs.
La recherche publiée dans une revue leader en oncologie Cellule cancéreuse était dirigé conjointement par le professeur Annette Byrne, chef du groupe de médecine du cancer de précision du RCSI, département de physiologie et de physique médicale, et le professeur Anguraj Sadanandam, chef de groupe, groupe de médecine des systèmes et de précision du cancer, The Institute of Cancer Research, Londres. Le Dr Rodrigo Dienstmann, de l’Institut d’oncologie du Vall d’Hebron, Barcelone et de l’Université de Vic – Université centrale de Catalogne, était co-auteur principal de l’étude.
Les patients atteints d’un cancer colorectal métastatique mutant MSS RAS ont besoin de toute urgence de meilleures options de traitement, en particulier lorsque leur maladie ne répond plus au traitement standard.
Bien que ces résultats restent précliniques, ils mettent en évidence des opportunités thérapeutiques prometteuses et constituent une base solide pour un développement ultérieur. La prochaine étape consistera à identifier les caractéristiques biologiques qui prédisent la réponse et à déterminer comment ces approches peuvent être avancées en toute sécurité vers une évaluation clinique. »
Professeur Annette Byrne, chef du groupe de médecine du cancer de précision du RCSI
Le professeur Sadanandam a ajouté : « L’un des atouts majeurs de cette recherche réside dans l’ampleur et la diversité de l’ensemble de données, qui n’ont été possibles que grâce à la collaboration avec des partenaires européens. En rassemblant les données de patients de plusieurs pays et en intégrant des données sur l’ADN, l’ARN, épigénétiques, protéiques, métaboliques, unicellulaires et cliniques à cette échelle, nous avons pu exposer des liens entre la biologie des tumeurs et la dépendance thérapeutique qui autrement seraient manqués.
« L’IA et l’apprentissage automatique aideront de plus en plus les chercheurs en cancérologie à rassembler ces données complexes, non seulement pour classer les tumeurs, mais aussi pour comprendre comment elles se comportent, identifier leurs vulnérabilités et guider le développement et la réorientation des traitements, afin que les patients puissent vivre plus longtemps et en meilleure santé.
Veiller à ce que la voix des patients soit intégrée tout au long du projet et à ce que les résultats soient diffusés dans un format accessible était une priorité.
Cette recherche a été financée par le programme de recherche et d’innovation Horizon 2020 de l’Union européenne grâce à un financement accordé au projet COLOSSUS (www.colossusproject.eu) et par un prix de projet Research Ireland décerné au professeur Byrne. COLOSSUS, dirigé par le professeur Byrne, rassemble des universitaires, des cliniciens, des partenaires du secteur privé et des organisations à but non lucratif de premier plan européens et internationaux.
