L’étude génomique la plus complète de la syphilis à ce jour a cartographié la récente résurgence de la maladie dans le monde.
La transmission mondiale de la syphilis est généralisée, en particulier au cours des 20 dernières années, selon une étude publiée dans Microbiologie naturelle.
Des chercheurs de la London School of Hygiene & Tropical Medicine (LSHTM), du Wellcome Sanger Institute, de la UK Health Security Agency et de leurs collaborateurs ont cartographié la récente résurgence de la maladie dans le monde. Ils ont trouvé des échantillons de syphilis presque identiques dans 14 pays, la population mondiale de la syphilis étant composée de deux lignées, SS14 et Nichols.
Une analyse détaillée de ces lignées fournit des informations importantes sur la diversité génétique de la syphilis, avec des implications pour la conception de vaccins et la résistance aux antimicrobiens.
La syphilis est l’une des infections sexuellement transmissibles (IST) les plus courantes dans le monde, avec environ six millions d’infections chaque année. Causé par la bactérie Treponema pallidum, il est facilement traitable, bien que les symptômes puissent s’estomper avant qu’un individu se rende compte qu’ils sont infectés ou qu’ils peuvent ne pas apparaître du tout. Si elle n’est pas traitée, la syphilis peut causer de graves problèmes de santé à long terme.
Les infections à la syphilis survenant pendant la grossesse peuvent être transmises à l’enfant, provoquant la syphilis congénitale. Il s’agit de la deuxième cause de mortinatalité dans le monde et peut avoir de graves conséquences sur le développement des enfants menés à terme. Elle peut être prévenue par un dépistage et un traitement précoces pendant la grossesse. La syphilis congénitale est plus fréquente dans les pays ne disposant pas de tels programmes de dépistage.
Pour cette étude – financée par Wellcome – les chercheurs du LSHTM et du Wellcome Sanger Institute ont coordonné la collecte de 726 échantillons de syphilis provenant de 23 pays. Cela comprenait des zones bien échantillonnées telles que les États-Unis et l’Europe occidentale, ainsi que des régions mal échantillonnées telles que l’Asie centrale, l’Australie et l’Afrique.
Le Sanger Institute a séquencé le génome de chaque échantillon et effectué des analyses phylogénétiques et en grappes pour cartographier la population mondiale de la syphilis.
Étant donné que les modifications de l’ADN se produisent à un rythme connu et prévisible au fil du temps, les relations ancestrales entre les différentes séquences peuvent être établies. L’équipe a découvert que tous les échantillons provenaient de seulement deux lignées profondément ramifiées, Nichols et SS14. Les deux lignées circulent actuellement dans 12 des 23 pays échantillonnés, et des échantillons presque identiques étaient présents dans 14 de ces pays.
Les lignées dominantes de la syphilis qui infectaient les patients avant 1983 n’étaient pas les mêmes que celles qui infectaient les patients aujourd’hui. Notre analyse montre qu’un goulot d’étranglement de la population s’est produit à la fin des années 1990, ce qui indique un déclin important de la taille de la population de T. pallidum, probablement à cause de la crise du VIH/SIDA. Ce qui est inquiétant du point de vue de la santé publique, c’est que la présence d’échantillons presque identiques dans de nombreux pays suggère que la maladie se transmet régulièrement à l’échelle internationale. La syphilis est de retour et elle est mondiale. »
Dr Mathew Beale, premier auteur de l’étude du Wellcome Sanger Institute
L’incidence de la syphilis a diminué au cours des années 1980 et 1990, en partie en raison de pratiques sexuelles plus sûres à la suite de l’épidémie de VIH/SIDA. Mais au cours des dernières décennies, la syphilis a de nouveau augmenté, augmentant de plus de 300 % dans certains pays depuis 2010. La syphilis affecte de manière disproportionnée les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes (HSH) dans certains pays – par exemple, 90 % des cas de syphilis au Royaume-Uni en 2017 concernaient des HSH. .
Le Dr Helen Fifer, auteur principal de l’article de l’Agence britannique de sécurité sanitaire (UKHSA), a déclaré: « L’explosion des cas de syphilis au cours des dernières décennies est extrêmement préoccupante. Il s’agit d’une infection sexuellement transmissible qui peut facilement passer inaperçue, avec un grand proportion de cas diagnostiqués au stade latent chez les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes (HSH) au cours des dernières années. Une augmentation de la syphilis chez les hétérosexuels est également préoccupante en raison du risque de syphilis congénitale. Toute personne ayant des relations sexuelles avec des partenaires nouveaux ou occasionnels devrait utiliser un préservatif et se faire dépister – les IST peuvent avoir de graves conséquences sur la santé des individus et sur la santé de leurs partenaires sexuels actuels ou futurs. »
L’étude est une ressource précieuse pour comprendre la diversité génétique des T. pallidum cela aura des implications pour la conception des vaccins et la résistance aux médicaments. De nombreux échantillons séquencés étaient résistants aux macrolides, une classe d’antibiotiques utilisés pour traiter de nombreuses IST – bien qu’aucun n’ait montré de résistance au traitement le plus courant de la syphilis, la benzathine benzylpénicilline. Tout vaccin contre la syphilis devra être adapté aux lignées les plus courantes de T. pallidum actuellement en circulation.
Le professeur Nicholas Thomson, auteur principal de l’étude du LSHTM et du Wellcome Sanger Institute, a déclaré : « Cela a été un énorme effort logistique pour rassembler cette étude et nous n’aurions pas pu le faire sans nos collaborateurs internationaux. Nous voulions construire le terrain. de la génomique de la syphilis et ces données constituent une base solide pour de futures recherches. Combiné avec la capacité récente de culture T. pallidum dans le laboratoire, il y a maintenant une multitude d’activités dans ce domaine, ce qui est important car la syphilis devient rapidement un problème de santé publique urgent. »
