Des infections intestinales incurables au syndrome métabolique, du mélanome aux maladies inflammatoires chroniques de l’intestin, comme le syndrome du côlon irritable, en passant par le syndrome de Gilles de la Tourette : de nombreuses maladies peuvent potentiellement être guéries par la Transplantation de Microbiote Fécal (FMT), et des chercheurs de l’Université Catholique de Rome et l’Université de Trente ont montré que plus le niveau de prise de greffe des micro-organismes transplantés est élevé, plus les chances de succès de la thérapie sont grandes.
C’est le cœur de l’étude publiée dans la revue Médecine naturelle coordonné par Gianluca Ianiro, chercheur en maladies du système digestif à l’Université catholique et consultant de l’UOC de gastroentérologie à la Fondation polyclinique universitaire Agostino Gemelli » IRCCS et par le professeur Nicola Segata, professeur de génétique à l’Université de Trente et au Cibio Département de l’Université de Trente et de l’Institut européen d’oncologie de Milan, Italie.
« Transplantation de microbiote », Antonio Gasbarrini, professeur titulaire de médecine interne à l’Université catholique et directeur du département des sciences médicales et chirurgicales et des unités opératoires de médecine interne et de gastro-entérologie et du CEMAD-Centre des maladies digestives de la Fondation polyclinique universitaire Agostino Gemelli IRCCS explique, « est une nouvelle frontière thérapeutique qui englobe différents domaines de la médecine, pas seulement la gastro-entérologie, mais même, par exemple, l’oncologie, (on a vu que l’efficacité de certaines thérapies contre le cancer est influencée par le microbiote). plus clair que le microbiote intestinal – l’ensemble des micro-organismes qui vivent en symbiose dans notre intestin en remplissant tant de fonctions en plus de la fonction digestive – est important pour la santé humaine et a un rôle crucial à la fois pour le tube digestif, le système immunitaire, et même (via la connexion intestin-cerveau opérée par le nerf vague) pour le système nerveux, avec des répercussions possibles sur les maladies complexes s comme la sclérose en plaques et l’autisme. »
La transplantation se fait en isolant et en purifiant le microbiote donneur prélevé dans les matières fécales et en le transférant par diverses voies (en gélules ou lors d’une coloscopie) au patient donneur. Ce qui n’est pas vraiment clair de cette procédure thérapeutique, c’est la façon dont les micro-organismes transplantés se greffent dans l’intestin du patient receveur.
Les experts ont analysé avec des techniques sophistiquées de séquençage génomique et d’analyse informatique un total de plus de 1 300 échantillons de microbiote intestinal (prélevés à partir de matières fécales) de donneurs et de patients receveurs atteints de huit maladies différentes (C. difficile, infections à bactéries intestinales multirésistantes, syndrome métabolique , mélanome, maladie intestinale inflammatoire chronique, syndrome du côlon irritable, diarrhée due à la chimiothérapie, syndrome de Gilles de la Tourette).
« Grâce à la capacité de l’analyse basée sur des techniques de séquençage génomique », explique Segata, « à identifier les différentes souches bactériennes présentes dans le microbiote, qui ont un schéma spécifique pour chaque personne, nous avons pu comprendre si une souche particulière était transmise du donateur au receveur ».
« Nous avons vu », explique Ianiro, « que les patients avec des niveaux plus élevés de prise de greffe de microbiote obtiennent une meilleure réponse clinique ; également que la prise de greffe est plus importante chez les patients atteints de maladies infectieuses (qui ont un déséquilibre du microbiote moins sévère – dysbiose) que chez ceux atteints de maladies chroniques. maladies (qui ont une dysbiose plus complexe et radicale). »
« Nous avons également constaté », ajoute Ianiro, « que les patients traités par antibiothérapie avant la procédure de greffe avaient une prise de greffe plus élevée, et que la perfusion du microbiote via plusieurs voies d’administration (par exemple, des capsules avec une coloscopie) favorisait la prise de greffe. C’était aussi ont constaté que certaines espèces microbiennes (en particulier les protéobactéries et les actinobactéries) se greffent mieux que d’autres (par exemple, le phylum Firmicutes).
Enfin, « nous avons montré qu’en utilisant l’intelligence artificielle, nous pouvions prédire avec une précision pertinente la composition du microbiote du donneur après la transplantation, et cela pourrait alors conduire à identifier les meilleurs donneurs dont les fèces réussissent le mieux à augmenter la diversité du microbiote (ce qui est un paramètre de la santé du microbiote) post-transplantation fécale », soulignent Ianiro et Segata.
« Cette étude est le fruit d’une collaboration fructueuse et d’années d’études de notre groupe de recherche sur la transplantation du microbiote intestinal. C’est grâce à ces avancées dans les connaissances sur les conditions qui maximisent le succès de la transplantation », a déclaré Giovanni Cammarota, professeur agrégé en gastroentérologie à l’Université catholique et directeur de l’UOC de gastroentérologie de la Fondation polyclinique universitaire Agostino Gemelli IRCCS explique, « que nous pourrons de plus en plus exploiter la procédure dans la pratique clinique pour le traitement de nombreuses maladies.
« C’est pourquoi », conclut Ianiro, « nous avons récemment obtenu une subvention pour poursuivre, avec le groupe de Trento et Milan et notre unité d’oncologie médicale, un essai randomisé et contrôlé visant à évaluer si la transplantation fécale réussit à améliorer la réponse thérapeutique aux immunothérapies (la dernière frontière des médicaments oncologiques) chez les patients atteints d’un cancer du rein avancé.Dès d’autres cancers, comme le mélanome, il existe des preuves initiales et prometteuses sur le lien entre le microbiote et le succès de l’immunothérapie, conclut le professeur Cammarota.
