Des chercheurs de l'Université Emory et du département de santé publique de Géorgie ont montré que la transmission de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) dans l'État de Géorgie au début de cette année changeait avec le temps et variait selon l'âge.
Peter Teunis (Université Emory) et ses collègues ont constaté qu'entre février et juillet, l'intervalle en série (temps entre les cas successifs) pour l'apparition des symptômes s'est raccourci d'environ 1,5 jour et que la principale contribution à la transmission s'est déplacée d'un groupe plus âgé (40 à 70 ans). ) à un plus jeune (20 à 50 ans).
Les chercheurs rapportent également que l'ordre des abris sur place (où les gens sont invités à rester à l'intérieur) n'était pas suffisant pour empêcher la transmission dans les zones urbaines reliées par les principales liaisons de transport.
L'équipe conseille également que l'étude des modèles de transmission locale peut aider à guider les États dans la prévention et le contrôle du COVID-19, selon la population et la région.
Une version pré-imprimée du papier est disponible sur le serveur medRxiv *, tandis que l'article fait l'objet d'un examen par les pairs.
Sommaire
La montée rapide des cas confirmés de COVID-19 et des décès
Depuis que les premiers cas de COVID-19 ont été identifiés à Wuhan, en Chine, à la fin de l'année dernière, l'agent causal du syndrome respiratoire aigu sévère coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) s'est rapidement propagé à travers le monde et est devenu une menace urgente pour la santé publique mondiale .
Au 27 octobre 2020, les États-Unis avaient le plus grand nombre de cas confirmés de COVID-19 (8773407) et de décès (226604) au monde, et l'État de Géorgie comptait 353372 cas confirmés et 7844 décès.
Le 14 marse, le nombre de cas confirmés en Géorgie était de 1 712, et le gouvernement a déclaré une urgence de santé publique. Les grands rassemblements ont été interdits le 24 marse, et une commande d'abri sur place a été annoncée le 3 avrilrd. Le 24 avrile, La Géorgie a été le premier État à autoriser la réouverture de certaines entreprises et, le 30 avrile, l'ordre d'abri sur place avait été levé.
Le 1 juinst, le gouvernement a assoupli les limites de la taille des rassemblements publics, a autorisé la réouverture des bars et des boîtes de nuit, la reprise des événements sportifs et les écoles et camps d'été pour commencer les sessions.
Modèles spatiaux de transmission du COVID-19. (a) date d'atteinte du pic (maximum local de Rt) pour la première vague. (b) distribution spatiale des cinq catégories de modèles de transmission du COVID-19 en Géorgie d'ici le 15 juin 2020. Les lignes noires représentent les autoroutes interétatiques.
Le nombre de nouvelles infections a continué d'augmenter en Géorgie
Alors que le nombre de nouvelles infections continuait d'augmenter en Géorgie et dans d'autres États en juin et juillet, il est devenu important de comprendre l'impact de l'ordre des abris sur place et des événements de réouverture sur la transmission du COVID-19 dans différentes régions.
Cependant, lorsque Teunis a recherché dans PubMed des articles publiés avant le 11 octobree, 2020, ils ont constaté que, bien que quelques études aient estimé l'intervalle en série, aucune étude n'avait examiné l'intervalle en série variant dans le temps. De même, peu d'études avaient examiné les modèles de transmission entre des groupes aux caractéristiques différentes, et aucune étude n'avait examiné le nombre de reproduction variant dans le temps pour COVID-19 ou l'impact de l'ordre de mise à l'abri sur place au niveau du comté partout aux États-Unis.
En quoi consistait l'étude actuelle?
L'équipe a examiné les caractéristiques de la transmission du COVID-19 en Géorgie en estimant les intervalles de série et le nombre de reproduction à un moment donné (Rt) à l'aide de données épidémiologiques basées sur des rapports de cas confirmés du Département de la santé publique de Géorgie.
Entre le 1er févrierst et 13 juillete, les chercheurs ont identifié un grand nombre de cas liés (4 080 paires de transmission (infectieux et infectés)) et ont estimé la distribution de l'intervalle en série pour les symptômes du COVID-19.
En utilisant la distribution d'intervalle en série, les chercheurs pourraient alors estimer le Rt. En examinant Rts au fil du temps, ils ont pu étudier la distribution spatiale de la transmission dans les 159 comtés de Géorgie et l'impact de l'ordre des abris sur place et des événements de réouverture progressive.
Distributions des dates estimées du premier maximum, du minimum et du deuxième maximum en Rt pour 87 comtés avec 200 cas cumulés au 13 juillet 2020, et des événements clés pouvant entraîner la transmission du COVID-19.
La transmission variait selon la région et changeait au fil du temps et du groupe d'âge
La transmission du COVID-19 en Géorgie avait varié selon la région et changé au fil du temps entre février et juillet.
La transmission était plus importante dans les comtés situés autour des grandes villes et le long des principales autoroutes. L'intervalle en série est passé de 5,97 jours en février-avril à 4,40 jours en juin-juillet.
Les modèles de transmission au fil du temps ont également changé selon le groupe d'âge. Le COVID-19 s'est principalement propagé des adultes à tous les groupes d'âge, mais la principale contribution à la transmission est passée des personnes âgées de 40 à 70 ans en février-avril à celles âgées de 20 à 50 ans en juin-juillet.
«Les jeunes adultes (20 à 50 ans) étaient impliqués dans la majorité des transmissions survenant pendant ou après la réouverture après la période d'abri sur place», écrivent les chercheurs.
L'équipe a également constaté que si l'ordonnance de mise en place d'un abri mis en œuvre pendant trois à quatre semaines a ralenti la transmission, elle était insuffisante pour empêcher la transmission vers les comtés urbains et périurbains reliés par les principales liaisons de transport.
Quelles sont les implications de l'étude?
«La contraction des intervalles de série et l'augmentation de la propagation par la jeune génération montrent que la transmission du COVID-19 au niveau du comté change au fil du temps», disent Teunis et ses collègues.
«Les modèles spatio-temporels de transmission au niveau des comtés fournissent en outre des preuves importantes pour guider les mesures efficaces de prévention et de contrôle du COVID-19 (par exemple, des abris sur place) dans différentes zones», conseille l'équipe.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique / les comportements liés à la santé ou traités comme des informations établies.
