Alors que le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2), le virus qui cause la maladie du coronavirus (COVID-19), se propage dans le monde, de nouvelles variantes émergentes posent des menaces pour la santé de nombreux pays.
L’émergence de variantes avec des mutations spécifiques d’épitopes clés dans la protéine de pointe du SRAS-CoV-2 soulève des inquiétudes sur les efforts de vaccination et l’utilisation d’anticorps monoclonaux.
Des chercheurs de l’University College London et du University College London Hospitals NHS Foundation Trust ont cherché à décrire l’émergence de la variante préoccupante B.1.1.7 (COV), y compris les caractéristiques virales et la gravité clinique.
L’étude, publiée dans The Lancet, démontre qu’il n’y a aucune preuve d’un lien entre la maladie grave et la mort et la lignée lorsque l’on compare la lignée B.1.1.7 et d’autres variantes.
La lignée B.1.1.7
La lignée B.1.1.7, également appelée 20I / 501Y.V1, variante concernée 20DEC-01, ou variante britannique, a été signalée pour la première fois en décembre 2020 au Royaume-Uni.
La lignée B.1.1.7 porte une mutation dans la protéine S (N501Y) qui affecte le domaine de liaison au récepteur (RBD). Le variant a 13 autres mutations définissant la lignée, dont beaucoup se trouvent dans la protéine S. Celles-ci incluent une suppression aux positions 69 et 70, qui a évolué spontanément dans d’autres variantes de SARS-CoV-2.
L’effet des changements structurels sur les propriétés de la protéine de pointe a suscité des inquiétudes concernant la transmissibilité, la pathogénicité et l’effet de la variante sur l’efficacité du vaccin. À Londres, des restrictions de distanciation physique ont été réimposées le 21 décembre 2020 pour atténuer la propagation de cette nouvelle variante.
Caractéristiques génomiques et résultats cliniques
Pour mieux comprendre comment le variant B.1.1.7 se propage et ses effets sur la population humaine, les chercheurs ont étudié les caractéristiques génomiques et les résultats cliniques liés à l’infection B.1.1.7 chez les patients admis à l’hôpital.
Ils ont également évalué s’il y avait une différence dans la charge virale, par proxy des valeurs de seuil de cycle de PCR (Ct) et des profondeurs de lecture du séquençage du génome entier, entre les patients atteints de l’infection B.1.1.7 et ceux infectés par des lignées circulantes antérieures.
Pour arriver aux résultats de l’étude, les chercheurs ont collecté des échantillons positifs pour le SRAS-CoV-2 sur la réaction en chaîne par polymérase (PCR) à partir du 9 novembre 2020, auprès de patients admis dans l’un des deux hôpitaux le 20 décembre 2020 ou avant. Londres, Royaume-Uni Ces échantillons ont été séquencés pour détecter la présence des mutations.
L’équipe a étudié le lien entre la lignée B.1.1.7 et une maladie grave ou la mort dans les 28 jours suivant un test positif. D’autres analyses génomiques ont été effectuées dans un groupe de patients excréteurs chroniques et un groupe de patients traités par remdesivir. L’équipe a ensuite comparé la charge virale par proxy, en utilisant les valeurs de seuil du cycle de PCR et en utilisant des profondeurs de lecture de séquençage.
Les résultats de l’étude ont révélé que sur les 341 patients avec des échantillons positifs pour le SRAS-CoV-2. Parmi ceux-ci, 58 pour cent avaient une infection B.1.1.7 tandis que 42 pour cent avaient une infection non-B.1.1.7.
L’équipe n’a trouvé aucun lien entre la maladie grave et la mort et les lignées en comparant la lignée B.1.1.7 et d’autres lignées circulantes. En outre, ils n’ont détecté aucune mutation B.1.1.7 définissant les COV chez 123 patients immunodéprimés chroniquement excrétés ou 32 patients traités par remdesivir.
Pendant ce temps, ils ont trouvé une charge virale par procuration plus élevée dans les échantillons B.1.1.7 que dans les échantillons non B.1.1.7. En termes d’âge, l’infection B.1.1.7 est plus fréquente chez les personnes plus jeunes, ce qui donne un signe de maladie plus grave chez les patients avec la variante sont admis à l’hôpital plus souvent, par rapport aux patients d’autres lignées.
Les enquêteurs de l’étude ont encouragé la collecte rapide de données cliniques sur la qualité des aliments, parallèlement au séquençage du génome entier du SRAS-CoV-2. Celles-ci sont impératives pour décider si les variantes sont associées à des résultats cliniques modifiés.
Les données et l’étude de la capacité de neutralisation des sérums de personnes atteintes du COVID-19 ou de celles ayant reçu un vaccin sont essentielles dans la réponse de santé publique et la gestion du COVID-19.
«Nos données, dans le contexte et les limites d’une étude du monde réel, fournissent l’assurance initiale que la gravité chez les patients hospitalisés atteints de B.1.1.7 n’est pas nettement différente de la gravité chez ceux qui n’en ont pas, et cette étude fournit un modèle pour répondre à la même chose. question à nouveau alors que nous entrons dans une ère de variantes émergentes », ont conclu les chercheurs dans l’étude.
À ce jour, le Royaume-Uni a enregistré plus de 4,39 millions d’infections et plus de 127 000 décès. Dans le monde, plus de 137 millions de personnes ont été infectées par le SRAS-CoV-2, tandis que plus de 2,95 millions sont décédées.
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