Bruker Corporation a annoncé aujourd'hui de nouvelles avancées pour permettre Protéomique fonctionnelle 2.0 flux de travail sur le TimsOmni™ spectromètre de masse pour permettre aux chercheurs en maladies d'aller au-delà des listes canoniques de protéines vers des protéoformes biologiquement ou pathologiquement fonctionnelles et des variantes peptidiques résolues par PTM. Nouveautés dans Bruker ProteoScape™, OmniScape™et GlycoScape™ le logiciel prend désormais en charge la découverte PTM indépendante des bases de données, la caractérisation fiable des protéoformes et la glycoprotéomique compatible eXd pour des informations plus approfondies sur la biologie, les maladies et la découverte de médicaments.
De même, le désormais activé TimsOmni les méthodes protéoformes profondes sont tout aussi puissantes pour interroger les cibles de médicaments, ainsi que les produits biologiques, y compris les anticorps thérapeutiques, les ADC, les multispécifiques, ainsi que leurs distributions PTM et leur glyco-hétérogénéité.
Caractérisation fiable des protéoformes et glycoprotéomique compatible eXd sur TimsOmni
La dernière version OmniScape™ 2026b renforce TimsOmni flux de travail protéoformes en intégrant le roman OmniWave™ algorithme, qui permet le séquençage descendant et l'identification des protéoformes à grande échelle avec une annotation de haute confiance des PTM critiques qui pilotent la signalisation des maladies. Les chercheurs peuvent désormais aller au-delà des lectures de groupes de protéines pour s'intéresser à des mécanismes centrés sur les protéoformes, par exemple en distinguant les variantes protéiques pertinentes de signalisation qui indiquent des états pathologiques ou une réponse au traitement. Dans la recherche en biothérapeutique, OmniScape prend en charge la vérification des séquences attendues et des modifications non canoniques et peut signaler les variantes de séquence ou l'hétérogénéité qui peuvent affecter les effets secondaires ou l'efficacité.
Bruker améliore considérablement la glycoprotéomique en prenant en charge les données de dissociation basée sur les électrons piégés (eXd) dans GlycoScape logiciel, permettant une caractérisation fiable des glycopeptides tout en préservant les structures fragiles des glycanes et en prenant en charge les informations de localisation et de topologie. GlycoScape fournit également une visualisation interactive des ions fragments eXd dans des spectres MS/MS annotés pour simplifier la validation des résultats.
« Le timsOmni donne aux scientifiques accès à une fragmentation compatible eXd qui peut résoudre des PTM et des protéoformes complexes avec une fidélité exceptionnelle » a déclaré le professeur Yehia Mechref, directeur du Texas Tech University Center for Biotechnology & Genomics. « Les nouvelles capacités logicielles – en particulier l’analyse eXd N-glycopeptide et les flux de travail descendants améliorés – soutiennent une compréhension plus approfondie de la biologie des maladies et ouvrent de nouvelles voies pour la découverte de cibles et la recherche translationnelle.
Bruker ProteoScape™ ajoute l'IA améliorée de novo séquençage peptidique pour des découvertes indépendantes des bases de données en métaprotéomique et immunopeptidomique
Bruker présente un nouveau de novo flux de travail de séquençage peptidique dans Bruker ProteoScape v2026b logiciel qui associe un modèle de notation amélioré par l'IA – formé sur plus de sept millions de spectres MS/MS – avec une base de programmation dynamique éprouvée pour fournir des résultats précis de novo séquences à partir de données timsTOF haute résolution. Cela soutient la demande de protéomique indépendante des bases de données, permettant la découverte de variantes peptidiques dans des échantillons complexes dans des applications telles que la métaprotéomique et l'immunopeptidomique, y compris la recherche sur les néoantigènes en immuno-oncologie.
Les chercheurs étudient de plus en plus les systèmes biologiques dans lesquels les bases de données de référence ne permettent pas à elles seules de capturer la véritable diversité moléculaire,
Notre collaboration avec Bruker a permis Novor.AI tirer parti des ensembles de données timsTOF volumineux et de haute qualité et les combiner avec notre modèle d'IA pour offrir la vitesse, la confiance et la précision nécessaires à la prochaine génération de novo applications de séquençage de peptides.
Bin Ma, fondateur, Rapid Novor Inc.
