Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur, une équipe de chercheurs a évalué les performances des échantillons cliniques auto-prélevés par les patients infectés par le virus monkeypox (MPXV) par rapport aux échantillons cliniques prélevés par un médecin, y compris les lésions cutanées, les écouvillons pharyngés et rectaux dans les tests de diagnostic.
Sommaire
Arrière plan
L’auto-échantillonnage s’est avéré être une stratégie fiable pour diagnostiquer les maladies sexuellement transmissibles (MST), telles que la chlamydia et la gonorrhée, sur la base des tests d’amplification des acides nucléiques et récemment de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19). Cependant, cette approche n’a pas encore été testée et validée pour le diagnostic de Monkeypox.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont effectué une évaluation de la précision diagnostique de l’auto-échantillonnage dans les paramètres MPXV. Ils ont recruté des personnes de trois centres en Espagne qui présentaient des lésions indiquant une infection au MPXV dans les dix jours précédant le dépistage de l’étude. Un dermatologue ou un spécialiste des MST a évalué cliniquement ces patients et a inscrit dans l’étude ceux qui étaient suspectés d’avoir une infection au MPXV.
Tous les participants à l’étude ont reçu un kit de test à domicile avec des instructions, y compris des écouvillons à pointe de dacron pour le prélèvement d’échantillons, des conteneurs d’écouvillons pré-étiquetés et une enveloppe postale. L’équipe a formé ces personnes à l’auto-collecte d’échantillons et leur a demandé d’auto-collecter des écouvillons des lésions cutanées, de l’oropharynx et du rectum le jour 1 de l’étude.
Les participants ont stocké les échantillons auto-prélevés à 4 °C après le prélèvement et ont contacté le service de messagerie, qui a transféré ces échantillons à un laboratoire de microbiologie en Espagne pour des tests de diagnostic.
Les chercheurs ont analysé des écouvillons à l’aide d’une réaction en chaîne par polymérase quantitative (qPCR), et tous les patients ayant des échantillons positifs prélevés par un médecin au jour 0 ont été inclus dans les analyses de l’étude. Tous ces participants avaient confirmé une infection au MPXV.
Résultats de l’étude
Au total, l’étude a recruté 50 patients suspects d’infection par le MPXV. Tous les patients étaient de sexe masculin, avec un âge moyen de 33,5 ans. Ils avaient une infection MPXV confirmée par qPCR dans au moins un des échantillons de diagnostic auto-prélevés. Au départ, le nombre de lésions cutanées et de prélèvements pharyngés et rectaux était de 49, 38 et 11, respectivement. Tous les écouvillons de lésions cutanées auto-prélevés étaient positifs pour l’ADN du MPXV. Cependant, seulement 68 % et 82 % des prélèvements oropharyngés et rectaux étaient positifs pour l’ADN du MPXV.
Les chercheurs ont noté la concordance globale la plus élevée de 98 % dans les prélèvements de lésions cutanées. Étonnamment, un seul individu a été testé négatif dans l’écouvillon de lésion cutanée prélevé par le médecin et positif dans l’échantillon d’écouvillonnage de lésion cutanée auto-prélevé. De même, la concordance globale pour les échantillons de gorge et rectaux était de 79 % et 90 %, avec des valeurs de kappa de 0,49 et 0,6, respectivement.
De plus, les chercheurs n’ont noté aucune différence significative dans le seuil de cycle (CJ) valeurs entre les échantillons de lésions cutanées et de gorge prélevés par le médecin et ceux auto-prélevés. À l’inverse, les écouvillons rectaux auto-prélevés avaient un C plus élevéJ valeurs que les échantillons recueillis par les médecins, avec une différence absolue de 5,5 ; et un intervalle de confiance (IC) à 95 %. Le C moyenJ les valeurs des écouvillons prélevés par le médecin et auto-prélevés étaient de 22,5 et 23,2, respectivement, avec une différence absolue de 0,7 ; et un IC à 95 %.
conclusion
Selon les auteurs, il s’agit de la première étude à démontrer la faisabilité de l’approche d’auto-échantillonnage pour le diagnostic du MPXV. Dans l’ensemble, les écouvillons auto-prélevés avaient une précision élevée et des charges virales comparables aux écouvillons prélevés par les médecins. Les écouvillons cutanés prélevés par les patients ne sont généralement pas utilisés pour diagnostiquer les maladies cutanées courantes accompagnées de cloques, telles que l’herpès ou la varicelle. Cependant, ces écouvillons prélevés par des patients sur des lésions cutanées présentaient des caractéristiques de haute performance comparables à celles des écouvillons prélevés par des médecins.
La concordance globale entre les écouvillonnages oropharyngés prélevés par le médecin et les auto-prélevés était plus faible que pour les autres échantillons, probablement en raison de la variation de la qualité de l’échantillon. Cependant, des fluctuations de la charge virale dans le pharynx sont également possibles.
Pour résumer, l’approche d’auto-échantillonnage explorée dans la présente étude offrait de nombreux avantages significatifs pour les patients et le contrôle de la maladie. Il a facilité l’intégration du monkeypox dans les tests de routine avec d’autres MST dans les populations à haut risque. Les études futures devraient optimiser la collecte d’échantillons et inclure davantage d’échantillons, tels que la salive, pour accentuer la facilité des tests de diagnostic.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
