Une étude génétique internationale utilisant des biobanques multi-ascendantes a identifié de nouvelles localisations génétiques associées au glaucome primitif à angle ouvert (GPAO), le type de glaucome le plus courant et la principale cause de cécité irréversible dans le monde. Les résultats, publiés le 20 février dans Rapports cellulaires Médecinedétaillent les locus génétiques spécifiques à l’ascendance et au sexe associés au GPAO et impliquent les gènes vasculaires et liés au cancer dans le risque de GPAO.
Bien que des progrès significatifs aient été réalisés grâce aux études d’association pangénomique (GWAS) pour explorer la physiopathologie génétique du glaucome chez l’homme, il existe encore un manque de compréhension des mécanismes pathogéniques sous-jacents et des mécanismes génétiques qui pourraient expliquer les différences de prévalence, d’aspects cliniques. présentation et résultats du GPAO selon les ethnies et le sexe.
Jibril Hirbo, PhD, professeur adjoint de recherche en médecine à la Division de médecine génétique du centre médical de l’Université Vanderbilt et auteur correspondant de la nouvelle étude
Plus de 3 millions d’Américains souffrent de glaucome, selon les Centers for Disease Control and Prevention. Les membres de certains groupes raciaux et ethniques courent un risque plus élevé de développer une maladie oculaire : elle est six fois plus fréquente chez les Noirs américains que chez les Blancs. D’autres facteurs de risque de glaucome comprennent une pression élevée à l’intérieur de l’œil, le fait d’avoir plus de 60 ans, des antécédents familiaux de la maladie et le diabète ou l’hypertension artérielle.
Dans le cadre d’une collaboration impliquant des institutions du monde entier, les chercheurs ont réalisé une méta-analyse des données de 15 biobanques faisant partie de la Global Biobank Meta-analysis Initiative (GBMI), un réseau de biobanques de quatre continents représentant plus de 2,2 millions d’individus. ascendances diverses. BioVU, la biobanque d’ADN de Vanderbilt liée aux dossiers de santé électroniques anonymisés, fait partie du réseau GBMI.
Dans la méta-analyse, ils ont identifié 62 locus à risque génétique, dont six nouveaux. Les chercheurs ont ensuite fusionné leur analyse avec le GWAS multi-ascendant précédemment publié et ont utilisé « des méthodes statistiques sophistiquées pour identifier des acteurs moléculaires uniques à travers les ancêtres », a déclaré Hirbo.
« L’ensemble de données combiné représente l’étude GPAO la plus vaste et la plus diversifiée à ce jour, avec près de 1,5 million d’individus et 46 235 cas GPAO », a-t-il ajouté.
Dans l’ensemble, l’étude a identifié 17 nouveaux locus génétiques associés au GPAO, dont cinq étaient spécifiques à certaines ascendances.
Pour identifier les rôles fonctionnels des variantes associées au GPAO et des tissus médiateurs des effets génétiques, les chercheurs ont utilisé des données d’expression génotype-tissu accessibles au public et ont réalisé des études d’enrichissement génique. Celles-ci, ainsi que les études d’association côté transcriptome, ont impliqué des gènes vasculaires et cancéreux dans le risque de GPAO, ont noté les chercheurs. En particulier, 20 % des gènes associés étaient liés aux cils primaires, une structure située à la surface de nombreuses cellules vertébrées impliquée dans la prolifération cellulaire et la signalisation.
« L’étude des mécanismes qui influencent la fonctionnalité des cils primaires contribuera à comprendre le rôle de cette structure dans la pathogenèse du glaucome et indiquera de nouvelles cibles et stratégies thérapeutiques », a déclaré Hirbo.
Bien que l’analyse ait identifié de grands locus spécifiques à l’ascendance et au sexe associés au GPAO, Hirbo a noté que les sujets représentés par les biobanques GBMI sont toujours majoritairement d’ascendance européenne. Les enquêteurs cherchent à élargir les participants représentés par les biobanques internationales.
« Le recrutement de cohortes incluant des minorités ethniques améliorera le transfert des connaissances et l’équité en matière de santé, non seulement pour la recherche sur le glaucome, mais aussi entre les disciplines », a déclaré Hirbo.
La co-auteure et ophtalmologiste Karen Joos, MD, PhD, s’est émerveillée de voir comment une simple conversation lors d’un événement en 2015 s’est transformée en une vaste étude internationale sur le glaucome.
« Cela a été gratifiant de faire partie de cet effort depuis la première réunion de réflexion exploratoire à Vanderbilt et d’être témoin de la croissance incroyable du projet grâce aux efforts de Jibril au sein du consortium mondial de biobanques examinant le glaucome », ont déclaré Joos, Joseph N. et Barbara H. Ellis Family. Professeur d’ophtalmologie et chef du service de glaucome au Vanderbilt Eye Institute. « Je m’attends à ce que les découvertes continuent à se développer à l’avenir, à mesure que d’autres biobanques diverses seront formées et rejoindront le consortium, et que davantage d’échantillons seront séquencés dans toutes les biobanques. Une véritable collaboration mondiale pour l’une des plus grandes maladies cécitantes au monde est en cours. »
Les chercheurs de Vanderbilt qui se sont joints à Hirbo et Joos dans le cadre de l’étude comprenaient Nancy Cox, PhD, Eric Gamazon, PhD, Peter Straub, MS, Ran Tao, PhD, et Xue Zhong, PhD, du Vanderbilt Genetics Institute et Milam Brantley Jr., MD, PhD. , du Vanderbilt Eye Institute. La recherche a été financée par des subventions des National Institutes of Health (P50MD017347, U01HG011720, R35HG010718, R01HG011138, R01GM140287, R56AG068026), des fonds de recherche de la famille Joseph Ellis et de William Black et de la recherche pour prévenir la cécité.
