Les épidémies de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) sont fréquentes dans les établissements de santé tels que les hôpitaux et les maisons de retraite, car la distanciation physique est difficile à atteindre malgré toutes les mesures de prévention et de contrôle des infections qui sont mises en œuvre dans ces établissements. La détection précoce des cas permet d’isoler les individus et de mieux prévenir les transmissions secondaires, bien que les cas pré- ou asymptomatiques qui peuvent encore être transmis entre les travailleurs de la santé et les patients doivent également être pris en compte.
Dans un article récemment publié dans la revue Contrôle des infections et épidémiologie hospitalière, les chercheurs étudient la dynamique des infections à coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) dans une salle d’hôpital gériatrique par séquençage du génome entier. Ici, les chercheurs constatent que la transmission secondaire considérable se produit entre les patients et les travailleurs de la santé.
Étude : Détails inattendus concernant la transmission nosocomiale révélés par le séquençage du génome entier du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère. Crédit d’image : tele52/Shutterstock.com
Preuve de transmission nosocomiale
Les personnes testées positives pour le SRAS-CoV-2 par RT-PCR (réaction en chaîne par polymérase transcriptase inverse) d’échantillons nasopharyngés prélevés dans une salle d’hôpital de 30 lits en Suède sur une période d’un mois ont été incluses dans l’étude. Au total, cela comprenait 32 patients et 15 travailleurs de la santé.
L’âge médian des patients était de 84 ans, dont environ la moitié étaient des hommes. Il est important de noter que 44% des patients sont décédés au cours de l’étude, tous ayant une charge virale significativement plus élevée que ceux qui ont survécu. Les auteurs notent que bon nombre de ces personnes avaient subi des fractures de la hanche, qui ont donc été signalées comme une comorbidité majeure pour COVID-19.
Un séquençage du génome entier a ensuite été effectué sur les échantillons, ce qui a révélé que les cas dans le service étaient représentés par trois clades distincts de 20A, B et C, les cas connus pour avoir été acquis pendant le séjour à l’hôpital étant plus génétiquement similaires.
Le service qui abritait les patients a été séparé en 8 chambres, et le groupe a suivi chaque cas d’épidémie par proximité. Tous les patients infectés par le SRAS-CoV-2 clade-20A1 partageaient les chambres A ou C, tandis que les clade-20A2 et 20C étaient limités aux chambres E et H, respectivement. Le clade-20B était le plus répandu, présent partout sauf dans la salle C, et était également le plus souvent trouvé parmi les travailleurs de la santé, suivi du clade 20A1 et A2.
Les auteurs suggèrent que cela représente quatre introductions distinctes du virus dans le service, les clades 20A1, A2, B et C, dont les trois premiers ont ensuite subi une transmission secondaire à au moins un autre individu.
Suivi des introductions du SRAS-CoV-2
Le premier et unique cas de clade 20C a été détecté chez un patient quatre jours après son admission, bien pendant la période présymptomatique de COVID-19, et a donc probablement été obtenu à la suite d’une transmission communautaire. Ce patient est sorti le lendemain et ne semble pas avoir transmis le virus à un autre patient ou professionnel de la santé pendant cette période.
Clade 20A1 peut avoir été introduit dans le service par un patient, car d’autres patients partageant la chambre A ont rapidement été diagnostiqués avec la même souche. Environ une semaine plus tard, les résidents de la chambre C ont été infectés, suggérant ainsi une transmission intermédiaire par un agent de santé.
Le clade 20A2 a été détecté pour la première fois chez un travailleur de la santé et plus tard chez un seul patient, suggérant également une transmission secondaire à un patient. Le clade le plus courant, B, a été détecté chez deux patients qui ont été physiquement séparés au début de l’étude. Ainsi, ces patients ont également probablement contracté l’infection d’un professionnel de la santé avant qu’une transmission secondaire généralisée à d’autres patients ne se produise.
Dans l’ensemble, les chercheurs de la présente étude indiquent qu’il existe un fort soutien pour les infections nosocomiales, tant de la part des travailleurs de la santé que d’autres patients, survenant chez 78% des patients. Parmi ceux-ci, six sont considérés comme étant de patient à patient; cependant, la majorité peut encore provenir de travailleurs de la santé.
Les auteurs soulignent qu’il est souvent difficile de déterminer la direction de la transmission étant donné le nombre élevé de cas asymptomatiques susceptibles de se produire, d’autant plus que des informations cliniques détaillées n’étaient pas disponibles pour les travailleurs de la santé dans cette étude.
Bien que les travailleurs de la santé impliqués dans cette étude aient utilisé un équipement de protection approprié et se soient engagés dans des mesures de prévention et de contrôle des infections, le taux d’adhésion n’est pas connu. Il est donc difficile d’évaluer leur efficacité dans la prévention de la transmission secondaire.
Des tests réguliers qui peuvent identifier le COVID-19 infectieux avant que les symptômes ne se manifestent sont probablement la méthode la plus efficace pour prévenir les infections nosocomiales, car ils permettent aux individus d’être mis en quarantaine avant que des épidémies ne surviennent.
