Effet des variantes émergentes du SRAS-CoV-2 et du statut vaccinal sur les taux de transmission de la COVID-19

Dans une étude récente publiée dans le medRxiv* serveur de préimpression, une équipe de chercheurs a déterminé l’impact des variantes préoccupantes (COV) du coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) du syndrome respiratoire aigu sévère émergent et du statut vaccinal sur la dynamique de transmission du SRAS-CoV-2. L’étude a conclu que la vaccination contre la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) réduisait la sensibilité à l’infection et les taux de transmission des patients infectés.

Fond

Les chercheurs de l’étude actuelle avaient publié une précédente revue systématique et méta-analyse en juin 2021 qui faisait état d’un taux d’attaque secondaire (SAR) de 18,9 % des ménages du SRAS-CoV-2.

Les COV émergents du SARS-CoV-2 tels que les variantes Alpha, Beta, Delta, Omicron et Gamma et l’amélioration des taux de vaccination ont influencé les taux de transmission du SARS-CoV-2. La variante Delta est devenue la variante prédominante du SRAS-CoV-2 dans la plupart des pays, et la variante Omicron est plus infectieuse que Delta en raison de sa région protéique de pointe (S) fortement mutée.

Plusieurs essais contrôlés randomisés et études observationnelles à grande échelle ont démontré l’efficacité du vaccin contre le SRAS-CoV-2 (VE) contre les maladies symptomatiques et les décès associés au COVID-19. Bien que les études sur l’EV des ménages complètent les résultats des essais sur l’EV, l’EV dans la réduction de la sensibilité et de l’infectiosité du SRAS-CoV-2 au sein du ménage compte tenu d’un contact étroit prolongé entre les cas index et les membres du ménage dans le contexte des nouveaux COV du SRAS-CoV-2 reste incertain.

L’étude

Dans la présente revue systématique et méta-analyse, les chercheurs ont effectué des recherches dans PubMed du 18 juin 2021 au 7 janvier 2022 pour évaluer l’effet des COV du SRAS-CoV-2 et le cas index ou le statut de vaccination des contacts sur les SAR des ménages en utilisant 1 291 contacts familiaux études de traçage. La recherche a suivi les lignes directrices PRISMA (Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-analyses).

Dans les méta-analyses, les estimations du DAS dans les ménages et l’intervalle de confiance (IC) à 95 % ont été obtenus à l’aide de modèles mixtes linéaires généralisés, désagrégés selon plusieurs covariables, notamment la variante, le type de vaccin et le statut vaccinal du cas index et du contact familial.

EV basé sur la probabilité de transmission de l’infectiosité (EV_Je,P), susceptibilité (VE_S,P) et l’efficacité totale du vaccin (EV_T,P) ont été estimés par les DAS.

Résultats

Les résultats ont indiqué que les cas index entièrement vaccinés présentaient une transmission aux contacts familiaux plus faible que les cas index non vaccinés, tandis que les taux de transmission des cas index partiellement vaccinés n’étaient pas significativement différents des cas index non vaccinés.

Un total de 27 études avec des points médians en 2021 avaient un DAS des ménages de 35,8 %. Les variantes Alpha, Beta et Delta avaient un SAR ménage de 38%, 22,5% et 30,8%, respectivement. Le SAR pour Alpha/Delta n’était pas significativement différent d’Alpha/Delta. En revanche, les SAR pour Alpha étaient sensiblement plus élevés que Beta, et les SAR pour Delta et Alpha étaient plus élevés que la variante originale de type sauvage.

Le (VE_Je,P), (VE_S,P), et (VE_T,P) pour les cas index entièrement vaccinés étaient respectivement de 56,6 %, 70,3 % et 86,8 %, et pour les cas index partiellement vaccinés de 27,5 %, 32 43,9 % et 59,9 %, respectivement.

Le DAS moyen global estimé pour les cas index non vaccinés, partiellement vaccinés et entièrement vaccinés par rapport aux contacts familiaux était de 26,6 %, 16,2 % et 14,4 %, respectivement. Le DAS moyen global estimé des ménages pour les contacts familiaux non vaccinés, partiellement vaccinés et entièrement vaccinés était de 33,8 %, 23,7 % et 14,1 %, respectivement, quel que soit le statut vaccinal du cas index.

Les DAS moyens estimés de deux études avec des cas index entièrement vaccinés et non vaccinés avec le BNT162b2 étaient de 8,3 % et 35,9 %, respectivement, quel que soit le statut vaccinal des contacts familiaux.

Aucune différence significative n’a été signalée dans les DAS pour les contacts familiaux entièrement vaccinés avec les vaccins Ad26.COV2.S, BNT162b2, ARNm-1273 et ChAdOx1-S ou partiellement vaccinés avec les vaccins ChAdOx1-S, BNT162b2 et ARNm-1273.

conclusion

L’étude a conclu que les cas index COVID-19 entièrement vaccinés avaient un SAR domestique de SRAS-CoV-2 inférieur à celui des cas index non vaccinés. Par rapport aux contacts familiaux non vaccinés, les contacts familiaux entièrement et partiellement vaccinés avaient une sensibilité plus faible à l’infection par le SRAS-CoV-2.

Les contacts familiaux exposés aux variantes SARS-CoV-2 Delta et Alpha présentaient un risque d’infection considérablement plus élevé que la variante originale de type sauvage. Les DAS des ménages pour la présente étude (35,8 %) étaient plus élevés que l’étude précédente (15,7 %) menée par les chercheurs, ce qui indique que le ménage est resté un lieu majeur de transmission du COVID-19. Les mesures de santé publique, notamment l’augmentation des tests, la distanciation sociale, l’isolement, l’amélioration de la ventilation et l’hygiène des mains, peuvent aider à prévenir la transmission de la COVID-19.

La présente étude (VE_Je,P) les estimations se situaient dans la fourchette d’une étude de modélisation basée sur les données des ménages menée en Israël avant la généralisation de la variante Delta. Les résultats de l’étude justifient la prudence car des variantes plus virulentes et transmissibles que la variante Omicron peuvent également émerger à l’avenir.

Dans l’ensemble, l’étude met l’accent sur la réduction associée à la vaccination des taux d’infection par le SRAS-CoV-2 et de transmission domestique.

*Avis important

medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.