Etude de la station de ski Ischgl

Le premier cas d’épidémie de syndrome respiratoire aigu sévère coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) en Autriche a été observé dans la station de ski d’Ischgl début mars 2020. Plus tard, le virus s’est propagé à travers l’Autriche et d’autres pays d’Europe du Nord.

Les chercheurs ont mené une étude transversale pour évaluer la séroprévalence du SRAS-CoV-2 dans la population, telle que mesurée dans le sérum sanguin. Ils ont constaté que la séroprévalence dans la population adulte était passée à 45% à la fin du mois d’avril.

Par la suite, les chercheurs ont cherché à répondre à quelques questions importantes, à savoir combien de temps dure l’immunité et quel a été l’effet de cette immunité accrue sur la transmission du virus. À cette fin, une étude de suivi (Ischgl – 2) a été menée au cours de la première semaine de novembre 2020.

Un nouveau document de recherche publié sur le medRxiv * preprint server documente les résultats de cette étude de suivi. Les chercheurs documentent que les réponses des lymphocytes T et des anticorps pouvaient encore être observées chez la plupart des individus, six mois et demi après la première étude et près de huit mois après la première vague à Ischgl. Ils ont également constaté que le nombre de nouveaux cas de COVID-19 signalés de mai à décembre était très faible.

En ce qui concerne la taille de l’échantillon, l’étude originale comprenait 1 473 personnes, dont 214 enfants. Dans l’étude de suivi, seulement 801 individus du groupe d’origine ont pu être inclus. Certaines personnes ont dû être exclues en raison d’un âge irrégulier, d’un manque de questionnaire ou d’un manque d’échantillons de sang. Au total, 91 nouvelles personnes ont participé à l’étude de suivi, dont 12 enfants. Akismed, un système eCRF basé sur le Web, a contribué à l’exercice de collecte de données.

Faible incidence des nouvelles infections à Ischgl par rapport aux villages à faible prévalence. (a) La ligne continue verticale représente le deuxième verrouillage national à l’automne 2020, qui a eu lieu le 17 novembre (un premier verrouillage plus léger a eu lieu le 2 novembre). Les communes de contrôle sont Eben am Achensee, Ellmau, Fiss, Gerlos, Lermoos, Leutasch, Mayrhofen, Nauders, Neustift im Stubaital, Seefeld in Tirol, Serfaus, Sölden et Tux. (b) La figure affiche les résultats de l’équation de régression (1). Les coefficients tracés représentent la différence hebdomadaire de la moyenne mobile sur 7 jours des nouveaux cas entre Ischgl et les communes témoins par rapport à la période de référence (2ème semaine de septembre). Le coefficient pour chaque semaine est indiqué avec un intervalle de confiance à 95%. La ligne continue verticale montre le deuxième verrouillage (strict) en Autriche.

La méthodologie impliquait l’analyse du plasma EDTA en utilisant quatre immunoessais. ImmunomatTM, un instrument de paillasse à 4 plaques entièrement automatisé, a été utilisé pour cribler les échantillons sanguins pour la positivité de la protéine anti-SARS-CoV-2-S1 Immunoglobuline A (IgA) et Immunoglobuline G (IgG) en utilisant l’anti-SARS-CoV-2- ELISA IgA et –IgG, respectivement.

Le seuil pour considérer les échantillons comme positifs a été fixé à 1,1 et l’interprétation de ces résultats par rapport aux valeurs de densité optique obtenues a été guidée par les informations fournies par le fabricant.

Les valeurs comprises entre 0,8 et 1,1 dans le test IgG ELISA ont été considérées comme positives et ces valeurs limites ont été considérées comme négatives pour le test IgA ELISA. Les chercheurs ont également testé chaque échantillon pour les IgG anti-SARS-CoV-2-N-protéine (anti-N IgG) avec le dosage immunologique Abbott SARS-CoV-2. L’IgG anti-N a été considérée comme positive pour les valeurs d’unité de lumière relative (RLU) supérieures à 1,4.

Une quantification supplémentaire de l’IgG anti-N a été réalisée à l’aide de l’ElecsysAnti-SARS-CoV-2, développé par Roche Diagnostics. Le test Roche fournit un indice de coupure où les valeurs supérieures à 1,0 sont considérées comme positives.

Enfin, un test d’anticorps neutralisants a également été utilisé pour déterminer les titres d’anticorps neutralisants du SARS-CoV-2 en utilisant le virus de la stomatite vésiculaire (VSV) pseudotypé avec la protéine de pointe du SARS-CoV-2.

Les étapes suivantes consistaient à définir la séroprévalence et le statut sérologique des échantillons, à déterminer l’avidité de l’anti-S igG spécifique au SARS-CoV-2 et à analyser les réponses des cellules T spécifiques au SRAS-CoV-2.

Des données supplémentaires sur la démographie étaient nécessaires. Les moyennes, médianes, écarts types et intervalles interquartiles ont été calculés pour les variables continues.

Pour les variables catégorielles, des nombres (pourcentages) ont été calculés. La séroprévalence transversale a été calculée en novembre pour l’ensemble de l’échantillon.

Pour les personnes dont les données étaient disponibles à la fois pour les études de base et de suivi, la séroprévalence a été calculée. Cela a conclu la phase de collecte de données, à la suite de laquelle les chercheurs ont effectué une analyse statistique à l’aide de STATA 16.1 et GraphPad Prism version 8.2.0 et 9.

Certaines des techniques statistiques utilisées par les chercheurs étaient l’ANOVA, les méthodes non paramétriques (test U de Mann-Whitney, test de Kruskal-Wallis), test t de Student pour échantillons appariés, test de rang signé de Wilcoxon, analyse de régression, etc.

Les chercheurs ont découvert que les taux d’anticorps diminuaient au cours des 7 à 8 premiers mois après l’infection. Cependant, la capacité de liaison des anticorps augmentée et / ou les réponses des lymphocytes T pouvaient encore être détectées chez tous les individus sauf un.

La question ouverte est de savoir combien de temps l’immunité dure-t-elle pour le SRAS-CoV-2? Le SRAS-Cov-2 provoque une infection systémique plus grave que les autres coronavirus humains responsables du rhume. Dans ce dernier cas, on sait que l’immunité dure 1 à 2 ans mais, dans ce cas, l’immunité pourrait durer plus longtemps.

Cette idée est soutenue par des études antérieures qui documentent que la réponse immunitaire au SRAS-CoV-1 reste détectable pendant plus de 17 ans.

La conclusion de cette étude selon laquelle l’immunité peut durer au moins huit mois est conforme au fait que les réinfections sont rares dans le monde (zéro à Ischgl).

Les chercheurs ont également documenté que l’incidence du SRAS-CoV-2 à Ischgl était significativement inférieure à celle d’autres municipalités comparables en Autriche lors de la deuxième vague en novembre.

Les résultats suggèrent qu’un niveau de séropositivité de 40 à 45% peut être suffisant pour arrêter la propagation du virus avec certaines mesures de distanciation sociale en place.

*Avis important

medRxiv * publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique / les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.