Évaluation de l’étendue de la propagation communautaire causée par les variantes du SRAS-CoV-2 dérivées du vison

Est-il possible pour les humains d’être infectés par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) à partir d’animaux et de transmettre ensuite le virus à d’autres ? Une étude récente publiée dans L’innovation ont évalué la possibilité de transmission communautaire causée par une variante du SRAS-CoV-2 provenant d’un animal.

La pandémie de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) a dévasté l’économie mondiale en infectant plus de 178 millions de personnes à ce jour et en provoquant la mort de près de 3,9 millions de personnes dans le monde. Alors que le virus se propage rapidement et est hautement infectieux chez les humains, il est également signalé qu’il infecte naturellement plusieurs autres espèces telles que les chats, les tigres et les visons.

Étude: Évaluer l’étendue de la propagation communautaire causée par les variantes du SRAS-CoV-2 dérivées du vison. Crédit d’image : Kateryna Kon/Shutterstock.com

La transmission du SARS-CoV-2 entre les animaux et les humains

Des études antérieures ont signalé la transmission du SRAS-CoV-2 d’homme à animal et ont discuté de la possibilité que les animaux transmettent le virus à l’homme. Ceci est remarquable, car la réplication du SRAS-CoV-2 chez les animaux peut permettre l’apparition de diverses mutations. Par exemple, plusieurs mutations du SRAS-CoV-2 adaptées au vison ont été identifiées, notamment Y453F, F486L et N501T.

« Étant donné que la transmission interspécifique s’est produite et que le SRAS-CoV-2 peut être retransmis aux humains à partir de visons, il est important de préciser si le SRAS-CoV-2 « de retour à l’homme » avec des mutations en cours adaptées au vison pourrait en outre conduire à une transmission entre humains.

Pour évaluer l’étendue de la transmission interhumaine causée par les variantes du SRAS-CoV-2 dérivées du vison, les chercheurs ont utilisé des séquences génomiques du SRAS-CoV-2 accessibles au public et une analyse phylogénétique combinée avec une inférence bayésienne sous un modèle épidémiologique. Ils ont calculé la probabilité de transmission directe entre humains infectés par des variantes du SRAS-CoV-2 dérivées du vison.

Confirmation de la transmission « retour à l’homme » du SRAS-CoV-2

Parmi les individus au Danemark et aux Pays-Bas, les chercheurs ont découvert qu’au moins 12,5% de toutes les personnes infectées par des variantes dominantes du SRAS-CoV-2 dérivées du vison étaient causées par une transmission interhumaine. Cette découverte indiquait une variante du SRAS-CoV-2 « de retour à l’homme » qui a déjà provoqué une transmission interhumaine.

«Nous avons utilisé des séquences génomiques du SRAS-CoV-2 accessibles au public d’humains et de visons collectées au Danemark et aux Pays-Bas, et avons combiné une analyse phylogénétique avec une inférence bayésienne dans le cadre d’un modèle épidémiologique pour retracer la possibilité de transmission de personne à personne.»

Étant donné que les génomes du SRAS-CoV-2 dérivés du vison les plus dominés appartenaient à B.1.298 et B.1.8 pour le Danemark et les Pays-Bas, les chercheurs n’ont utilisé que les génomes du SRAS-CoV-2 dérivés de l’homme et du vison de ces 2 lignées. pour le Danemark et les Pays-Bas.

Les chercheurs ont signalé que le type phylogénétique des souches dominantes dans différents pays n’était pas cohérent, indiquant ainsi que les événements de transmission inter-espèces du SRAS-CoV-2 de l’homme au vison n’étaient pas spécifiques à la lignée.

« Plusieurs événements de transmission inter-espèces indépendants ont été identifiés dans cette étude, qui contenait à la fois une direction d’humain à vison et de vison à humain. »

Sur la base de leurs observations, les chercheurs ont conclu qu’il y avait au moins trois événements de transmission directe identifiés au Danemark et aux Pays-Bas, qui représentaient au moins 12,5% de toutes les personnes infectées par des variantes du SRAS-CoV-2 dérivées du vison dans cette étude. Cependant, ils ont souligné plusieurs raisons pour lesquelles ils considéraient que cette observation de l’étendue de la transmission interhumaine causée par les variantes du SRAS-CoV-2 dérivées du vison était sous-estimée. Le débordement qui se produit entre les humains et les visons pourrait également être augmenté par d’autres animaux en contact avec les humains.

Perspectives d’avenir

La fourrure de vison est principalement produite par le Danemark, les Pays-Bas, la Pologne et la Chine, l’industrie mondiale de l’élevage du vison ayant une valeur nette de plusieurs milliards d’euros. Malgré sa taille, la pandémie de COVID-19 a gravement affecté cette industrie, en particulier lorsque des dizaines de millions de visons ont été abattus dans le cadre d’efforts visant à atténuer la transmission du SRAS-CoV-2, à prévenir d’autres mutations et à l’émergence du SRAS dérivé du vison. Variantes CoV-2.

Crédit d’image : Daniel Bruce Lacy/Shutterstock.com

Les chercheurs du courant ont souligné la nécessité de surveiller les variantes du SRAS-CoV-2 dérivées du vison et peut-être d’autres sources animales « de retour à l’homme ». Il est crucial de mettre en œuvre des mesures de contrôle adaptées pour éviter la transmission communautaire à grande échelle causée par le passage du virus entre les animaux et les humains.

Ces efforts minimiseront l’impact du SRAS-CoV-2 sur l’industrie de l’élevage, car une mortalité accrue a été détectée chez les visons d’élevage positifs à l’ARN du SRAS-CoV-229. La mise en œuvre de changements efficaces réduira également la probabilité de générer des mutants nouveaux et imprévisibles du SRAS-CoV-2 chez les animaux.