Un nouveau document de recherche a été publié dans Oncoscience (Volume 10) le 10 novembre 2023, intitulé « Une évaluation immunoinformatique de l’antigène du cancer des testicules, DDX53, en tant qu’antigène potentiel du cancer de l’œsophage précoce ».
Les lymphocytes T ont été impliqués dans la facilitation d’un microenvironnement pro-inflammatoire et pro-tumorigène qui aggrave le pronostic du carcinome de l’œsophage (ESCA). Dans leur nouvelle étude, les chercheurs Peter Cheng, Konrad J. Cios, Mallika Varkhedi, Vayda R. Barker, Michelle Yeagley, Andrea Chobrutskiy, Boris I. Chobrutskiy, et Georges Blanck de l’Université de Floride du Sud, de l’Oregon Health and Science University Hospital et du H. Lee Moffitt Cancer Center and Research Institute ont identifié les séquences d’acides aminés résidentes dans la tumeur, la complémentarité du récepteur des lymphocytes T (TCR) déterminant la région 3 (CDR3) et ont utilisé un algorithme particulièrement adapté au contexte du Big Data pour évaluer les complémentarités chimiques entre le TCR CDR3 et l’antigène des testicules du cancer (CTA).
« Pour mieux comprendre les impacts positifs et négatifs potentiels des lymphocytes T dans ESCA, nous avons récupéré les lectures de recombinaison TCR à partir des fichiers de séquence d’exome entière (WXS) TCGA-ESCA, obtenu les séquences TCR CDR3 AA et évalué la complémentarité chimique de ces séquences. avec les CTA, car ces antigènes ont été caractérisés par de nombreuses approches au fil des décennies comme antigènes candidats au cancer.
La complémentarité chimique des ESCA TCR CDR3 et de l’antigène testiculaire cancéreux DDX53 représentait une distinction de survie sans maladie (DFS), dans laquelle le groupe de complémentarité du cinquantième percentile supérieur était en corrélation avec une DFS plus mauvaise. Le groupe de complémentarité TCR CDR3-DDX53 élevée représentait également une plus grande proportion d’échantillons de tumeurs dépourvus d’expression de DDX53. Ces données et analyses soulèvent la question de savoir si l’évaluation de la complémentarité chimique TCR CDR3-DDX53 a détecté ou non une réponse immunitaire ESCA sélectionnant les cellules DDX53 négatives.
« Dans l’ensemble, ces données concordent avec la possibilité que l’interaction TCR-antigène induise une pression sélective entraînant une perte d’antigène, un processus appelé immuno-édition, et, éventuellement, une évasion des cellules tumorales d’une réponse immunitaire antitumorale. Ces données pour ESCA sont également cohérents avec des données similaires obtenues pour un CS élevé et une faible survie dans le cadre du cancer de l’ovaire.
