Annonce d’une nouvelle publication d’articles pour Journal des innovations et applications cardiovasculaires. Dans cette étude, les auteurs identifient les gènes de ferroptose associés à la cuproptose dans le microréseau d’athérosclérose de la base de données Gene Expression Omnibus (GEO) et explorent l’infiltration immunitaire médiée par les gènes hub dans l’athérosclérose.
L’infiltration immunitaire joue un rôle crucial dans le développement de l’athérosclérose. La ferroptose est un mode de mort cellulaire causé par l’accumulation fer-dépendante de peroxydes lipidiques. La cuproptose est un type de mort cellulaire programmée récemment découvert. Aucune étude antérieure n’a examiné le mécanisme de régulation du gène de la ferroptose associée à la cuproptose dans l’infiltration immunitaire dans l’athérosclérose.
Le microréseau de gènes d’athérosclérose qualifié a été recherché dans la base de données GEO, intégré aux gènes de ferroptose et de cuproptose, et calculé avec les coefficients de corrélation. Les auteurs ont ensuite obtenu la matrice génique de la ferroptose associée à la cuproptose et criblé les gènes exprimés de manière différentielle. Par la suite, ils ont effectué des analyses d’enrichissement de Gene Ontology et Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes et une analyse de réseau d’interaction protéine-protéine de gènes exprimés de manière différentielle. Les auteurs ont également criblé les gènes hub selon l’algorithme du coefficient de corrélation de Matthews (MCC). Les auteurs ont effectué une analyse d’enrichissement des gènes hub pour explorer leurs fonctions et prédire les microARN associés (P <0,05). Les auteurs ont également utilisé l'algorithme d'analyse d'enrichissement d'ensemble de gènes à échantillon unique (ssGSEA) pour analyser les relations entre les gènes hub et l'infiltration immunitaire, et ont utilisé des gènes hub associés au système immunitaire pour construire un modèle de risque. Enfin, les auteurs ont utilisé les résultats de la prédiction des médicaments et la technologie d'amarrage moléculaire pour explorer les médicaments thérapeutiques potentiels ciblant les gènes pivots.
Soixante-dix-huit gènes de ferroptose associés à la cuproptose se sont révélés être impliqués dans la réponse cellulaire au stress oxydatif et chimique et être enrichis dans de multiples voies, notamment la ferroptose, le métabolisme du glutathion et l’athérosclérose. Dix gènes hub ont été identifiés avec l’algorithme MCC ; selon l’algorithme ssGSEA, ces gènes étaient étroitement associés à l’infiltration immunitaire, indiquant ainsi que les gènes de ferroptose associés à la cuproptose peuvent participer à l’athérosclérose en médiant l’infiltration immunitaire. La courbe caractéristique de fonctionnement du récepteur a indiqué que le modèle avait une bonne capacité à prédire le risque d’athérosclérose. Les résultats de la prédiction des médicaments (P <0,001 ajusté) et de l'amarrage moléculaire ont montré que le glutathion pourrait être un médicament thérapeutique potentiel ciblant les gènes hub.
La conclusion était que les gènes de ferroptose associés à la cuproptose sont associés à une infiltration immunitaire dans l’athérosclérose.
