L’épidémie rapide de coronavirus-2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) a provoqué la pandémie actuelle de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19). Les scientifiques ont suggéré que ce virus aurait pu circuler dans les populations de chauves-souris pendant des décennies avant de se propager aux humains. À ce jour, ce virus a infecté plus de 233 millions de personnes et fait plus de 4,77 millions de morts.
Le SRAS-CoV-2 a été signalé pour la première fois en 2019 à Wuhan, en Chine. Depuis lors, il a été découvert que ce virus infectait les animaux de compagnie tels que les chiens, les chats, les furets et les visons. Les chercheurs ont également diagnostiqué une infection au SRAS-CoV-2 chez des couguars sauvages, des léopards des neiges, des pumas, des lions et des tigres. Un taux de mortalité élevé a été signalé dans les élevages de visons aux Pays-Bas, au Canada, en Grèce, en Lettonie, en France, au Danemark, aux États-Unis et en Suède. Les scientifiques craignent également que les mustélidés, une famille de mammifères carnivores, notamment les belettes, les blaireaux, les loutres, les furets, les martres, les visons et les carcajous, entre autres, puissent devenir des réservoirs du SRAS-CoV-2.
Une nouvelle étude publiée sur le medRxiv* Le serveur de préimpression présente un instrument d’enquête standardisé pour évaluer les facteurs de risque associés à la transmission zoonotique bidirectionnelle du SRAS-CoV-2 et des agents pathogènes. L’instrument est particulièrement axé sur les environnements où les humains et les animaux partagent un contact étroit.
Sommaire
Enquête sur les interactions homme-animal COVID-19 (CHAIS)
Le groupe de travail COVID-19 sur les interactions homme-animal (CHAI-WG) a été créé pour développer l’enquête COVID-19 sur les interactions homme-animal (CHAIS). L’objectif principal de CHAIS est de caractériser les interactions homme-animal et de comprendre les facteurs de risque liés à la transmission zoonotique bidirectionnelle du CoV-2 et d’autres agents pathogènes zoonotiques dans des environnements où les humains et les animaux sont en contact étroit.
CHAIS mesure quatre grands domaines de risque de transmission, à savoir le risque et l’intensité de l’infection chez les humains, les caractéristiques spatiales des espaces partagés, les interactions homme-animal et la susceptibilité des animaux à l’infection, et la probabilité de propagation ultérieure.
Interfaces communes pour les interactions homme-animal associées à la transmission zoonotique inverse des agents pathogènes respiratoires
L’instrument CHAIS devrait améliorer notre compréhension de l’exposition et de la transmission des agents pathogènes, fournir une base pour les modèles prédictifs et fournir une base de données probantes pour l’orientation de la santé publique. L’instrument comprend deux versions – une version étendue (E-CHAIS) détaillant les interactions homme-animal et une version abrégée (ACHAIS) comprenant des questions de base portant sur les facteurs de risque zoonotiques et zoonotiques inverses.
CHAIS est assez polyvalent en ce sens qu’il permet aux chercheurs d’apporter des modifications mineures aux questions en fonction de leurs études sur des populations, une temporalité, une diversité culturelle, etc. citer l’instrument CHAIS comme source.
L’instrument CHAIS peut être mis en œuvre dans un large éventail de projets de recherche. Dans les études qui n’incluent pas un échantillonnage simultané d’humains ou d’animaux, l’instrument peut être administré comme une enquête épidémiologique pour recueillir des données auprès des membres de la communauté.
Ces données pourraient concerner les interactions homme-animal pendant la pandémie actuelle ou lors d’autres épidémies zoonotiques. CHAIS peut également être utilisé dans des études de surveillance et de recherche qui comportent la collecte d’échantillons d’animaux ou d’humains et d’animaux. Dans ces contextes, l’instrument peut contextualiser les résultats d’études qui incluent des tests viraux et/ou d’anticorps.
Il existe des études où les échantillons sont uniquement prélevés sur des animaux et dans ces études, l’instrument CHAIS peut mettre en évidence des facteurs associés à l’exposition de l’animal. CHAIS peut également être utilisé dans des études avec des tests appariés humains-animaux. Il peut aider à mesurer les facteurs de risque liés à la transmission zoonotique et zoonotique inverse.
CHAIS est un instrument standard pour d’autres agents pathogènes zoonotiques (outre le SARS-CoV-2). Il existe des différences pathologiques importantes entre le CoV-2 et d’autres agents pathogènes zoonotiques. Cependant, indépendamment de ces différences, l’instrument est capable de mesurer les risques de transmission qui ont une large applicabilité épidémiologique. Cela pourrait fournir des données cruciales sur les voies de transmission uniques de ces agents pathogènes.
Limites de CHAIS
Il y a quelques limitations associées à l’instrument CHAIS. CHAIS seul n’est pas capable de servir d’évaluation robuste de l’environnement bâti et de ses effets sur la propagation des agents pathogènes. Par exemple, les chercheurs pourraient vouloir inclure des questions liées aux systèmes de ventilation, à la plomberie sanitaire, etc. CHAIS est également limité dans la mesure dans laquelle il capture des informations sur la faune et les interactions entre la faune et les humains. Il est également limité lorsqu’il se concentre sur la transmission du CoV-2 pendant les périodes où d’autres agents pathogènes saisonniers sont actifs. Enfin, étant donné le large éventail d’applications de CHAIS, des biais dans les rapports parmi certaines populations peuvent se produire, et les chercheurs doivent tenir compte de ces biais lors de la conception d’études de recherche, y compris l’instrument CHAIS.
Conclusion
L’instrument CHAIS est un outil standardisé pour analyser les risques associés à la transmission d’agents pathogènes dans les environnements où les humains et les animaux sont en contact étroit. Il a une large applicabilité et importance en raison des lacunes dans les facteurs comportementaux, spatio-temporels et biologiques sous-jacents à la transmission homme-animal.
Les auteurs de cette étude ont encouragé les chercheurs à utiliser cette ressource et à fournir des commentaires afin que le questionnaire puisse être adapté en fonction des preuves disponibles. Ils ont également exhorté les chercheurs à fournir des données pour une méta-analyse entre les études afin que nous puissions approfondir notre compréhension des divers facteurs pouvant conduire à une exposition zoonotique et zoonotique inverse et à la transmission d’agents pathogènes.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ou traités comme des informations établies.
