Dans une récente étude publiée dans la revue Forum ouvert sur les maladies infectieuses, les chercheurs ont effectué une analyse de type série chronologique interrompue pour évaluer l’incidence des infections invasives à streptocoques du groupe A (iSGA) chez les enfants, avec les facteurs de risque associés, les caractéristiques moléculaires et cliniques, avant et après la pandémie de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19).
Étude: Augmentation inattendue des infections invasives à streptocoques du groupe A chez les enfants à la suite d’une épidémie de virus respiratoires en France : une analyse de séries chronologiques sur 15 ans. Crédit d’image : Prrrettty / Shutterstock.com
Sommaire
Arrière-plan
Infections par Streptococcus pyogènes, un type d’iSGA, peut entraîner des maladies telles que la bactériémie, les infections ostéoarticulaires ou des tissus mous, le syndrome de choc toxique (SCT) et l’empyème pleural. Ces infections ont touché des millions de personnes dans le monde, en particulier de jeunes enfants, nombre de ces infections étant graves et entraînant des effets indésirables, y compris la mort.
Les co-infections par le virus varicelle-zona (VZV) et l’utilisation d’anti-inflammatoires non stéroïdiens (AINS) augmentent le risque d’infections pédiatriques invasives à SGA. De plus, des études récentes ont rapporté une association entre les infections virales respiratoires et l’iSGA.
Une incidence remarquablement élevée d’infections iGAS, en particulier chez les enfants, a été signalée vers la fin de 2022. Cependant, l’étendue de ces infections et leurs caractéristiques bactériennes et cliniques par rapport à la période précédant la COVID-19 ne sont pas claires.
À propos de l’étude
Dans la présente étude non randomisée, monocentrique et rétrospective, les chercheurs évaluent les changements dans l’incidence des infections iGAS associées à la pandémie de COVID-19.
L’étude comprenait des enfants de moins de 18 ans qui ont été hospitalisés à l’hôpital de soins tertiaires de l’Université Robert Debré en France en raison d’infections iSGA entre le 1er janvier 2008 et le 31 décembre 2022. Les infections ont été détectées par réaction en chaîne par polymérase (PCR) ou culture chez les patients atteints de streptocoque-TSS (S-TSS) ou de fasciite nécrosante, selon le groupe de travail américain sur les infections de type sévère causées par Streptocoques.
Des données cliniques, biologiques et démographiques ont été obtenues auprès des participants. Les données moléculaires et microbiologiques ont été obtenues du laboratoire de microbiologie de l’hôpital.
L’équipe a réalisé Emm (gène de la protéine M), évalué les profils des gènes de virulence pour le SGA et déterminé les taux d’infections invasives à SGA parmi 1 000 enfants hospitalisés sur la base des hospitalisations pédiatriques. De plus, le nombre d’organismes pathogènes respiratoires, qui ont été détectés par PCR multiplexée nasopharyngée chez les enfants hospitalisés en raison de symptômes respiratoires aigus entre le 1er janvier 2019 et le 30 décembre 2022, a été documenté.
Les infections respiratoires comprenaient celles causées par le virus respiratoire syncytial (VRS), l’adénovirus, le virus de la grippe, le parainfluenza, le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) et le métapneumovirus. Les périodes d’étude comprenaient la période d’intervention non pharmaceutique (NPI) pré-COVID-19-associée entre janvier 2008 et mars 2020, la période NPI entre avril 2020 et avril 2021 et la période de relaxation NPI entre mai 2021 et décembre 2022. L’équipe a effectué une modélisation de régression de type quasi-Poisson et calculé les rapports de cotes (OR).
Résultats
Au total, 135 hospitalisations pédiatriques associées à une infection à SGA ont été signalées parmi les participants à l’étude, avec un âge moyen de trois ans. Au cours de la période pré-NPI, le taux trimestriel d’infections invasives à SGA pour 1 000 hospitalisations était stable. Cependant, la mise en œuvre du NPI en mars 2020 a considérablement réduit le taux trimestriel d’infections iSGA pour 1 000 hospitalisations avec un OR de 0,3.
L’assouplissement post-NPI, une augmentation notable du taux trimestriel d’infections à SGA pour 1 000 hospitalisations, en particulier entre octobre et décembre 2022, a été observé (OR 6,8). Le pic des infections à SGA entre octobre et décembre 2022 a été observé de manière concomitante à une augmentation de la circulation des virus respiratoires, notamment de la grippe.
Au cours des trois derniers mois, 60% ont été testés positifs pour les virus respiratoires par écouvillonnage viral nasopharyngé-PCR, passant à 100% pour l’empyème de la cavité pleurale. Au cours de la période pré-NPI, les principales présentations cliniques comprenaient les infections ostéoarticulaires (39 %), le SCT/bactériémie (33 %), l’empyème de la cavité pleurale (15 %) et les infections cutanées (6 %). Un changement a été observé dans les principales manifestations cliniques au cours de la dernière période d’étude, probablement associé à un pourcentage accru d’empyème de la cavité pleurale de 15 % à 33 %.
L’intensité du syndrome inflammatoire et les résultats indésirables, qui comprenaient les admissions et les décès en unité de soins intensifs pédiatriques (USIP), étaient comparables entre les trois périodes d’étude. Relaxation post-NPI, il n’y avait pas d’association entre les infections à iGAS et les infections à VZV.
La distribution du génotype de la protéine M était comparable entre les périodes d’étude. Le génotypage de la protéine M et le profil des gènes de virulence ont indiqué qu’aucun clone principal n’a émergé lors de l’augmentation des infections iGAS.
conclusion
Les résultats de l’étude ont montré une augmentation remarquable des infections iGAS depuis octobre 2022, impliquant principalement un empyème pleural, co-occurrent avec une épidémie de virus respiratoire. Par conséquent, les médecins doivent être conscients du risque élevé d’infections pédiatriques à l’iSGA, en particulier dans les milieux où la circulation des virus respiratoires est intense.
L’augmentation des infections iGAS était associée à divers types de gènes de protéines M, avec une distribution identique à celle de la période pré-COVID-19. Il n’y a eu aucun cas d’iSGA lié à des infections antérieures ou concomitantes par le virus varicelle-zona en 2022 ; cependant, il existe probablement une association entre l’iSGA et le taux d’infections à l’iSGA et d’agents pathogènes respiratoires, en particulier le virus de la grippe.
D’autres recherches, y compris des essais contrôlés randomisés, doivent être menées, évaluant la sensibilité pédiatrique à l’iSGA et le séquençage du génome entier (WGS) des souches d’iSGA.
