Jumpcode Genomics, une société de plate-forme technologique génomique axée sur l’amélioration de la compréhension de la biologie humaine, a annoncé aujourd’hui une collaboration avec le Translational Genomics Research Institute (TGen), une filiale de City of Hope, pour faciliter les enquêtes sur l’épidémiologie génomique du SRAS-CoV- 2, le virus qui cause le COVID-19. Jumpcode Genomics et TGen valident de nouvelles solutions complètes et des services cliniques qui tirent parti du séquençage et de l’analyse méta-génomiques pour faciliter la détection du COVID-19 et d’autres maladies infectieuses ; tous rendus très efficaces grâce à l’utilisation de la technologie Jumpcode Genomics CRISPRclean™.
Le COVID-19 a fait plus de 660 000 décès aux États-Unis, et les cas causés par de nouvelles variantes sont en constante augmentation. Le diagnostic de l’infection par le SRAS-CoV-2, l’évaluation du risque pour le patient de contracter la maladie COVID et le suivi du nombre et de la source des infections au sein d’une communauté sont importants pour atténuer et prévenir les nouveaux cas de COVID-19, mais il est difficile de le faire avec précision et efficacité. Alors qu’un programme national de surveillance visant à collecter des données sur les cas de COVID-19 auprès des services de santé des États, locaux et territoriaux est en cours, les cas signalés aux Centers for Disease Control and Prevention sous-estiment le nombre réel d’infections dues à des cas asymptomatiques et bénins qui ne le sont pas. faire tester.
Le séquençage génomique du SRAS-CoV-2 peut jouer un rôle essentiel dans le diagnostic de l’infection, l’identification de nouvelles variantes du virus et des virus apparentés, et le suivi de la propagation des souches existantes, ainsi que pour informer les efforts de santé publique pour prévenir de futures épidémies de maladies infectieuses. En utilisant la technologie CRISPRclean de Jumpcode pour améliorer le séquençage métagénomique, nous sommes en mesure de détecter non seulement une infection par le SRAS-CoV-2, mais également toute co-infection et/ou les réponses de l’hôte humain associées à l’infection. »
Nicholas Schork, Ph.D., professeur émérite de TGen et directeur de la division de médecine quantitative et de biologie des systèmes de TGen
Jumpcode combine la technologie basée sur CRISPR avec le séquençage de nouvelle génération pour supprimer les séquences indésirables, augmentant ainsi la sensibilité et permettant un séquençage plus efficace et plus rentable. Cette approche permet aux scientifiques d’obtenir de meilleures données, d’extraire des informations plus pertinentes sur la nature d’une infection et, en fin de compte, d’identifier des aspects uniques d’une infection qui n’auraient autrement pas été détectés. TGen teste le potentiel des réactifs de déplétion médiés par CRISPRclean de Jumpcode en combinaison avec les technologies du laboratoire du Dr Schork, y compris des protocoles pour effectuer un test de diagnostic à l’aide des réactifs CRISPRclean et des algorithmes pour analyser les données de séquence métagénomique résultantes. Des études cliniques et épidémiologiques prospectives élargies sont prévues pour prouver l’utilité du test de diagnostic dans les tests de routine des patients pour les maladies infectieuses.
Des aspects de l’approche adoptée par Jumpcode et TGen ont été récemment validés à l’aide d’un ensemble d’échantillons de référence dans lesquels l’état de l’infection et la gravité de l’infection étaient connus. Maintenant, les chercheurs de TGen étudient des échantillons de COVID-19 précédemment évalués par des tests PCR pour évaluer la sensibilité et la spécificité du diagnostic métagénomique par rapport aux tests basés sur la PCR ciblés standard. Les chercheurs de TGen ont également été en mesure d’identifier d’éventuelles co-infections chez des individus infectés par le SRAS-CoV-2.
« La pandémie de COVID-19 a eu un impact sans précédent sur toutes nos vies. Pourtant, il reste encore beaucoup à apprendre sur le point d’infection et sur sa propagation », a déclaré Yaron Hakak, Ph.D., PDG de Jumpcode Genomics. « Les scientifiques de TGen ont dirigé certaines des recherches les plus innovantes sur les tests, le diagnostic et le traitement du COVID-19. De plus, TGen est responsable de la majorité des tests de séquençage d’État en Arizona, et nous sommes fiers de collaborer avec eux sur ce point. projet métagénomique. Les connaissances acquises grâce à ces efforts pourraient aider les professionnels de la santé publique à atténuer l’impact des nouvelles souches de COVID-19 et à se préparer aux futures pandémies.
Comment protéger la santé cardiaque à la ménopause : 3 experts conseillent