Dans une clinique d’Afrique du Sud, des chercheurs ont identifié la bactérie ESKAPE en suspension dans l’air, qui survit à la plupart des médicaments antibiotiques. La clinique se trouve dans un quartier densément peuplé du centre-ville.
Des chercheurs de l’Université de Johannesburg (UJ) ont publié l’étude dans Air intérieur. Ils ont échantillonné l’air de la clinique et identifié les bactéries présentes dans l’air. Ils ont ensuite testé comment ces bactéries survivent à l’exposition à des antibiotiques.
Ils ont découvert qu’une grande variété de bactéries ESKAPE dangereuses provenant de la clinique résistent avec succès aux médicaments de première intention. Beaucoup sont également très résistants à plusieurs médicaments de première intention. Certains résistent déjà aux médicaments de dernier recours : ceux réservés à un usage lorsque rien d’autre n’est efficace.
« Les taux élevés d’infection par le VIH et la tuberculose en Afrique du Sud augmentent le risque d’infections des voies respiratoires inférieures (IRL) causées par ces bactéries« , déclare le Dr Lee Heine, l’auteur principal de l’étude.
Les bactéries présentes dans l’air de la clinique provoquent des IRL telles que la bronchite, la bronchiolite et la pneumonie. Ils peuvent provoquer une pneumonie nosocomiale, nosocomiale et associée à la ventilation.
« Toutes ces infections peuvent être mortelles. En effet, les bactéries ESKAPE ont tendance à être multirésistantes, voire extrêmement résistantes aux médicaments.« , ajoute le Dr Heine.
« Si les patients sont déjà immunodéprimés, le risque de décès dû à une pneumonie causée par une souche multirésistante de l’une de ces bactéries augmente, car elles sont susceptibles de se propager dans la circulation sanguine et de provoquer une septicémie.« .
Le Dr Heine est chercheur au Centre de recherche sur l’eau et la santé de la Faculté des sciences de la santé de l’UJ.
Sommaire
Bactéries survivant aux antibiotiques de dernier recours
Parmi les bactéries ESKAPE à Gram négatif testées, une résistance très préoccupante aux médicaments de première intention et aux médicaments de dernier recours a été découverte. Ils ont analysé Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter espèces, et E. coli bactéries de la clinique.
La colistine constitue une « dernière défense » toxique pour sauver la vie d’un patient. Il n’est utilisé que dans des situations critiques où tous les autres médicaments ont déjà échoué. Pourtant, 80,5 % des bactéries Gram-négatives de la clinique ont survécu à l’exposition à ce médicament.
L’ertapénème et le méropénème sont des carbapénèmes, une classe avancée d’antibiotiques à large spectre utilisés uniquement après l’échec des antibiotiques de première intention. Lorsqu’elles ont été exposées à ces médicaments, 31,2 % des bactéries à Gram négatif ont survécu à l’ertapénème et 26 % ont survécu au méropénem.
De plus, toutes les bactéries Gram-négatives ont montré une résistance à au moins un médicament appartenant à trois catégories d’antibiotiques ou plus. Lorsqu’elles sont exposées à des traitements courants de première intention comme le céfuroxime, 85,71 % des bactéries ont survécu. Avec la ceftazidime, 67,53 % des bactéries ont survécu. Tous ces éléments ont été classés multirésistants (MDR) dans l’étude.
Pire encore, 3,9 % des bactéries à Gram négatif étaient classées comme étant extrêmement résistantes aux médicaments (XDR). C’est parce qu’ils ont survécu à au moins un médicament dans toutes les catégories d’antibiotiques, sauf une ou deux. Les infections bactériennes XDR laissent aux médecins très peu d’options pour traiter les patients.
Résistance bactérienne à Gram positif
Les résultats de l’étude sur les médicaments résistants à la méthicilline Staphylocoque doré (SARM) étaient très préoccupantes. Cette bactérie peut rapidement infecter même une peau intacte et peut facilement se propager d’une personne à l’autre, explique le Dr Heine.
« Dans le monde, 10 % des personnes sont porteuses de S. aureus dans leurs voies nasales ou sous leurs aisselles. Si des professionnels de santé sont identifiés comme porteurs, ils doivent être traités avec des antibiotiques appropriés pour éliminer le SARM de leur corps avant de pouvoir être à nouveau en contact avec des patients.« .
L’exposition à une variété de médicaments uniques a entraîné des taux de survie compris entre 71,8 % et 94,8 %. Seule la vancomycine, un médicament réservé ou de dernier recours, était efficace à environ 95 % pour tuer la bactérie. Pour cette espèce de bactérie, le taux MDR était de 6,3 % et le taux XDR de 5,6 %.
Bactéries ESKAPE et nouveau-nés en soins intensifs
Dans une étude connexe, le professeur Tobias (TG) Barnard et le Dr Heine ont identifié la bactérie ESKAPE dans l’unité de soins intensifs pour nouveau-nés (USIN) d’un hôpital public. Le professeur Barnard est le directeur du Centre de recherche sur l’eau et la santé de l’UJ. L’étude est publiée dans Prévention des infections en pratique.
L’hôpital est dans la même ville que la clinique. Les chercheurs ont collecté des centaines d’écouvillons de surface dans des incubateurs ; et des échantillons de lavage des mains provenant d’infirmières, de médecins, de nettoyeurs et d’employés de l’USIN.
Dans l’étude, la grande majorité des bactéries ESKAPE (plus de 85 %) de l’USIN ont été classées comme MDR.
Population très vulnérable
Les agents pathogènes ESKAPE sont regroupés de cette façon, car ils ont la capacité « d’échapper » à l’activité d’un nombre croissant d’antibiotiques, explique le Dr Heine.
« Ces bactéries sont très efficaces pour provoquer des infections. Ils sont spécifiquement associés aux infections contractées dans les hôpitaux et les cliniques.
« L’utilisation d’antibiotiques pour traiter une infection repose sur un système immunitaire intact. Le corps travaille avec des antibiotiques pour éliminer les bactéries. Sans un système immunitaire intact, le traitement peut être prolongé ou échouer« .
Cependant, l’Afrique du Sud a l’un des taux de co-infection tuberculose et VIH les plus élevés au monde. Pour cette raison, de nombreuses personnes sont vulnérables aux infections pulmonaires et vivent avec un système immunitaire affaibli.
En 2024, la tuberculose (TB) était au quatrième rang, les maladies liées au VIH au cinquième rang, et la grippe et la pneumonie au sixième rang des causes de décès naturels parmi tous les groupes d’âge en Afrique du Sud, selon le rapport de mortalité de septembre 2026 de Stats SA.
En outre, l’approvisionnement en eau est devenu de moins en moins fiable dans tout le pays. Cela a un impact sur la désinfection dans le cadre du contrôle des infections dans les cliniques et les hôpitaux.
Un problème mondial croissant
La clinique et l’USIN étudiées font partie des nombreux établissements médicaux du monde entier qui luttent pour réduire le nombre de patients souffrant de LRI au cours de leur traitement.
« La résistance aux antimicrobiens (RAM) se produit lorsque les bactéries ne sont pas affectées, c’est-à-dire qu’elles ne sont pas tuées ou neutralisées, lorsqu’elles sont exposées à la dose ou à la concentration habituelle d’antibiotique utilisée pour traiter l’infection.« , déclare le Dr Heine.
« La RAM augmente pour toutes les bactéries en Afrique du Sud et dans le monde. Les bactéries RAM se développent dans les environnements hospitaliers et cliniques parce que l’utilisation d’antibiotiques et de désinfectants sélectionne leur reproduction par rapport aux bactéries moins résistantes.« , ajoute-t-elle.
Parallèlement, il existe des lignes directrices mondiales concernant le nombre autorisé de bactéries (pathogènes et non pathogènes) pour la qualité de l’eau. Ils existent également pour les surfaces des installations de préparation des aliments et pour les surfaces des établissements de santé, explique le Dr Heine.
Mais il n’existe pas de normes comparables pour les bactéries et champignons aéroportés dans les environnements intérieurs. Compte tenu du taux croissant de résistance bactérienne aux antibiotiques, des normes de qualité intérieure pour le dénombrement bactérien doivent être établies en Afrique du Sud, dit-elle.
Conclut le Dr Heine : « Il n’existe pas de nombre autorisé d’agents pathogènes respiratoires pour un volume d’air donné. La surveillance de la qualité de l’air bactérienne et fongique devrait être obligatoire dans les établissements de santé.
« Les établissements médicaux doivent respecter à tout moment les protocoles de prévention et de contrôle des infections. La surveillance de routine de la qualité de l’air doit être ajoutée à leurs protocoles de prévention et de contrôle des infections« .
Le financement a été fourni par le Conseil de recherche universitaire de l’Université de Johannesburg.
