Dans une étude récente publiée dans PLOS ONEles chercheurs ont évalué dans quelle mesure une infection et une vaccination antérieures protégeaient les résidents et le personnel du système carcéral de l’État de Californie des États-Unis contre une infection percée par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) Omicron sous-variante B.1.1 .529.
Sommaire
Arrière plan
Les prisons et les prisons sont des environnements à risque où de nombreuses épidémies de coronavirus 2019 (COVID-19) se sont produites pendant la pandémie en cours. Le California Department of Corrections and Rehabilitation (CDCR) gère le deuxième plus grand système pénitentiaire d’État américain. Ils ont vacciné leurs résidents et leur personnel de sorte que 77,9 % et 40,3 % de leurs résidents et de leur personnel avaient reçu une troisième dose (de rappel) de vaccin à acide ribonucléique messager (ARNm) fin août 2021.
Pourtant, ils ont identifié un cas d’Omicron au sein du système CDCR en décembre 2021. Peu de temps après, il y a eu une épidémie parmi leurs résidents et leur personnel, coïncidant avec l’époque de la vague mondiale d’Omicron. L’examen de ces deux populations à haut risque a assuré une détermination fiable de l’infection au cours de la période d’étude en raison de leurs niveaux élevés de tests. Le CDCR gère un programme de test multicouche volontaire de transcriptase inverse-amplification en chaîne par polymérase (RT-PCR) en réponse aux épidémies de COVID-19 détectées. Dans le cadre de ce programme, ils testent obligatoirement tout le personnel au moins une fois par semaine et le personnel qui travaille dans les établissements de santé au moins deux fois par semaine.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont recueilli des données auprès d’environ 60 000 personnes incarcérées et 17 000 membres du personnel pénitentiaire en Californie pendant la période d’épidémie d’Omicron entre le 24 décembre 2021 et le 14 avril 2022, pour l’analyse rétrospective du risque d’infection pendant la vague d’Omicron. Ils ont utilisé des modèles de Cox pondérés pour comparer l’efficacité du vaccin (VE) et l’infection précédente par rapport à la sous-variante Omicron, B.1.1.529.
Notamment, ils ont pris en compte les infections antérieures survenues dans la population étudiée avant et pendant la période de prédominance de la variante Delta. Les modèles permettaient au risque de base de varier selon la prison, et la pondération de probabilité inverse réduisait les effets de confusion dus aux différences de caractéristiques de base parmi les membres de la cohorte.
L’équipe a calculé les scores de propension à équilibrer les covariables par caractéristiques démographiques, cliniques et carcérales. Ils ont pondéré les résidents par prison, le score de risque COVID-19 (0, 1 ou ≥2), le type de chambre, le sexe et l’âge. De même, ils ont pondéré le personnel en fonction de la prison, de la position (détention ou soins de santé), de l’âge (18 à 55 ans ou plus) et du sexe. L’équipe a estimé la mesure dans laquelle les vaccins à ARNm protégeaient contre l’infection stratifiée par le nombre de doses que les personnes avaient reçues et si elles avaient eu une infection précédemment documentée avant le début de la période d’observation.
Un autre bras de l’étude comprenait une conception de cohorte appariée roulante qui évaluait l’efficacité de trois doses de vaccin chez les détenus éligibles par rapport à ceux qui n’avaient reçu que deux doses. Les chercheurs n’ont inclus que les résidents de la cohorte de l’étude qui étaient emprisonnés dans une prison du CDCR avant le 1er janvier 2021. De même, ils ont couvert le personnel correctionnel employé avant le 1er janvier 2021 et qui avait travaillé tout au long de 2021. Notamment, au 1er janvier 2022 , plus de 50 % des prisons étaient entrées dans une phase d’épidémie, l’épidémie dans la dernière prison ayant commencé le 18 janvier 2022.
Résultats de l’étude
Parmi 59 794 résidents qui répondaient aux critères d’inclusion de l’étude, 16,7 % ont été testés positifs au COVID-19 au cours de la période d’étude. De même, 30,3 % des 16 572 membres du personnel ont été testés positifs au COVID-19 au cours de la période d’étude. L’intervalle médian entre le début de leur dernière infection et l’éclosion de la prison était de 393 jours pour les résidents ; parmi le personnel, il en était de même de 367 jours.
L’efficacité de l’infection précédente contre l’infection par Omicron chez les personnes non vaccinées variait de 16,3 % à 48,9 %. De même, les estimations de l’EV variaient de 18,6 % à 83,2 % avec deux doses de vaccin et de 40,9 % à 87,9 % avec trois doses de vaccin. Une dose de rappel a augmenté les estimations de l’EV à 25 % pour les personnes sans antécédents d’infection par le SRAS-CoV-2 et à 57,9 % pour les personnes infectées avant la période de prédominance Delta.
L’analyse secondaire a utilisé une conception alternative qui a probablement corrigé les biais qui auraient biaisé les estimations de VE vers le bas. Ainsi, il a fourni plus efficacement des estimations parmi les personnes devenues éligibles pour une troisième dose de vaccin. Néanmoins, les estimations prudentes des deux analyses ont indiqué une protection supplémentaire d’une dose de rappel d’ARNm contre une infection confirmée, quels que soient les antécédents d’infection.
Une autre observation notable de l’étude était que la population résidente avait des estimations d’EV inférieures à la population du personnel pour la plupart des combinaisons d’antécédents d’exposition. Comme les tests n’étaient ni obligatoires ni systématiquement effectués pour les résidents, des infections antérieures non diagnostiquées auraient pu diluer les estimations de l’EV parmi les résidents.
conclusion
Pour conclure, bien que les vaccins à ARNm et les infections antérieures aient fourni moins de protection contre les percées infectieuses d’Omicron par rapport aux variantes antérieures du SRAS-CoV-2, les rappels continuent de fournir une protection supplémentaire même chez les personnes précédemment infectées. Ainsi, la vaccination de rappel reste importante pour les populations très vulnérables supportant un fardeau disproportionné de COVID-19.
