La variante Omicron (B.1.1.529) du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) a été détectée en Afrique du Sud en novembre 2021. L’Organisation mondiale de la santé (OMS) a déclaré Omicron comme variante préoccupante (VOC) deux jours après avoir été signalé par le Network of Genomics Surveillance en Afrique du Sud.
Cette variante s’est avérée hautement transmissible et infectieuse, envahit les mécanismes de défense naturels du corps, est moins sensible aux vaccins et est hautement mutable – avec 50 nouvelles mutations détectées, dont 30 ont été trouvées au niveau de la protéine de pointe.
Étude: Variante SARS-CoV-2 Omicron : une prochaine phase de la pandémie de COVID-19 et un appel aux armes pour les sciences systémiques et la médecine de précision. Crédit d’image : Fit Ztudio/Shutterstock
En janvier 2022, Omicron s’est répandu dans plus de 145 pays, le taux de transmission doublant en 2-3 jours. Il a été déclaré comme une grave préoccupation en Europe et une urgence au Royaume-Uni.
L’étude
Un article récent, publié dans MedComm, visait à décrire l’émergence de la variante Omicron, sa structure, son impact sur la santé et les systèmes de santé, les défis auxquels on peut s’attendre en raison de cette variante et présentait diverses prédictions d’experts concernant ce COV et les stratégies de gestion de la maladie à coronavirus 2019 ( COVID-19) causée par cette variante.
Le présent examen impliquait une comparaison entre la variante Delta et la variante Omicron où la variante Delta a été établie comme plus contagieuse par rapport à la variante Omicron ; ce dernier étant plus infectieux et transmissible. La variante Omicron présentait 15 mutations au niveau du domaine de liaison au récepteur (RBD) alors que la variante Delta ne présentait que deux mutations. On dit que ces mutations augmentent l’infectiosité, la transmissibilité et la résistance aux traitements et aux vaccins contre la variante Omicron – qui représente désormais près de 90 % du total des infections au COVID-19 dans le monde.
Résultats
Dans une étude où l’analyse par cryo-microscopie électronique (Cryo-EM) de l’enzyme de conversion de l’angiotensine humaine 2 (ACE2) en complexe avec la protéine de pointe de la variante SARS-CoV-2 Omicron a été réalisée, il a été constaté que l’affinité d’Omicron la protéine de pointe à l’ACE2 humain est similaire à celle de la variante Delta. Les tests de neutralisation ont montré une augmentation de l’évasion des anticorps dans la variante Omicron, alors que pour les variantes bêta et delta, l’évasion immunitaire n’était pas évidente – dans les études épidémiologiques à l’échelle de la population.
Des rapports récents suggèrent que les sites actifs et bloquants altérés dans la variante Omicron entraînent une diminution de l’efficacité des vaccins COVID-19 contre le virus. Apparemment, une altération a été trouvée dans la fusogénicité du pic de la variante Omicron, ce qui provoque la diminution de la formation de syncytes conduisant à une réplication réduite des cellules transfectées du poumon. Cependant, l’implication de tout autre organe ou système d’organes reste incertaine.
Les scientifiques affirment que les mutations rendent la variante Omicron partiellement résistante à l’immunité naturelle, aux anticorps monoclonaux et aux anticorps neutralisants du vaccin. Les preuves suggèrent des immunités naturelles et induites par le vaccin altérées chez l’homme contre la variante Omicron.
La principale chose dans la gestion des patients infectés est le diagnostic par réaction en chaîne par polymérase (PCR) et tests d’antigène COVID-19, car ceux-ci peuvent détecter efficacement la variante Omicron en raison de son association avec la protéine S. Néanmoins, ces méthodes sont longues et coûteuses. Alternativement, utiliser des nanoparticules pour isoler l’ARN ou l’ADN des échantillons via champ magnétique peut aider à un diagnostic rapide. Les capteurs SARS-CoV-2 nano-activés détectent sélectivement la concentration de virus même à de faibles niveaux (niveau picomolaire).
D’autres biomarqueurs efficaces ont été étudiés pour la détection sélective du SRAS-CoV-2, tels que l’ADN/ARN sélectif de segment, les anticorps et le CIRSR/Cas. Ces systèmes de biodétection soutenus par la nanotechnologie doivent être validés et confirmés épidémiologiquement avant d’être utilisés dans les tests cliniques et au point de service (POC).
Ces biocapteurs doivent encore être testés contre la variante Omicron, bien qu’en théorie, ils soient supposés être efficaces car ils agissent contre la protéine de pointe. En raison des nombreuses mutations au niveau de la protéine de pointe de la variante Omicron, un outil de diagnostic bien conçu et hautement validé est justifié pour détecter et confirmer cette variante dans de grandes populations.
L’approche de biodétection soutenue par l’Internet des objets médicaux (IoMT) et l’intelligence artificielle (IA) utilisent les informations concernant la charge virale pour comprendre la progression de la maladie et évaluer l’efficacité du traitement. Ceux-ci peuvent être utilisés dans la détection de la variante Omicron et également dans le cadre de la télémédecine pour analyser les conséquences sur la santé en référence au conditionnement/profilage médical des individus. Par conséquent, un suivi personnalisé de la progression de l’infection du variant Omicron peut être effectué.
Pour prévenir l’infection et la transmission virales, une bonne hygiène doit être maintenue, des dispositifs de protection et des masques doivent être utilisés. En outre, la mise en œuvre de la distanciation physique, des tests de masse, des déplacements restreints, du suivi des patients et des campagnes de dépistage à domicile doit être strictement suivie. Des précautions particulières doivent être prises lors de la surveillance des populations à haut risque. Des approches multidisciplinaires prêtes à commercialiser des plates-formes de chevet ou de point de service (POC) pourraient aider à la gestion appropriée de la variante Omicron.
Des outils de diagnostic et des modalités thérapeutiques plus efficaces devraient être développés grâce à la médecine personnalisée/de précision. Une dose de rappel après une vaccination complète s’est avérée efficace contre l’infection au COVID-19. La nanotechnologie peut être utilisée pour optimiser les traitements grâce à des thérapies et des vaccins développés. Comme l’infection par le SRAS-CoV-2 peut affecter différents organes, il est urgent d’étudier la thérapeutique ; les effets secondaires associés à l’infection à analyser et la récupération post-infection d’un patient à surveiller – pour obtenir la nouvelle implication thérapeutique pharmacologique pertinente dans tous les aspects de la nanomédecine.
Il existe un besoin urgent de concevoir des vaccins disponibles pouvant être administrés sur le site cible grâce à des approches nanomédicales. D’autres agents thérapeutiques peuvent être utilisés avec la nanomédecine pour gérer les conséquences post-infection – les nutraceutiques peuvent être un bon choix. L’optimisation des nutraceutiques et de la nanomédecine – formulées par un vaccin conçu comme médecine de précision – peut être entreprise. Cela peut en outre être formulé comme une médecine personnalisée en fonction du profil de santé d’un patient.
L’intelligence artificielle (IA), les grands réservoirs de données, la science des sous-types et les systèmes bioinformatiques constituent le formidable arsenal menant à des thérapies plus spécifiques et à de meilleurs résultats pour les patients.
Discussion et conclusions
Selon les experts de la santé, une approche multidisciplinaire est nécessaire pour lutter contre cette troisième vague de pandémie de COVID-19, y compris une meilleure compréhension de l’infection causée par la variante prédominante d’Omicron. L’IA peut être utilisée pour concevoir de nouvelles thérapies ou surveiller l’efficacité des médicaments et des stratégies de gestion des maladies ; pour accroître la sensibilisation à la vaccination, en particulier les programmes de rappel ; en utilisant des approches biomédicales/biotechnologiques axées sur le développement de meilleurs systèmes de test ; pour le séquençage des gènes et des thérapies plus efficaces ; et d’assurer un meilleur partenariat public-privé pour la santé, le bien-être et l’équilibre socio-économique réglementaire.
Il est urgent de prêter attention à l’évolution virale, à la transmission, à l’évolution de la maladie et au pronostic, sans négliger l’épidémiologie de la maladie et les vaccinations prophylactiques – pour lutter contre le COVID-19, ainsi que toute future pandémie.
