Le système immunitaire semble évoluer rapidement en réponse aux variantes du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) circulant dans le monde. Une nouvelle étude de pré-impression publiée sur le bioRxiv* Le serveur dirigé par Ali H.Ellebedy de la faculté de médecine de l’Université de Washington a découvert que l’anticorps monoclonal 2C08 produit par le vaccin Pfizer pouvait aider à neutraliser les variants du COVID-19.
Des travaux antérieurs ont étudié les cellules B du centre germinal (GC) après la vaccination et ont découvert qu’elles produisaient des anticorps spécifiques du domaine de liaison au récepteur contre la protéine de pointe de la souche D614G SARS-CoV-2.
Les résultats actuels fournissent une preuve supplémentaire que la vaccination est nécessaire pour délivrer une immunité durable contre les variants du SRAS-CoV-2.
Sommaire
Anticorps monoclonal se liant à des variants
Les chercheurs ont utilisé 13 anticorps monoclonaux humains efficaces pour se lier à la souche D614G. En utilisant un ELISA, ils ont en outre évalué ces anticorps contre trois variantes, y compris B.1.1.7, B.1.351 et B.1.1.248.
Un seul anticorps monoclonal, 1H09, a diminué la liaison au domaine de liaison au récepteur du variant B.1.1.7. Quatre anticorps monoclonaux ont montré des réductions significatives de l’activité de liaison lorsqu’ils sont liés au domaine de liaison au récepteur des variants B.1.351 et B.1.1.248. Environ huit anticorps monoclonaux ont montré une liaison équivalente à toutes les souches testées.
Ils ont ensuite examiné l’activité neutralisante de 13 anticorps lorsqu’ils sont exposés à la souche D614G. Environ cinq anticorps – 2C08, 1H09, 1B12, 2B06 et 3A11 – ont pu neutraliser 80% de la souche D614G. Lorsqu’il a été exposé aux variantes B.1.1.7, B.1.351 et B.1.1.248, 1H09 n’a réussi à neutraliser aucune variante émergente. Les anticorps monoclonaux 1B12, 2B06 et 3A11 ont neutralisé le variant B.1.1.7 mais pas les variants B.1.351 et B.1.1.248.
Fait intéressant, un anticorps créé à partir des cellules GC B spécifiques du pic a développé l’anticorps 2C08 qui a neutralisé D614G et plusieurs variants de SARS-CoV-2. Cela suggère qu’il reconnaît d’autres résidus sur le domaine de liaison au récepteur qui restent inchangés parmi les variantes.
Anticorps 2C08 protégé contre l’infection à coronavirus
Les chercheurs ont utilisé des hamsters syriens de 4 à 6 semaines traités avec 2C08 et soumis à une épreuve avec la souche D614G ou la variante B.1.351.
Le 2C08 a empêché l’infection de complications graves par le D614G SARS-CoV-2 et le variant B.1.351. Les hamsters ont montré une inflammation réduite en diminuant le nombre de cytokines pro-inflammatoires dans les poumons. Ils ont également montré des niveaux d’ARN viral plus bas dans les poumons de plus de 10 000 fois avec le D614G et une réduction de 1 000 fois dans le variant B.1.351. Une diminution significative de l’expression génique de l’hôte a été observée pour Ccl3, CcL5, Ifit3, Ifit6, Ip10, Irf7, et Rig-I dans les poumons de hamsters ayant reçu l’anticorps 2C08.
Les hamsters traités avec 2C08 n’ont pas non plus perdu de poids par rapport aux hamsters ayant reçu l’anticorps témoin. En fait, ils ont pris plus de poids tout au long de l’étude que le groupe témoin.
Faible possibilité d’une mutation échappant à la neutralisation 2C08
L’équipe a utilisé des virus chimériques utilisant la protéine de pointe de la souche D614G pour trouver des variantes qui peuvent échapper à la neutralisation de 2C08. Ils ont identifié les mutations d’échappement S G476D, G476S, G485D, F486P, F486V et N487D, qui sont dans le domaine de liaison au récepteur et jouent un rôle dans la liaison ACE2.
À l’aide de la surveillance génomique, ils ont examiné 829 162 génomes de la base de données publique GISAID pour voir si l’une des mutations d’échappement 2C08 identifiées était associée à des variants du SRAS-CoV-2.
Sur les 6, 4 mutants d’échappement ont été trouvés dans des souches de SRAS-CoV-2 en circulation – bien que la fréquence d’en trouver un soit rare. Les résultats ont montré une chance de 0,008% de trouver un mutant échappé dans un virus. Il était plus probable de trouver la substitution D614G, qui est apparue dans 49% des échantillons séquencés.
2C08 se lie au motif de liaison au récepteur
Parce que l’anticorps S2E12 a une identité d’acides aminés à 95% avec 2C08 et partage des résidus d’acides aminés lourds similaires qui engagent le domaine de liaison au récepteur, les chercheurs suggèrent que son mécanisme d’action est similaire à 2C08. Les S2E12 peuvent détecter un épitope de domaine de liaison au récepteur qui chevauche partiellement l’empreinte du récepteur ACE2 connue sous le nom de motif de liaison au récepteur.
Plus de preuves de ce mécanisme d’action sont observées avec 253H55L et COV2-2196, qui ont des interactions similaires et partagent des caractéristiques génétiques avec 2C08.
Les chercheurs ont également découvert des clonotypes de type 2C08 avec 20 autres anticorps partageant les mêmes attributs génétiques que 2C08, S2E12, 253H55L et COV2-2196 isolés par différents patients. Ainsi, 2C08 est étiqueté comme un clonotype de cellule B «public» car il est lié par clonage à d’autres anticorps caractérisés dans le monde.
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique / les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
