Les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) ont attribué 17,5 millions de dollars à une coalition dirigée par des chercheurs de l’UC San Diego pour développer des outils et des réseaux innovants afin de répondre rapidement aux épidémies émergentes.
Même si nous avons réalisé des progrès, la pandémie de COVID a mis en évidence les lacunes de nos systèmes pour répondre rapidement et efficacement aux menaces de maladies infectieuses. Ce projet rassemble une équipe fantastique pour intégrer les meilleures approches de prévision et d’analyse avec les meilleures données afin que les responsables de la santé publique puissent prévenir, prédire, anticiper, se préparer et atténuer ces menaces.
Eliah Aronoff-Spencer, MD, Ph.D., chercheur principal (PI) de la subvention, qui est à l’UC San Diego en tant que professeur adjoint à la Division des maladies infectieuses et de la santé publique mondiale à l’École de médecine, faculté de Design Lab et directeur de le Center for Health Design, affilié au Qualcomm Institute et membre du Conseil exécutif
Le projet, qui s’associe à l’agence de santé et de services sociaux du comté de San Diego, comprend des experts de l’UCLA, de l’UCSF, de l’UC Riverside, du laboratoire national de Los Alamos et de l’université de Washington.
« Une variété de partenariats informels entre les modélisateurs et les autorités de santé publique ont surgi pendant la pandémie », a noté le co-PI Mark S. Handcock, Ph.D., professeur distingué de statistiques à l’UCLA. « Il existe désormais une opportunité précieuse de formaliser et de renforcer ces collaborations et de déterminer les moyens optimaux permettant à la modélisation et aux modélisateurs de soutenir les autorités sanitaires de manière proactive et stratégique. C’est ce que ce projet vise à faire. »
« Ce travail tirera parti du solide partenariat existant entre les modélisateurs épidémiques de l’UC San Diego et le comté, qui a éclairé la prise de décision cruciale lors de l’épidémie d’hépatite A de 2017-2019 et de la pandémie de COVID-19 », a déclaré Eric McDonald, MD, MPH. , directeur par intérim de l’agence de santé et des services sociaux de San Diego. « En tant que partenaire d’intégration pour cette subvention, le comté bénéficiera des efforts de modélisation et de prévision et aura un accès plus large à des outils et informations importants qui éclaireront mieux la prise de décision lors des épidémies et propagations de maladies infectieuses en cours et futures.
Le titre de la subvention, qui a été délivré à l’Institut Qualcomm de l’UC San Diego, est Resilient Shield : Un réseau pour l’intégration et la modélisation des données sur les épidémies afin de soutenir une action rapide de santé publique. Le financement commence le 29 septembre et s’étend sur cinq ans.
« Un élément essentiel du projet consiste à analyser les sources de données pour en déterminer la puissance et l’utilité prédictives », a déclaré le co-PI Ruy Ribeiro, Ph.D., chercheur en biologie théorique et biophysique au Laboratoire national de Los Alamos.
Les sources de données comprendront non seulement l’épidémiologie moléculaire – ; qui peut fournir une identification précoce des variantes préoccupantes, des estimations du taux de transmission et des informations sur les grappes de croissance actives – ; mais également la surveillance des eaux usées et de l’air ; systèmes de notification d’exposition (smartphones et recherche des contacts) ; recherches et publications sur Internet ; les données cliniques légalement disponibles ; et des simulations basées sur des scénarios.
La co-chercheuse Natasha Martin, D.Phil., professeure à la Division des maladies infectieuses et de la santé publique mondiale à la faculté de médecine de l’UC San Diego, a noté : « Au cours du programme réussi d’atténuation de l’UCSD Return to Learn COVID-19, nous avons développé un outil innovant. , processus adaptatif et itératif d’intégration et de modélisation des données pour éclairer des décisions rapides et basées sur les données sur le campus. Avec cette subvention, nous testerons notre processus de modélisation adaptative avec la Health and Human Services Agency de San Diego, qui, en cas de succès, servira de un modèle sur la façon dont la modélisation peut être utilisée au mieux pour éclairer l’action de santé publique.
Les tests pilotes incluront les communautés et les populations du comté de San Diego qui ont été historiquement laissées pour compte, y compris l’épidémie d’hépatite A en cours chez les personnes sans abri, les foyers d’épidémie de VIH (par exemple, chez les personnes qui consomment des drogues), ainsi que des analyses rétrospectives des réponses. aux agents pathogènes comme le SRAS-COV2, la grippe et le virus respiratoire syncytial, en particulier dans les populations vulnérables.
L’équipe mesurera son succès par sa capacité à fournir des visualisations de données de modélisation et d’épidémie utiles et opportunes pour éclairer les décisions de santé publique lorsque le comté en a le plus besoin. Les travaux menés à San Diego visent également à servir de modèle de référence pour améliorer l’analyse, la modélisation et les prévisions dans les juridictions sanitaires américaines à travers le pays.
« Ce projet rassemble des experts en pratique de santé publique dans les services de santé nationaux et locaux, en modélisation et en informatique », a déclaré le co-PI William Lober, professeur d’informatique de la santé et de santé mondiale dans les écoles de sciences infirmières, de médecine et de santé publique de l’Université. de Washington. « Ensemble, et avec nos partenaires fédéraux du Centre de prévision et d’analyse des épidémies du CDC, nous créerons des ressources qui pourront être utilisées régulièrement pour éclairer les décisions de santé publique et qui pourront être rapidement mises à l’échelle pour répondre aux urgences de santé publique. »
Le consortium était l’un des 13 partenaires financés pour travailler aux côtés du Centre de prévision et d’analyse des épidémies du CDC afin d’établir un réseau de réponse aux épidémies qui utilise les données pour soutenir les décideurs lors des urgences de santé publique.
« L’une des leçons tirées de la récente pandémie est que nous ne pouvons pas continuer à travailler dans nos silos universitaires ou dans notre portée géographique immédiate et espérer surmonter les grands défis sanitaires mondiaux », a ajouté le co-PI Mohsen. Malekinejad, MD, Dr.PH, professeur agrégé d’épidémiologie et de santé mondiale à l’UCSF. « Nous avons constitué une équipe interdisciplinaire d’experts au-delà des frontières de l’État pour pouvoir résoudre plusieurs problèmes clés qui entravent la prévision et la réponse rapides et efficaces aux épidémies. Je suis extrêmement enthousiaste à l’idée d’assister aux prochaines étapes de cette collaboration, car cette subvention permettra nous permettent de développer et d’étendre davantage nos systèmes de partage de données, notre infrastructure analytique, nos capacités de recherche et de formation dans le domaine.
Les chercheurs supplémentaires bénéficiant de la subvention comprennent Carrie Manore, Ph.D., du Laboratoire national de Los Alamos ; George Rutherford, MD, de l’UCSF ; Mark Beatty, MD, MPH, Seema Shah, MD, et Wilma Wooten, MD, MPH, de l’Agence de la santé et des services sociaux du comté de San Diego ; Ravi Goyal, Ph.D., Ilya Zaslavsky, Ph.D., Joel Wertheim, Ph.D., Andy Bartko, Ph.,D., Shamim Nemati, Ph.D., Ramesh Rao, Ph.D., Davey Smith, MD, Robert Schooley, MD, et Camille Nebeker, Ed.D., de l’UC San Diego ; et Richard Carpiano, Ph.D., MPH, d’UC Riverside.
