Une équipe de scientifiques des États-Unis a récemment démontré que le cerf de Virginie est très sensible à l’infection par le coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) du syndrome respiratoire aigu sévère. De plus, les animaux infectés sont capables de transmettre le virus à leurs homologues non infectés par contact indirect. L’étude est actuellement disponible sur le bioRxiv* serveur de pré-impression.
Sommaire
Contexte
Bien qu’il y ait une incertitude sur l’origine exacte du SRAS-CoV-2, un débordement de l’agent pathogène des animaux aux humains est probablement responsable de l’émergence de la pandémie de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19). Des études d’analyse génomique ont révélé que le SRAS-CoV-2 partage des similitudes génétiques élevées avec les coronavirus trouvés chez les chauves-souris, en particulier les chauves-souris fer à cheval. Cependant, les preuves actuelles indiquent que le virus aurait pu se transmettre d’une source animale à l’homme via un hôte intermédiaire. Bien qu’au départ, on ait émis l’hypothèse que les pangolins sont les hôtes intermédiaires du SRAS-CoV-2, les analyses de séquençage phylogénétique et génétique moléculaire n’ont pas permis de soutenir l’hypothèse. Ainsi, pour comprendre avec précision l’origine virale ainsi que le mécanisme de transmission interspécifique, il est important d’identifier les espèces animales sensibles à l’infection par le SRAS-CoV-2 et pouvant servir de réservoir zoonotique potentiel pour le virus.
Conception de l’étude actuelle
Dans l’étude, les scientifiques ont examiné si le cerf de Virginie était sensible à l’infection par le SRAS-CoV-2, car l’enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (ACE2) trouvée chez le cerf de Virginie partage un degré élevé de similitude avec l’ACE2 humaine.
Plus précisément, ils ont des faons de cerf blancs infectés par voie intranasale avec le SRAS-CoV-2 pour vérifier l’infectivité virale et la pathogénicité. De plus, ils ont cherché à savoir si les faons infectés sont capables de transmettre l’infection aux faons non infectés par contact indirect.
Observations importantes
En utilisant des approches de coloration par immunofluorescence, les scientifiques ont observé que le SRAS-CoV-2 est capable d’infecter les cellules pulmonaires obtenues à partir de faons infectés. De plus, une réplication efficace du SRAS-CoV-2 a été observée dans les cellules pulmonaires infectées, indiquant la sensibilité du cerf de Virginie à l’infection et à la réplication du SRAS-CoV-2.
Tissus de cerf de Virginie faon inoculés par voie intranasale avec SRAS-CoV-2 et examinés 21 jours plus tard. Notez le marquage intense de l’ARN viral dans les centres des follicules lymphoïdes (A) situés sous-jacents à l’épithélium amygdalien (en haut à gauche). Notez l’étiquetage de l’ARN du SRAS-CoV-2 dans le follicule ganglionnaire rétropharyngé médial (B) et la médullaire ganglionnaire médiastinale (C). La lumière du cornet nasal contient un agrégat de mucus, de cellules et de débris avec un marquage intense pour l’ARN du SRAS-CoV-2 (D). Des coupes microscopiques adjacentes démontrent un marquage intense des follicules lymphoïdes avec une sonde pour l’ARN du SRAS-CoV-2 (E) mais aucun marquage à l’aide de la sonde anti-génomique sens (F). ISH- RNAscope.
Tout au long de la période d’étude (21 jours), les faons infectés n’avaient présenté aucun symptôme clinique ou détresse respiratoire lié au COVID-19, à l’exception d’une augmentation légère et temporaire de la température corporelle. De plus, aucune lésion évidente n’a été observée lors des examens post mortem.
Pour étudier le profil de l’infection par le SRAS-CoV-2 dans les voies respiratoire et gastro-intestinale, les scientifiques ont analysé les prélèvements nasaux et rectaux prélevés sur des faons infectés et de contact indirect. Bien qu’aucune preuve d’entrée virale dans la circulation sanguine n’ait été trouvée, les sécrétions nasales de faons infectés ont montré la présence d’ARN viral. Fait intéressant, une charge virale élevée a également été détectée dans les sécrétions nasales des animaux en contact indirect. Cependant, une excrétion transitoire de SRAS-CoV-2 a été observée dans des échantillons fécaux prélevés sur des faons infectés et des faons de contact indirect.
En ce qui concerne la distribution tissulaire du SRAS-CoV-2, des charges virales constamment plus élevées ont été observées dans les cornets nasaux, les amygdales palatines et les ganglions lymphatiques rétropharyngés provenant de faons infectés et de contact indirect. Aucune distribution tissulaire d’ARN viral n’a été observée dans les poumons, les reins, l’intestin, le cerveau ou les ganglions lymphatiques mésentériques.
Pour étudier les réponses immunitaires contre le SRAS-CoV-2, les scientifiques ont mesuré les niveaux d’anticorps spécifiques au domaine de liaison au récepteur de nucléocapside et de pointe (RBD) ainsi que des anticorps neutralisants dans des échantillons de sérum obtenus à partir d’animaux infectés et de contact indirect. La présence d’anticorps neutralisants et spécifiques de la RBD spike dans le sérum a déjà été observée après sept jours d’infection, et les taux de ces anticorps se sont avérés augmenter avec le temps.
Dans l’ensemble, les résultats de l’étude révèlent que le cerf de Virginie est sensible à l’infection subclinique par le SRAS-CoV-2 et que la transmission intra-espèce de l’infection est possible par contact indirect. L’étude fournit des informations importantes sur les animaux hôtes qui sont sensibles à l’infection par le SRAS-CoV-2 et que les résultats peuvent être potentiellement utilisés pour développer des interventions visant à prévenir une éventuelle zoonose inversée.
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique / les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.