Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de préimpression, les chercheurs ont étudié les niveaux de protéine de pointe (S) du coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) du syndrome respiratoire aigu sévère circulant et d’acide ribonucléique viral (ARN) chez les patients hospitalisés avec une maladie à coronavirus aiguë 2019 (COVID-19) et dans patients avec et sans séquelles post-aiguës de COVID-19 (PASC).
Sommaire
Arrière plan
Des progrès considérables dans la recherche concernant les manifestations aiguës de la COVID-19 ont eu lieu ; cependant, les données PASC manquent. Il est essentiel d’élucider les mécanismes sous-jacents de la physiopathologie du PASC pour identifier les individus les plus susceptibles de développer le PASC et pour rechercher des cibles pour le développement de médicaments anti-SARS-CoV-2 potentiels.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont étudié si la circulation du SRAS-CoV-2 S ou de l’ARN était associée à la gravité du COVID-19 aigu et si la persistance des composants viraux était corrélée aux manifestations PASC.
Les niveaux de SARS-CoV-2 S et d’ARN dans le plasma obtenus à partir de 151 patients atteints de COVID-19 aigu (n = 116, symptomatiques et hospitalisés) ou de patients PASC ont été analysés, et leur diagnostic de COVID-19 a été confirmé par réaction en chaîne par polymérase (PCR) essais. Les patients COVID-19 aigus ont été classés sur la base de leurs scores de gravité/progression clinique de la maladie de l’Organisation mondiale de la santé (OMS) comme (i) COVID-19 modéré sans oxygène (O2) besoins (n = 39), (ii) COVID-19 modéré nécessitant une supplémentation en oxygène (n = 40) et (iii) COVID-19 sévère (n = 37).
Les individus étaient considérés comme des patients PASC s’ils présentaient ≥ 1 symptôme de COVID-19 pendant > 8 semaines après le diagnostic de COVID-19. De plus, 12 patients du biodépôt COVID aigu ont été inclus dans l’analyse. Des échantillons du groupe COVID-19 aigu ont été obtenus le jour initial de l’inscription et tous les trois jours jusqu’à la sortie de l’hôpital ou le décès.
Les échantillons du groupe PASC ont été obtenus le jour du recrutement ≥ 18 semaines après la période COVID-19 aiguë. L’ARN du SRAS-CoV-2 extrait des échantillons a été évalué par des tests de PCR numérique à transcription inverse (RT-ddPCR). De petites vésicules extracellulaires dérivées du plasma (SEV) ont été isolées et analysées, et les niveaux de SARS-CoV-2 S et SEV ont été mesurés par des dosages immuno-enzymatiques (ELISA).
Les données sur la démographie, les comorbidités, l’indice de masse corporelle (IMC), les symptômes du COVID-19 et la durée entre le dernier rapport positif au SRAS-CoV-2 et le recrutement de l’étude ont été obtenues à partir d’enquêtes REDCap et/ou de dossiers médicaux électroniques. Les enquêtes ont été menées au recrutement et tous les trois mois à l’aide du formulaire de rapport de cas sur les conditions post-COVID de l’OMS (post-COVID-19 CRF).
Résultats
Parmi les patients hospitalisés atteints d’infections aiguës par le SRAS-CoV-2, des corrélations positives ont été observées pour les dimères S et D du SRAS-CoV-2, la durée d’hospitalisation et les scores maximaux de l’OMS et entre les niveaux d’ARN du SRAS-CoV-2 et la LDH (lactate déshydrogénase, biomarqueur de lésions tissulaires). La comparaison de 33 patients PASC présentant des symptômes post-COVID-19 (PASC positifs) et de 14 patients PASC négatifs a montré une plus grande probabilité de présence du SRAS-CoV-2 et d’ARN viral chez les patients PASC (avec des niveaux considérablement plus élevés dans quelques cas ) par rapport aux patients atteints d’infections aiguës par le SRAS-COV-2.
La positivité de l’ARN du SRAS-CoV-2 était plus élevée chez les patients PASC atteints d’infections aiguës par le SRAS-CoV-2, alors que le SRAS-CoV-2 S était similaire entre les deux groupes. De plus, certaines protéines SARS-CoV-2 S étaient liées à des véhicules électriques sans ARN SARS-CoV-2 dans des vésicules. L’ARN du SRAS-CoV-2 a été trouvé chez 33 %, 35 % et 37 % des patients atteints de COVID-19 modéré sans besoin d’O2, de COVID-19 modéré avec besoin d’O2 et de COVID-19 sévère, respectivement, sans niveaux significativement différents parmi les groupes.
Les pourcentages correspondants pour les trois groupes pour la présence du SRAS-CoV-2 S étaient de 51 %, 68 % et 68 %, respectivement. Environ 45 %, 37 % et 50 % des échantillons SARS-CoV-2 S-positifs des groupes correspondants ont montré le SARS-CoV-2 S dans les véhicules électriques. Les niveaux d’ARN du SRAS-CoV-2 étaient significativement corrélés aux valeurs de l’IMC chez les patients atteints de COVID-19 sévère.
La positivité globale pour l’ARN du SRAS-CoV-2 et la protéine S était de 35 % et 62 %, respectivement, chez les patients COVID-19 aigus symptomatiques. Environ 34% et 6% des patients du groupe COVID-19 aigu étaient positifs uniquement pour le SRAS-CoV-2 S et uniquement pour l’ARN du SRAS-CoV-2 uniquement. Les symptômes du PASC étaient plus susceptibles de se développer chez les femmes présentant des comorbidités respiratoires telles que l’apnée obstructive du sommeil ou l’asthme.
Les patients PASC négatifs étaient plus susceptibles de souffrir de diabète, de maladies rénales et de maladies coronariennes et avaient plus de chances d’être hospitalisés en raison d’une COVID-19 aiguë. L’ARN du SARS-CoV-2 était présent chez 28 % des patients PASC négatifs (nombre de copies entre 0,1 et 2,1 copies/ul) et chez 59 % des patients PASC positifs (nombre de copies entre 0,1 et 12,7 copies/ul).
Le SARS-CoV-2 S était présent chez 14 et 21 patients PASC-négatifs et PASC-positifs, respectivement. Parmi les patients PASC-positifs, 33 % (n = 11) des échantillons étaient positifs pour le SRAS-CoV-2 S et l’ARN viral, 30 % (n = 10) étaient positifs pour le SRAS-CoV-2 S uniquement et 18 % (n =6) pour l’ARN du SRAS-CoV-2 uniquement. Cependant, aucun des patients PASC négatifs n’était positif pour les deux composants viraux. De plus, 53 % (n = 8) des patients PASC positifs ont montré une positivité pour le S lié à l’EV, et les niveaux étaient similaires à ceux trouvés chez les patients COVID-19 aigus, alors que les EV parmi les patients PASC négatifs étaient le SARS-CoV-2 S-négatif.
Conclusion
Dans l’ensemble, les résultats de l’étude ont démontré la persistance des fragments de SARS-CoV-2 S et d’ARN circulants chez les patients PASC (> 1 an de diagnostic de COVID-19 dans quelques cas), indépendamment de leur absence ou de leur présence dans la phase aiguë de COVID- 19. Les résultats ont également montré que le SRAS-CoV-2 S mais pas l’ARN était présent dans les SEV de plasma obtenus à partir de patients COVID-19 aigus ou de patients COVID longs.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
