Les résultats d’une étude sur le profilage moléculaire des tumeurs chez les jeunes patients ont révélé un taux élevé d’altérations génétiques susceptibles d’avoir un impact sur les soins cliniques, notamment la clarification des diagnostics et le traitement avec des médicaments anticancéreux de précision adaptés.
Reportage dans Médecine naturelle, des chercheurs du Dana-Farber/Boston Children’s Cancer and Blood Disorders Center ont déclaré que le profilage moléculaire des tumeurs solides a révélé des variations génétiques cliniquement significatives chez 298, soit 6 % des 345 patients pédiatriques. Chez 240 patients, l’« empreinte » génétique ou le schéma des changements liés au cancer dans l’ADN de la tumeur pourrait être utilisé pour choisir une thérapie ciblée et de précision adaptée à ces altérations. Parmi ces patients, 200 étaient éligibles à une pharmacothérapie adaptée.
Des thérapies ciblées ont été utilisées pour traiter 29 patients, et 24 % des patients ont répondu aux médicaments ciblés ou ont ressenti un bénéfice clinique durable. De plus, le profilage moléculaire – réalisé par un processus appelé séquençage de nouvelle génération – a clarifié la classification diagnostique chez 17 patients.
En fournissant un diagnostic plus précis ou en identifiant une thérapie ciblée, le profilage moléculaire des tumeurs a un impact significatif sur les soins que nous prodiguons. Le résultat est un traitement du cancer qui est plus efficace et, dans certains cas, a moins d’effets secondaires. »
Katherine A. Janeway, MD, MMSc, médecin-chef, Dana-Farber / Boston Children’s Cancer and Blood Disorders Center Directrice, génomique clinique, Dana-Farber Cancer Institute et professeure agrégée de pédiatrie, Harvard Medical School
L’étude en cours, connue sous le nom de GAIN/iCat2, est menée dans 12 centres aux États-Unis pour évaluer l’impact clinique du séquençage génomique des tumeurs solides pédiatriques, qui est beaucoup moins pratiqué que chez les patients adultes atteints de tumeurs solides. Chez l’adulte, le profilage tumoral est recommandé dans les guides de pratique nationaux comme aide au diagnostic et au traitement. Mais il n’existe pas de telles directives ou décisions de couverture d’assurance pour l’utilisation du profilage tumoral dans les tumeurs malignes solides pédiatriques et peu d’essais cliniques de profilage tumoral incluent des jeunes atteints de cancer.
Les tumeurs solides pédiatriques sont beaucoup plus rares que chez les adultes, et les grandes études sur les altérations génétiques sont difficiles à réaliser. En fait, 59 types de tumeurs différents affectaient les patients de cette étude et certains cancers sont si rares qu’ils n’affectaient qu’un seul patient. Les tumeurs pédiatriques ont également tendance à avoir moins de mutations génétiques que celles chez les adultes, il y a donc moins de cibles pour les médicaments à attaquer – et moins de médicaments disponibles pour les cibler. Le résultat net est que la plupart des tumeurs solides chez les enfants sont traitées avec une chimiothérapie ou une radiothérapie standard plutôt qu’avec des agents médicamenteux de précision.
L’étude actuelle est une étude de cohorte observationnelle prospective dirigée par Janeway et Alanna J. Church, MD, directrice associée de la pathologie pédiatrique moléculaire à l’hôpital pour enfants de Boston et Katherine A. Janeway, MD, MMSc, directrice de la génomique clinique à Dana-Farber et Boston Enfants. Janeway s’est efforcée d’apporter des traitements personnalisés et moléculairement ciblés aux enfants atteints de cancer. Les résultats de la première étude de Janeway, intitulée Individualized Cancer Therapy (iCat), ont été publiés en 2016 et ont montré qu’il était possible d’intégrer le séquençage génomique clinique à la pratique de l’oncologie pédiatrique. Janeway et ses collègues mènent actuellement une étude de suivi, le Consortium d’évaluation génomique améliore la nouvelle thérapie (GAIN), étude iCat2.
Les participants à l’étude étaient des patients atteints de tumeurs non cérébrales en rechute/réfractaires ou à haut risque à l’âge de 30 ans ou moins ; l’âge moyen au moment du diagnostic était de 12 ans. Les chercheurs ont effectué un séquençage d’ADN de nouvelle génération ciblé avec des tests OncoPanel sur un ou plusieurs échantillons de tumeur de chaque patient, certains échantillons étant également soumis à un séquençage d’ARN. Sur la base de l’analyse, un rapport complet est créé et envoyé au médecin traitant. Cela permet au médecin de développer un plan pour le patient qui prend en compte les changements génétiques détectés dans leurs tumeurs qui sont associés à des médicaments appariés qui ont donné du succès en laboratoire ou en clinique dans le traitement de patients atteints de telles tumeurs. L’étude suit chaque patient afin de déterminer l’impact du plan de traitement sur les résultats du patient. L’objectif principal de l’étude est d’observer si le profilage de la tumeur et le traitement médicamenteux ciblé correspondant affectent la survie globale.
Des recommandations pour la thérapie moléculaire ciblée (MTT) basées sur les données de la précédente étude iCat ont été renvoyées à 240 des 345 patients dont les tumeurs avaient au moins une variante génétique. Parmi ceux-ci, 200 patients étaient éligibles pour l’évaluation de la réception et de la réponse au MTT, étant en vie et disposant de données de suivi complètes. Quatre-vingt-seize des patients n’auraient pas dû envisager un traitement ciblé parce qu’ils recevaient un traitement de première intention, n’avaient pas reçu de traitement systémique contre le cancer pendant la période de suivi ou qu’aucun médicament ciblé correspondant n’était disponible.
Sept patients qui ont reçu une thérapie ciblée appariée ont eu des réponses significatives mesurables à la thérapie. Dans six de ces tumeurs, les thérapies correspondaient à une fusion de gènes. Les gènes de fusion se forment dans une cellule lorsqu’un morceau d’un chromosome se détache et s’attache à un autre chromosome, provoquant la fusion de segments d’ADN brisés pour former un gène entièrement nouveau. Certains de ces gènes produisent des protéines de fusion qui peuvent entraîner une croissance incontrôlable des cellules et la formation de tumeurs.
« Les fusions de gènes sont très importantes dans les tumeurs pédiatriques », explique Church. « C’est une période passionnante car il y a tellement de nouveaux médicaments qui peuvent cibler ces fusions et nous avons de nouveaux tests qui peuvent les détecter de manière fiable. »
Church et Janeway espèrent que leurs travaux contribueront à faire du profilage génomique la norme de soins pour les tumeurs solides pédiatriques nouvelles ou récidivantes, remboursables par l’assurance – ; comme c’est le cas pour les adultes.
« Nous savons qu’il y a des patients qui n’ont pas accès à ces tests parce qu’ils ne sont pas remboursés de manière cohérente », déclare Church. « Nous voulons élargir l’accès au profilage moléculaire pour chaque enfant atteint d’une tumeur solide. »
