LUAD est le sous-type histologique le plus courant du cancer du poumon. Bien que la chirurgie puisse être curative pour les patients diagnostiqués à un stade précoce, environ 30 à 50 % développent une récidive ou des métastases agressives dans les cinq ans. Des marqueurs moléculaires plus efficaces sont donc nécessaires pour améliorer l’évaluation et le suivi des risques postopératoires. L’eccDNA est une classe de molécules d’ADN circulaire double brin qui existe indépendamment des chromosomes et peut être détectée à la fois dans le tissu tumoral et dans le plasma. Son implication dans l’évolution, l’hétérogénéité, les métastases et la résistance au traitement des tumeurs suscite un intérêt croissant, mais les caractéristiques de l’eccDNA associées à la récidive LUAD à un stade précoce restent incomplètement comprises.
Publié dans Médecine clinique de précision le 6 juillet 2026 (DOI : 10.1093/pcmedi/pbag017), l’étude a été menée par des chercheurs de l’Université Jiaotong du Sud-Ouest, du Troisième Hôpital populaire de Chengdu, de l’Université de médecine traditionnelle chinoise de Chengdu et de l’Hôpital populaire de Deyang. L’étude a recruté 90 patients naïfs de traitement atteints de LUAD à un stade précoce et a collecté des tissus tumoraux, des tissus non tumoraux adjacents et des échantillons de plasma. Des ensembles de données Circle-seq et multi-omiques publics ont ensuite été intégrés pour étudier la distribution génomique, l’activité transcriptionnelle, les caractéristiques de la chromatine et la pertinence clinique potentielle de l’eccDNA.
Les résultats ont montré que les eccDNA provenant de tumeurs récurrentes avaient un contenu en GC plus élevé et des signaux de lecture fractionnée plus forts que ceux provenant de tumeurs non récurrentes. Ils étaient également préférentiellement dérivés de régions génomiques transcriptionnellement actives, notamment les exons, les îlots CpG et les compartiments de la chromatine A, et étaient associés à des modifications actives des histones. Les eccDNA associés à la récidive portaient plusieurs gènes impliqués dans les voies liées au cancer, notamment la signalisation mTOR, Notch et Ras. Des différences ont également été observées dans l’expression des facteurs immunitaires associés à l’eccDNA et de leurs récepteurs, ce qui suggère une relation possible entre l’eccDNA et une signalisation immunitaire altérée dans les LUAD récurrents.
Dans le plasma, les chercheurs ont identifié 2 387 eccDNA qui étaient couramment régulés positivement dans les échantillons de cancer du poumon et associés à la récidive. Les gènes liés à ces signaux d’eccDNA plasmatique ont été intégrés aux données publiques de transcriptomique et de survie, conduisant à la sélection de sept gènes (AFAP1L2, LHX8, IL20RB, SLC12A8, EGLN3, CDH3 et PLTP) pour la construction d’un modèle de risque de récidive. Le modèle a systématiquement distingué les patients présentant différents résultats DFS (survie sans maladie) dans les cohortes de formation et de validation. Ensemble, ces résultats fournissent une vision multi-omique de l’eccDNA associé à la récidive dans LUAD et soutiennent son potentiel en tant que source de biomarqueurs pronostiques. Une validation plus poussée dans des cohortes prospectives plus larges pourrait faciliter le développement d’approches basées sur l’eccDNA pour une évaluation et une surveillance individualisées des risques postopératoires.
