L’effet de l’immunité induite par la vaccination sur les charges virales de la variante SARS-CoV-2 Omicron

Dans une étude récente publiée dans Communication Natureles chercheurs ont analysé les données de vaccination à l’échelle nationale et les données de valeur seuil du cycle de quatre laboratoires en Israël qui effectuent des tests quantitatifs de réaction en chaîne par polymérase de transcription inverse (qRT-PCR) du coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2) pour déterminer l’effet de la vaccination- immunité induite sur les charges virales du variant SARS-CoV-2 Omicron.

Arrière plan

Les tests d’efficacité des vaccins impliquent généralement de mesurer les titres d’anticorps neutralisants et d’examiner les effets protecteurs des réponses immunitaires contre l’infection et les symptômes graves. La transmissibilité du virus déterminée par la charge virale est souvent négligée. Cependant, la charge virale a des implications importantes pour les initiatives de santé publique. Les valeurs seuils de cycle des tests qRT-PCR, qui sont négativement corrélées à la charge virale, peuvent être utilisées pour déterminer la transmissibilité et l’infectiosité du variant viral.

Malgré une vaccination complète et des schémas de rappel parmi une grande partie de la population, Israël a connu une résurgence de la variante SARS-CoV-2 Omicron, incitant à l’administration d’une quatrième dose de rappel aux travailleurs de la santé, à la population âgée et aux personnes à haut risque. Cependant, alors que des études ont examiné l’impact de l’immunité induite par la vaccination sur les charges virales de la variante Delta, l’efficacité des vaccins pour réduire les charges virales de la variante Omicron reste inexplorée.

À propos de l’étude

Dans la présente étude, les chercheurs ont mené une analyse rétrospective à l’aide de données de vaccination et d’enregistrements de tests PCR SARS-CoV-2 positifs, y compris les valeurs seuils de cycle de quatre grands laboratoires israéliens de l’Organisation de maintien de la santé. Plusieurs tests positifs pour le même individu sur une période de 90 jours ont été considérés comme une seule infection.

Les informations démographiques ont été combinées avec les résultats des tests PCR cryptés et les données de vaccination pour fournir le statut vaccinal, la valeur seuil du cycle, l’âge et le sexe de chaque patient. Les patients ont ensuite été regroupés selon le statut vaccinal lors de l’événement infectieux, le statut vaccinal lors de l’infection étant défini comme non vacciné, deux doses avec une infection dans les 10–39, 40–69, ou plus de 70 jours après la deuxième dose, trois doses avec une infection dans les 10 à 39, 40 à 69 ou plus de 70 jours après la troisième dose, quatre doses et non vaccinés avec une infection antérieure par le SRAS-CoV-2.

La période de suivi a également été divisée en fonction de la variante dominante du SRAS-CoV-2, la période du 15 juin au 1er décembre 2021 étant la période de dominance de la variante Delta, et du 28 décembre 2021 au 29 janvier 2022, étant la période de dominance d’Omicron.

Une analyse de régression linéaire multivariée a été effectuée pour les valeurs seuils du cycle avec le statut vaccinal, l’âge, le sexe, l’heure civile et le laboratoire utilisés comme covariables. L’analyse a également été menée séparément pour les tests PCR qui amplifiaient le gène de la nucléocapside du SRAS-CoV-2 et ceux qui mesuraient le gène de l’enveloppe.

Résultats

Les résultats ont indiqué que si les vaccins réduisaient les charges virales de la variante Omicron à court terme, l’effet du vaccin sur les valeurs seuils du cycle n’était pas de longue durée. En revanche, l’immunité induite par les précédentes infections par le SRAS-CoV-2 a diminué moins lentement.

Au cours de la dominance de la variante Delta, deux doses de vaccin ont produit une triple diminution des charges virales par rapport aux patients non vaccinés, mais l’efficacité de la deuxième dose a diminué au jour 70, avec des valeurs seuils du cycle des patients avec deux doses étant les mêmes que celles des patients non vaccinés. La première dose de rappel (troisième vaccin) a montré une tendance similaire, les valeurs seuils du cycle étant élevées à court terme mais diminuant au jour 70.

Les valeurs seuils du cycle pour les tests PCR au cours de la période Omicron ont augmenté en réponse à une troisième dose de vaccin récente, mais n’étaient pas significativement différentes pour les patients non vaccinés, à deux doses et à trois doses tardives. Les résultats ont indiqué que l’effet de l’immunité induite par la vaccination était plus faible pour la variante Omicron que pour la variante Delta.

L’analyse a été menée séparément pour les patients âgés ayant reçu la quatrième dose de vaccin. Les résultats ont révélé une augmentation des valeurs seuils du cycle pour ces patients, avec des valeurs comparables à celles des patients ayant déjà été infectés par le SRAS-CoV-2 et significativement supérieures à celles des patients non vaccinés. La quatrième dose a été jugée efficace à court terme pour réduire la charge virale.

conclusion

Pour résumer, l’étude a comparé le statut vaccinal aux valeurs seuils du cycle des tests PCR SARS-CoV-2 positifs des patients qui ont eu une infection pendant la dominance des variantes Delta et Omicron.

Les résultats ont indiqué que l’effet immunitaire du vaccin sur les charges virales a diminué au jour 70 pour les doses primaires et de rappel. En comparaison, l’immunité induite par les précédentes infections par le SRAS-CoV-2 s’est affaiblie beaucoup plus lentement. Une quatrième dose de rappel a montré des effets protecteurs significatifs et une diminution de la charge virale, avec des valeurs seuils de cycle comparables à celles des patients ayant des infections antérieures.

Alors que les vaccinations ont été extrêmement efficaces pour réduire la morbidité et la mortalité, l’effet décroissant sur la réduction de la transmissibilité du virus nécessite une réévaluation des campagnes de vaccination.