Une étude récente publiée dans l’Eurosurveillance Journal a décrit des infections graves et mortelles chez les nouveau-nés causées par une nouvelle variante de l’échovirus 11 (E-11) en France.
Étude: Infections néonatales graves et mortelles liées à un nouveau variant de l’échovirus 11, France, juillet 2022 à avril 2023. Crédit d’image : KomsanLoonprom/Shutterstock.com
Sommaire
Arrière-plan
Les entérovirus provoquent généralement des infections chez les nouveau-nés. La manifestation clinique varie d’une maladie asymptomatique à une maladie grave ou à la mort. Neuf cas néonatals de maladie avec insuffisance hépatique ont été signalés en France de juillet 2022 à avril 2023.
Sept décès ont été signalés parmi eux. Tous étaient associés à une nouvelle variante E-11. Dans la présente étude, les chercheurs ont décrit les caractéristiques de cette poussée d’infections néonatales graves.
Description du cas
Les neuf cas, tous de sexe masculin, provenant de trois agglomérations françaises ont été admis en réanimation pédiatrique pour suspicion de septicémie.
Huit patientes étaient issues de grossesses gémellaires et une seule était née à terme d’une grossesse unique ; tous étaient nés entre 31 et 36 semaines de grossesse et avaient été initialement hospitalisés dans des services de néonatologie avant l’apparition des symptômes.
Les premiers symptômes (fièvre et apnée) sont apparus trois à cinq jours après la naissance. Les symptômes initiaux ont été rapidement suivis de signes de choc septique nécessitant une réanimation active.
Une insuffisance hépatocellulaire aiguë avec cytolyse sévère a été observée chez tous les patients le jour de l’hospitalisation. Le facteur de Quick, le fibrinogène et les facteurs de coagulation sanguine II, V, VII et X n’étaient pas détectables dans tous les cas.
Les patients ont présenté une hyperammoniémie ; trois ont été traités par hémodialyse, cinq par du benzoate de sodium et un a succombé avant le début du traitement. Une thrombocytopénie a été observée chez tous les patients ; sept nécessitaient du plasma, des plaquettes et de l’acide tranexamique.
Deux patients présentaient une entérocolite, trois cas une méningo-encéphalite et un une myocardite. De plus, une insuffisance rénale aiguë au début des symptômes a été observée dans tous les cas.
Cinq patients avaient des résultats normaux à l’échographie transfontanelle, tandis que deux patients présentaient une hémorragie intraventriculaire bilatérale de grade III et deux autres présentaient plusieurs lésions hyperéchogènes de la substance blanche.
Les hémocultures pour les bactéries étaient négatives dans les 48 heures suivant l’apparition des symptômes pour sept patients. Cependant, un patient a été testé positif pour Staphylocoque épiderme, et un autre était positif pour Escherichia coli.
Le génome entéroviral a été détecté dans tous les échantillons, y compris le liquide céphalo-rachidien, le sang, les selles, les taches de sang séché, les biopsies post-mortem et les écouvillons nasopharyngés, de la gorge et du rectum. Le séquençage de nouvelle génération a identifié E-11 comme agent causal dans tous les cas.
Cinq mères présentaient des symptômes gastro-intestinaux au moment de l’accouchement ou avant, et quatre échantillons de sang péripartum étaient disponibles.
Les échantillons maternels étaient positifs pour l’entérovirus et ont ensuite été identifiés comme E-11. Un traitement antibiotique empirique a été débuté dès l’apparition des symptômes chez tous les patients. Le pocapavir a été utilisé pour le traitement de trois cas et des immunoglobulines intraveineuses polyvalentes ont été administrées à sept patients.
Sur les neuf cas, sept patients sont décédés entre cinq et 40 jours de vie. Deux patients ont survécu sans séquelles.
Caractérisation moléculaire et surveillance
Les chercheurs ont effectué des analyses phylogénétiques des séquences E-11 à partir d’échantillons collectés au cours de la période 2010-23 en France et ceux d’autres pays disponibles dans la GenBank.
Les souches E-11 séquencées en 2022 et 2023 se sont divisées en deux lignées différentes (1 et 2), distinctes des souches E-11 pré-2022. La lignée 1 comprenait des séquences associées à des infections néonatales non néonatales et sévères non sévères.
La lignée 2 comprenait les séquences E-11 françaises restantes de 2022, liées à celles isolées en 2018-19 en Chine. Une origine recombinante a été impliquée pour les deux lignées par l’analyse du tracé de similarité.
Plus de 2 000 cas d’entérovirus ont été signalés en France de janvier 2022 à avril 2023. Parmi ceux-ci, 24,5 % des patients étaient des nouveau-nés, et E-11 était le type d’entérovirus prédominant chez les nouveau-nés et les non-nouveau-nés.
L’E-11 a été systématiquement détecté en France depuis avril 2022. En 2022-23, 28 cas néonatals ont présenté une infection entérovirale sévère. Parmi ceux-ci, 14 cas ont été identifiés comme E-11.
En revanche, 62 cas néonatals graves ont été documentés entre 2016 et 2021, et l’E-11 a été détecté dans 6,2 % des cas. De plus, les nouveau-nés de sexe masculin étaient surreprésentés parmi les cas graves d’entérovirus ou d’E-11.
Remarques finales
Dans son ensemble, l’étude suggère qu’un nouveau variant E-11 associé à un risque accru d’infection néonatale sévère et de mortalité circule en France. Les cliniciens doivent être vigilants quant à l’implication potentielle des entérovirus dans les présentations graves chez les nouveau-nés.
Les nouveau-nés présentant un sepsis inexpliqué avec des signes d’insuffisance hépatique (avec cytolyse) et une myocardite doivent être évalués pour une infection à entérovirus, en particulier si la mère présentait des symptômes avant l’accouchement, et un traitement par pocapavir ou immunoglobulines doit être envisagé.
