Le risque de développer des maladies telles que le diabète de type 2 ou le cancer du sein peut être influencé par des milliers de différences génétiques. L’examen d’une seule différence d’ADN qui a un petit effet sur le risque peut ne pas être cliniquement utile, mais lorsque des centaines ou des milliers de ces petits risques sont additionnés en un seul score, souvent appelé score de risque polygénique (PRS), ils peuvent offrir cliniquement des informations significatives sur le risque de maladie d’une personne. Dans un nouvel article publié dans médecine naturelle, des chercheurs du Brigham and Women’s Hospital, du système de santé Boston Veterans Affairs (VA) et de la Harvard Medical School ont développé et validé des scores de risque polygénique pour six maladies courantes. L’équipe a également développé des ressources d’information pour chaque maladie afin d’aider les médecins et les patients à discuter de la manière d’intégrer la PRS lors de la prise de décisions médicales concernant le dépistage et la prévention.
En tant que médecin de soins primaires moi-même, je savais que les médecins occupés n’auraient pas le temps de suivre un cours complet sur les scores de risque polygénique. Au lieu de cela, nous voulions concevoir un rapport de laboratoire et des ressources d’information qui indiquaient succinctement au médecin et au patient ce qu’ils devaient savoir pour prendre une décision sur l’utilisation d’un résultat de score de risque polygénique dans leurs soins de santé. »
Jason Vassy, MD, MPH, auteur correspondant, Brigham’s Division of General Internal Medicine & Primary Care, Brigham’s Precision Population Health at Ariadne Labs et VA Boston
Vassy et ses collègues ont développé les scores de risque dans le cadre de l’étude Genomic Medicine at VA (GenoVA), un essai clinique randomisé de test PRS chez des adultes généralement en bonne santé. L’équipe de l’étude a développé et validé un test de laboratoire au Mass General Brigham Laboratory for Molecular Medicine (LMM) pour les scores de risque polygénique de fibrillation auriculaire, de maladie coronarienne, de diabète de type 2, de cancer du sein, de cancer colorectal et de cancer de la prostate.
L’étude GenoVA recrute actuellement des patients au VA Boston Healthcare System, et les chercheurs ont rapporté les résultats des 227 premiers patients, parmi lesquels 11 % présentaient un score de risque polygénique élevé pour la fibrillation auriculaire, 7 % pour la maladie coronarienne, 8 % pour le diabète de type 2 et 6 % pour le cancer colorectal. Parmi les hommes, 15 % avaient un score élevé pour le cancer de la prostate, tandis que 13 % des femmes avaient un score élevé pour le cancer du sein. L’étude GenoVA recrutera finalement plus de 1 000 patients et les suivra pendant deux ans pour observer comment eux-mêmes et leurs prestataires de soins primaires utilisent les scores de risque polygénique dans les soins cliniques. Par exemple, les patients à haut risque peuvent choisir de subir des tests de dépistage plus fréquemment ou de prendre des médicaments préventifs qui peuvent réduire leur risque.
Les chercheurs ont dû relever de nombreux défis lors de la mise en œuvre d’un test PRS en laboratoire clinique. Plus important encore, leurs propres observations ont confirmé un problème déjà connu à propos de ces scores : ils sont moins précis chez les personnes d’origine non européenne. La plupart des recherches génomiques à ce jour ont été menées dans des populations européennes, de sorte que les scores résultant de ces recherches ont une capacité plus faible à prédire le risque de maladie parmi les populations non européennes. La mise en œuvre d’un score de risque polygénique dans les soins cliniques qui n’est exact que pour les personnes d’origine européenne exacerberait les disparités existantes en matière de santé. Pour remédier à cette limitation importante, les chercheurs ont appliqué des méthodes statistiques supplémentaires pour permettre le calcul du PRS dans plusieurs groupes raciaux.
« Les chercheurs doivent continuer à travailler pour accroître la diversité des patients participant à la recherche en génomique », a déclaré Matthew Lebo, PhD, directeur de laboratoire en chef au LMM. « Entre-temps, nous avons été encouragés de voir que nous pouvions générer et mettre en œuvre des scores génétiques valides pour des patients d’horizons divers. »
À ce jour, 52 % des participants à l’étude GenoVA déclarent être de race non blanche et/ou d’origine hispanique/latinx.
Un autre défi majeur pour amener le score de risque polygénique à la médecine clinique est que les médecins et les patients auront besoin de soutien pour les comprendre et les utiliser pour prendre des décisions médicales. Il n’existe pas encore de lignes directrices cliniques pour aider un médecin à savoir si et comment il doit traiter un patient à risque élevé différemment d’un patient à risque moyen, mais l’étude fournit du matériel éducatif axé sur le médecin et le patient pour les aider à intégrer le résultats. De plus, les patients et les médecins de soins primaires peuvent demander l’aide d’un conseiller en génétique dans le cadre de l’étude.
Les chercheurs espèrent que ce premier rapport de l’étude GenoVA sera un guide utile pour d’autres laboratoires et systèmes de soins de santé qui cherchent à mettre en œuvre des tests de score de risque polygénique dans les soins aux patients. « Il est encore très tôt pour la prévention de précision », déclare Vassy, »mais nous avons montré qu’il est possible de surmonter certains des premiers obstacles à l’introduction des scores de risque polygénique dans la clinique. »
