Des scientifiques de l'HudsonAlpha Institute for Biotechnology, de l'Université de Californie à San Francisco (UCSF) et de l'Université d'Alabama à Birmingham (UAB) ont identifié un nouveau facteur de risque de multiples maladies neurodégénératives.
« Il est passionnant de trouver des preuves d'un facteur de risque qui contribue à de multiples maladies neurodégénératives », a déclaré Richard M. Myers, PhD, président et directeur scientifique d'HudsonAlpha. « Nous savons déjà que ces maladies partagent certaines pathologies. Ce travail montre que les causes sous-jacentes de ces pathologies peuvent également être partagées. »
Dans l'étude, publiée le 23 avril dans le Journal américain de génétique humaine, les chercheurs ont séquencé et analysé des génomes entiers de plus de 1 100 personnes.
Ils ont découvert qu'une variation rare du gène TET2 doublait presque le risque de développer des maladies comme la maladie d'Alzheimer (MA), la sclérose latérale amyotrophique (SLA) et la démence frontotemporale (FTD).
Le projet n'aurait pas été possible sans une collaboration étendue entre les institutions. Vous finissez par être en mesure de trouver des choses que vous ne pouvez pas trouver seul. «
Nicholas Cochran, PhD, premier auteur de l'étude et scientifique principal au Myers Lab
Jennifer Yokoyama, PhD, professeur adjoint de neurologie à l'UCSF, a travaillé avec Cochran sur les détails techniques et était également la personne de référence pour la collecte d'échantillons. La majorité des échantillons utilisés pour le projet ont été collectés pendant des décennies au UCSF Memory and Aging Center, puis séquencés et analysés à HudsonAlpha.
Une fois que l'équipe de recherche a eu les résultats de la séquence, ils ont analysé les génomes de 493 personnes avec AD, ALS ou FTD et 671 personnes en bonne santé. Beaucoup de patients avaient des versions précoces de maladie neurodégénérative, ce qui suggère qu'il est plus probable qu'il y aurait une composante génétique de leur maladie.
Au cours de l'analyse du génome, les chercheurs ont examiné à la fois les régions codantes et non codantes du génome pour les variantes de séquence d'ADN, une stratégie qui leur a permis d'être plus confiant que tous les gènes possibles qu'ils avaient retirés étaient la vraie affaire.
« Nous n'avons pas soupçonné ce que nous pourrions (obtenir), nous sommes donc ravis d'avoir trouvé une nouvelle association génétique ici », a déclaré Cochran.
TET2 est particulièrement excitant car il code pour une protéine qui catalyse la déméthylation de l'ADN. Des travaux antérieurs ont montré que des changements dans la méthylation de l'ADN se produisent pendant le vieillissement, de sorte que les auteurs émettent l'hypothèse que des mutations dans le gène pourraient conduire à une protéine TET2 défectueuse qui perturbe la façon dont le cerveau vieillit et contribue au développement de maladies neurodégénératives.
« Parfois, nous obtenons un coup, et il est difficile de comprendre ce qu'il pourrait faire, mais TET2 a déjà établi des rôles dans le cerveau. Donc, cette découverte était vraiment logique », a expliqué Cochran.
Après avoir identifié le TET2, l'équipe a examiné les données génétiques précédemment générées par plus de 32 000 personnes en bonne santé et personnes atteintes de maladies neurodégénératives.
Ces données ont confirmé que les variantes de TET2, dans les régions codant pour les protéines et non codantes, étaient plus susceptibles d'être présentes dans les génomes des personnes atteintes de MA, SLA ou FTD que chez les personnes sans ces maladies. Les prochaines étapes se concentreront sur la façon dont les changements dans les niveaux ou la fonction de TET2 pourraient contribuer au vieillissement et aux maladies neurodégénératives.
La source:
HudsonAlpha Institute for Biotechnology
