Dans une étude récente publiée dans le Journal du forum ouvert sur les maladies infectieuses (OFID)les chercheurs ont rapporté que le coronavirus-2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) pouvait être détecté par olfaction canine.
À l’échelle mondiale, la pandémie de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) a entraîné plus de 520 millions de cas et plus de 6,26 millions de décès à ce jour. En conséquence, différentes méthodes de dépistage ont été développées pour détecter le SRAS-CoV-2, telles que les tests de réaction en chaîne par polymérase (PCR), les tests antigéniques et le dépistage thermique.
Bien que les tests PCR soient l’étalon-or, ils sont coûteux, invasifs et produisent des résultats retardés ; de même, le dépistage thermique est un marqueur inefficace du COVID-19, compte tenu de sa moindre sensibilité. Par conséquent, des méthodes de dépistage et de test non invasives, moins coûteuses et efficaces sont nécessaires. Le diagnostic précoce des personnes infectées, en particulier des personnes pré- ou asymptomatiques, est essentiel pour réduire la propagation virale et empêcher une progression grave de la maladie.
Certaines études ont montré que les cultures bactériennes et virales contiennent des composés organiques volatils (COV) associés aux agents pathogènes. L’identification des modèles de COV du SRAS-CoV-2 pourrait être une stratégie de dépistage rapide et prometteuse. De plus, les preuves suggèrent que le SRAS-CoV-2 émet des COV distincts par la salive, l’urine ou la sueur des personnes infectées, ce qui peut également convenir à la détection virale par les chiens odorants.
Étude : Détection du SRAS-CoV-2 par olfaction canine : une étude pilote. Crédit d’image : Shrikar S / Shutterstock
À propos de l’étude
Les chercheurs de la présente étude ont examiné la capacité des chiens de détection médicale à distinguer les échantillons de sueur positifs pour le SRAS-CoV-2 des échantillons de sueur témoins (négatifs pour le SRAS-CoV-2). La population étudiée comprenait ceux qui ont passé des tests PCR de transcriptase inverse (RT) pour le SRAS-CoV-2. Ils étaient éligibles indépendamment de la présentation des symptômes ou du statut d’hospitalisation, bien que ceux atteints d’une maladie grave nécessitant une ventilation mécanique aient été exclus. Ceux qui avaient des antécédents de COVID-19 au cours des 90 derniers jours ont été exclus. Les échantillons de cas ont été définis comme ceux dont les tests SARS-CoV-2 sont positifs et les témoins comme ceux dont les résultats sont négatifs.
Des échantillons de test ont été prélevés sur différents sites pour s’assurer que les chiens n’étaient pas conditionnés à des environnements de prélèvement d’échantillons. La formation à la détection des odeurs a été dispensée sur le campus d’Assistance Dogs of Hawaii dans un 9,13 m2 chambre avec régulation de température. Adjacent à la salle de formation se trouvait un laboratoire avec une fenêtre d’intimité à sens unique permettant l’observation des essais en double aveugle. Les échantillons de sueur ont été transférés des tampons de coton dans des gobelets stériles et placés séparément dans des boîtes de détection d’odeur. Les boîtes étaient espacées de manière appropriée les unes des autres et la taille des coupelles d’échantillons à l’intérieur des boîtes garantissait que les échantillons n’étaient pas accessibles par la bouche ou le nez du chien.
Les chiens ont été entraînés à l’aide de modèles basés sur la récompense avec des échantillons positifs et négatifs adéquats. Tout d’abord, les chiens ont été entraînés à identifier les échantillons positifs, puis à distinguer les échantillons positifs des témoins. Les réponses canines ont été comparées aux résultats de laboratoire et notées pour leur précision. Après l’entraînement, les chiens ont été inclus dans la phase de test, dans laquelle le collecteur de données et les maîtres-chiens étaient aveugles à l’analyse, et seul le maître-échantillon n’était pas aveugle.
Les réponses correctes étaient renifler et piaffer/s’asseoir sur les échantillons de cas (vrai positif) et renifler mais pas s’asseoir/piaffer sur les échantillons témoins (vrai négatif). Les réponses incorrectes comprenaient le reniflement et la piaffe/assis sur les échantillons de contrôle (faux positifs) et le reniflement mais pas assis/papoté sur les échantillons de cas (faux négatifs). Lorsque les chiens ont répondu correctement, le maître-chien a fait un signal et les chiens ont été récompensés avec de la nourriture par le maître-chien.
Résultats de l’étude
Des échantillons de test ont été prélevés sur 584 personnes (patients hospitalisés et externes) âgés de 6 à 97 ans (moyenne de 40 ans). Il y avait 141 échantillons de cas (SARS-CoV-2-positif) et 443 contrôles. La phase d’entraînement comprenait trois labradors et un Golden Retriever, mais la phase de test ne comptait que les labradors. Lors de la phase de test, 52 échantillons de cas et 208 témoins ont été utilisés.
Dans l’ensemble, les trois chiens ont détecté des échantillons positifs pour le SRAS-CoV-2 avec une sensibilité et une spécificité de 0,98 et 0,92, respectivement. La valeur prédictive positive était de 0,8 et la valeur prédictive négative était de 0,99. La sensibilité diagnostique des chiens individuels variait légèrement entre 0,96 et 1,00, mais la variation de spécificité était légèrement plus élevée, c’est-à-dire de 0,87 à 0,99.
Enfin, les chercheurs ont mené une étude pilote (phase d’implantation) pour déterminer l’applicabilité de la détection de l’odeur canine en milieu hospitalier. L’un des trois Labradors a examiné des échantillons de patients dans une chambre d’hôpital désignée. Le chien a examiné 153 nouveaux échantillons dont les résultats du test PCR étaient en attente. De plus, 16 échantillons de cas précédemment inutilisés ont été inclus pour garder le sog motivé. Les réponses du chien ont été enregistrées et comparées ultérieurement aux résultats de la PCR une fois qu’ils étaient disponibles. Au total, le chien a démontré une sensibilité de 96,4 % et une spécificité de 100 %.
conclusion
Les présents résultats ont démontré que la détection des odeurs par les chiens était un outil de diagnostic pour dépister les individus positifs au SRAS-CoV-2 de manière plus sûre, non invasive, peu coûteuse et efficace. L’olfaction canine représente une méthode réalisable et précise pour diagnostiquer le SRAS-CoV-2. En outre, les chercheurs ont suggéré que des chiens de détection médicale pourraient être déployés dans les écoles et les hôpitaux pour détecter le virus afin de freiner la propagation de l’infection.
