La maladie à coronavirus (COVID-19), causée par l’agent pathogène du syndrome respiratoire aigu sévère coronavirus 2 (SARS-CoV-2), continue de se propager dans le monde, infectant plus de 182 millions de personnes. Au cours du processus de division et de réplication, des erreurs dans la constitution génétique du SRAS-CoV-2 provoquent sa mutation. Les mutations du virus peuvent affecter sa transmissibilité et son infectiosité. Certains peuvent aider le virus à échapper au système immunitaire, ce qui peut rendre les vaccins moins efficaces, tandis que d’autres ont peu d’influence.
Des chercheurs de l’Université de Cambridge, du MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research, du Pirbright Institute, du MRC Laboratory of Molecular Biology et de Vir Biotechnology ont cherché à déterminer comment le SRAS-CoV-2 échappe au système immunitaire, menaçant l’efficacité des vaccins développés .
L’étude, publiée dans la revue Rapports de cellule, ont montré que les mutations du virus, en particulier la délétion de deux acides aminés H69/V70 observée dans le variant Alpha (B.1.1.7), permet au virus de surmonter ses faiblesses au cours de son évolution.
La variante Alpha
Plusieurs nouvelles variantes du SRAS-CoV-2 se propagent rapidement, et certains craignent que cela signifie que les vaccins actuellement autorisés pour le COVID-19 pourraient ne pas offrir de protection. La plupart des variantes impliquent la protéine de pointe trouvée à la surface du virus, ce qui facilite la fixation et l’entrée dans les cellules. Actuellement, tous les vaccins sont dirigés contre la protéine de pointe.
La variante Alpha, également appelée B.1.1.7, est apparue au Royaume-Uni fin 2020. Elle contient les substitutions de protéines de pointe N501Y, 69del, 70del, 144del, E484K, S494P, A570D, D614G, P681H, T716l, D1118H et S982A. . Les caractéristiques notables de cette variante préoccupante comprennent une transmission accrue de 50 pour cent et une gravité potentielle accrue.
Dans l’étude, l’équipe a analysé les données mondiales du SRAS-CoV-2 et a découvert que H69/V70 se produit indépendamment, émergeant souvent après un remplacement important d’acides aminés du domaine de liaison au récepteur (RBD) comme Y453F et N439K, qui sont connus pour faciliter la neutralisation des anticorps. s’échapper. Ils altèrent également la liaison de l’enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (ACE2) tout en maintenant un défaut d’infectiosité.
Suppression H69/V70
Dans des conditions de sécurité, le professeur Gupta et ses collègues ont utilisé une forme inoffensive de SRAS-CoV-2 qui ne peut pas se répliquer mais qui a la suppression de l’acide aminé clé H69/V70 pour étudier comment la protéine interagit avec les cellules hôtes et pourquoi la suppression est si importante . L’équipe a testé le virus contre des échantillons de sang de 15 personnes qui se sont rétablies de l’infection par le SRAS-CoV-2.
Dans leur étude, les chercheurs ont découvert que la délétion ne permettait pas au virus d’échapper aux anticorps neutralisants acquis lors d’infections ou de vaccinations antérieures. En fait, la délétion a rendu le virus deux fois plus infectieux, le rendant plus capable de se fixer et d’envahir les cellules saines.
De plus, les particules virales portant la délétion avaient des protéines de pointe plus matures, permettant au virus de se répliquer plus efficacement. Les chercheurs ont découvert que les suppressions permettaient aux virus non seulement de s’échapper du système immunitaire, mais aussi de compenser les mutations qui provoquaient des effets négatifs. Ce faisant, le virus est capable de pénétrer les lacunes de l’armure protectrice du système immunitaire.
« Nous avons découvert qu’une délétion de deux acides aminés, H69/V70, favorise l’incorporation du pic de SARS-CoV-2 dans les particules virales et augmente l’infectiosité par un mécanisme qui reste à expliquer pleinement. Cette délétion s’est produite plusieurs fois et souvent après le pic mutations d’échappement d’anticorps qui réduisent l’efficacité d’entrée médiée par les pointes », ont expliqué les chercheurs dans l’étude.
L’équipe a également averti que la variante Alpha médie la formation de syncitium plus rapide, qui dépend de la suppression H69/V70. De plus, le pic de la variante Alpha nécessite le H69/V70 pour une infectivité optimale. Cela signifie que la délétion permet au virus de tolérer et de surmonter de nombreuses mutations d’échappement immunitaire tout en maintenant l’infectivité et sa capacité à fusionner avec les cellules hôtes.
L’étude met en évidence que le pic H69/V70 ne confère pas d’échappement aux anticorps et améliore l’infectivité du S2 clivé et du pic. De plus, la variante Alpha de la variante B.1.1.7 nécessite H69/V70 pour l’importance de l’incorporation et de l’infectivité des pointes clivées, et sa pointe nécessite les H69/V70 pour la formation rapide de syncytium.
À ce jour, le virus s’est propagé dans 192 pays et territoires, avec une menace de variantes émergentes. Le nombre de morts a maintenant atteint plus de 3,94 millions, les États-Unis faisant état de plus de 604 000 décès.
Les États-Unis signalent le plus grand nombre de cas, avec 33,66 millions d’infections, suivis de l’Inde et du Brésil, avec plus de 30,36 millions et 18,55 millions de cas, respectivement.
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