Dans cette interview,Ma Cliniqueparle au Dr Nicole Lieberman des dernières recherches du laboratoire du Dr Alex Greninger qui ont découvert des réponses immunitaires incomplètes au COVID-19 chez des populations de patients présentant une mortalité accrue.
Sommaire
Qu'est-ce qui a provoqué vos recherches sur les infections au COVID-19?
Lors de l'émergence du virus en Chine en décembre 2019, le laboratoire de virologie de l'Université de Washington a commencé à se préparer à effectuer à la fois des tests cliniques sur des échantillons de patients et un séquençage du virus lui-même pour évaluer la façon dont il se propage dans la population et mute au fil du temps.
Lorsque l'épidémie dans l'État de Washington a été découverte pour la première fois à la fin du mois de février, toute la Division de virologie, y compris mon laboratoire, s'est immédiatement mobilisée pour diriger les efforts visant à étudier le SRAS-CoV-2.
J'avais déjà étudié le système immunitaire, alors j'ai tout de suite commencé à regarder comment le COVID-19 affecte la réponse immunitaire de l'hôte.
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Jusqu'à présent, on ne savait pas pourquoi les infections au COVID-19 ont tendance à être plus graves chez les adultes plus âgés et les hommes. Pourquoi est-ce?
Une grande partie de notre compréhension de la façon dont les virus affectent différentes populations provient d'expériences contrôlées sur des cellules ou des animaux isolés – il est vraiment difficile de tirer des conclusions causales à partir des observations du virus «dans la nature».
Je pense que nos données montrant qu'il existe des différences dans la réponse immunitaire au SRAS-CoV-2 chez les personnes âgées et les hommes sont convaincantes, mais la relation de cause à effet directe entre les différences du système immunitaire et les résultats plus médiocres dans ces groupes devra être confirmée sous contrôle contrôlé. expériences de laboratoire. Ces expériences prennent juste un certain temps.
Dans votre recherche, vous avez étudié les réponses immunitaires au SRAS-CoV-2. Pouvez-vous décrire comment vous avez mené cette recherche?
Nous avons utilisé une technique appelée «séquençage d'ARN», ou RNAseq. Lorsqu'un écouvillon de diagnostic nasopharyngé (NP) est prélevé, il recueille à la fois l'ARN viral et l'ARN humain. Chez l'homme, l'ARN est transcrit à partir de gènes d'ADN et fournit les instructions à une cellule pour fabriquer des protéines, y compris les protéines utilisées par le système immunitaire pour répondre et alerter les cellules voisines d'une infection virale.
Nous avons isolé l'ARN de prélèvements nasopharyngés et comparé les niveaux relatifs de chaque ARN entre les individus infectés et non infectés par le SRAS-CoV-2. Nous avons constaté que les ARN codant pour de nombreux gènes étaient augmentés ou diminués chez les individus infectés par le virus par rapport aux témoins. De cette manière, nous avons pu obtenir une image globale de la façon dont le système immunitaire réagit au virus.
Qu'avez-vous découvert?
Nous avons constaté que les voies antivirales classiques étaient activées en réponse à une infection par le SRAS-CoV-2. Cependant, chez les personnes âgées de 60 ans et plus, les gènes qui aident à recruter les cellules effectrices immunitaires – les cellules immunitaires qui peuvent effectivement éliminer les cellules infectées – étaient beaucoup moins activés que chez leurs homologues plus jeunes. Cela suggère que les personnes âgées peuvent ne pas être aussi capables d'éliminer l'infection virale.
De plus, les hommes avaient des niveaux accrus de gènes qui indiquent au système immunitaire de réduire la réponse antivirale. Nous ne pouvons pas affirmer avec certitude que ces observations sont responsables de l'augmentation de la morbidité et de la mortalité chez les patients âgés et hommes atteints du SRAS-CoV-2, mais elles pourraient certainement être des facteurs contributifs importants.
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Comment la charge virale affecte-t-elle la gravité de l'infection par le SRAS-CoV-2?
Nous avons constaté que la charge virale était corrélée avec le degré d'activation de la réponse antivirale – les patients avec une plus grande quantité de virus avaient également une plus grande quantité de gènes de réponse immunitaire antivirale.
Nous n'avons pas eu accès aux données sur les résultats cliniques des patients inclus dans notre étude, mais d'autres chercheurs ont démontré que de plus grandes quantités de virus sont corrélées à une infection plus grave.
Comment vos recherches aident-elles à orienter les traitements potentiels de l'infection par le SRAS-CoV-2?
Je pense que notre étude montre que certains des essais cliniques portant sur différents types d’interférons – les médiateurs antiviraux les plus puissants de l’organisme – pourraient être sur la bonne voie. J'ai hâte de voir ces résultats.
Pensez-vous qu'avec vos recherches, nous pouvons davantage aider à comprendre le COVID-19 et potentiellement sauver des vies?
Je pense qu'à ce stade de la pandémie, toute recherche soigneusement menée et examinée par des pairs est utile – il y a encore tant à comprendre sur ce virus et sur la façon dont il affecte ses hôtes humains.
J'ai bon espoir que notre étude fournisse des informations importantes à d'autres scientifiques et cliniciens travaillant plus directement sur les traitements.
Que peuvent faire les personnes âgées et les hommes pour se protéger du COVID-19?
Les mêmes choses que le reste d'entre nous peuvent – porter un masque, garder beaucoup de distance pendant les interactions sociales et se laver les mains régulièrement. Et bien que ce soit difficile, j'espère qu'ils pourront se réjouir du fait qu'il y a un effort de collaboration massif de dizaines de milliers de scientifiques à travers le monde pour comprendre ce virus et développer des traitements.
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Quelles recherches supplémentaires doivent être menées avant de pouvoir affirmer de manière concluante que l'âge et le sexe ont un impact sur la gravité du COVID-19?
Je pense qu'à ce stade, les données des études cliniques sur les résultats des patients indiquent extrêmement clairement que l'âge avancé et le sexe masculin sont des facteurs de risque importants pour un COVID-19 plus grave. Comprendre les mécanismes derrière ces différences de résultats nécessitera des études dans un large éventail de modèles animaux, efforts qui sont déjà en cours.
En outre, d'autres études sur la réponse immunitaire des patients à l'infection par le SRAS-CoV-2, combinée à des données démographiques et cliniques détaillées, constitueront probablement également une pièce importante du puzzle.
Pourquoi les écouvillons du nasopharynx ne sont-ils pas aussi fiables que d'autres emplacements anatomiques?
Les écouvillons du nasopharynx sont fantastiques. À bien des égards, ils sont toujours la référence en matière d'échantillonnage. Le SRAS-CoV-2 peut infecter les poumons et il est difficile d'obtenir des échantillons des voies respiratoires inférieures, de sorte que les écouvillons nasopharyngés peuvent ne pas capturer ces cas, mais il n'y a pas nécessairement de meilleure alternative.
La salive s'est montrée prometteuse bien que la variabilité d'un échantillon à l'autre puisse être assez élevée. Et puis les écouvillons nasaux fonctionnent généralement aussi bien.
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Quelles sont les prochaines étapes de votre recherche sur les réponses immunitaires au COVID-19?
J'ai hâte d'étudier l'interaction entre l'infection par le SRAS-CoV-2, la réponse immunitaire et la façon dont ces facteurs peuvent influencer le développement d'infections bactériennes secondaires telles que la pneumonie, des complications qui sont responsables d'un pourcentage élevé de SRAS-CoV-2 décès liés.
Où les lecteurs peuvent-ils trouver plus d'informations?
À propos du Dr Nicole Lieberman
Nicole Lieberman a obtenu son baccalauréat en biochimie à l'Université de Calgary, une maîtrise en biologie structurale à la North Carolina State University et un doctorat. en biochimie moléculaire à l'Université du Maryland, Baltimore.
Après son doctorat, elle a rejoint le Seattle Children's Research Institute en tant que stagiaire postdoctorale, étudiant la réponse immunitaire anti-tumorale dans les tumeurs cérébrales pédiatriques et adultes, et a développé une nouvelle immunothérapie à base de macrophages pour les tumeurs solides, sur laquelle elle est titulaire d'un diplôme américain. brevet.
En décembre 2019, elle a rejoint le laboratoire du Dr Alex Greninger à la faculté de médecine de l'Université de Washington, où elle étudie la réponse de l'hôte à l'infection virale, ainsi que les déterminants génomiques de Treponema pallidum subsp. pathogenèse pallidum (syphilis).
