Jusqu'à présent, les scientifiques avaient supposé qu'il y avait environ 80 soi-disant cadres de lecture ouverts (ORF) dans le génome du virus de l'herpès simplex 1 (HSV-1). Ce sont les emplacements du génome où les informations contenues dans l'ADN sont lues et traduites en protéines. Il est maintenant clair qu'il y en a beaucoup plus, à savoir 284 ORF. Celles-ci sont traduites à partir de centaines de nouvelles transcriptions virales, qui ont maintenant été également identifiées.
C'est ce que les groupes de recherche de Julius-Maximilians-Universität (JMU) Würzburg en Bavière, en Allemagne, et d'autres institutions rapportent dans la revue Communications Nature.
Les nouvelles découvertes permettent désormais d'étudier les gènes individuels du virus beaucoup plus précisément qu'auparavant. «
Professeur Lars Dölken, chef de la chaire JMU de virologie
Il était en charge de ce projet avec Florian Erhard, professeur junior JMU de virologie des systèmes.
Plusieurs institutions impliquées
L'équipe de recherche a utilisé un large éventail des dernières méthodes de biologie des systèmes pour l'étude. Outre JMU, le Centre Max Delbrück de médecine moléculaire de Berlin, l'Université de Cambridge en Angleterre et Ludwig-Maximilians-Universität de Munich étaient impliqués.
Les données ne sont pas seulement importantes pour une meilleure compréhension du virus lui-même. Ils ont également des implications concrètes, par exemple pour le développement de virus oncolytiques à base de HSV-1. Ce sont des virus qui sont utilisés dans les thérapies immunologiques de certaines maladies tumorales, comme le mélanome malin.
Faits sur le virus de l'herpès simplex 1
Les virus de l'herpès simplex de type 1 (HSV-1) sont connus de nombreuses personnes comme la cause des boutons de fièvre démangeaisons désagréables. Une infection par ce type de virus peut également avoir de graves conséquences. Par exemple, le HSV-1 peut provoquer une pneumonie potentiellement mortelle chez les patients des unités de soins intensifs. Et chez les personnes en bonne santé, elle peut provoquer une encéphalite, qui entraîne souvent des lésions cérébrales permanentes.
Une fois infecté par le virus, une personne le conservera pour le reste de sa vie: les virus de l'herpès se nichent en permanence dans les cellules du corps. Là, ils restent généralement peu visibles pendant longtemps. Ce n'est que dans des circonstances spéciales, comme un système immunitaire affaibli, qu'ils redeviennent actifs.
Argent du Conseil européen de la recherche
Lars Dölken recherche très intensivement les virus de l'herpès. Pour ses succès dans ce domaine, il a reçu une subvention de consolidation du Conseil européen de la recherche en 2016. Le prix était doté d'environ deux millions d'euros; l'argent ira à des études sur les virus de l'herpès.
La source:
Référence de la revue:
Whisnant, A.W., et al. (2020) La génomique fonctionnelle intégrative décode le virus de l'herpès simplex 1. Communications Nature. doi.org/10.1038/s41467-020-15992-5.