Dans un examen approfondi des effets du virus à l’origine du COVID-19 sur le microbiome des patients – la collection de micro-organismes qui vivent dans et sur le corps humain – les scientifiques de Rutgers ont découvert qu’une infection aiguë perturbe un équilibre sain entre les bons et les mauvais microbes dans l’intestin , surtout avec un traitement antibiotique.
Les travaux pourraient conduire au développement de suppléments probiotiques pour corriger tout déséquilibre intestinal chez les futurs patients, ont déclaré les scientifiques.
Reportage dans la revue scientifique Biomédecine moléculaire, les chercheurs ont décrit les premiers résultats d’une étude en cours examinant le microbiome des patients et des bénévoles à l’hôpital universitaire Robert Wood Johnson au Nouveau-Brunswick. L’étude, qui a commencé en mai 2020, les premiers jours de la pandémie, a été conçue pour se concentrer sur le microbiome car de nombreuses personnes souffrant de COVID-19 se sont plaintes de problèmes gastro-intestinaux – à la fois pendant les phases aiguës de leur maladie et pendant leur convalescence.
Nous voulions approfondir notre compréhension en examinant des spécimens qui nous donneraient une indication sur l’état du microbiome intestinal chez l’homme. Ce que nous avons découvert, c’est que, bien qu’il y ait des différences entre les personnes atteintes de COVID-19 et celles qui n’étaient pas malades, la plus grande différence par rapport aux autres a été observée chez celles à qui on avait administré des antibiotiques.
Martin Blaser, titulaire de la chaire Henry Rutgers du microbiome humain à l’Université Rutgers, directeur du Center for Advanced Biotechnology and Medicine (CABM) à Rutgers et auteur de l’étude
Au début de la pandémie, avant l’introduction de vaccins et d’autres remèdes antiviraux, il était courant de traiter les patients atteints de COVID-19 avec une série d’antibiotiques pour tenter de cibler d’éventuelles infections secondaires, a déclaré Blaser, qui est également professeur de médecine et pathologie et médecine de laboratoire à la Rutgers Robert Wood Johnson Medical School.
Les humains transportent des populations importantes et diverses de microbes, a déclaré Blaser. Ces micro-organismes vivent dans le tractus gastro-intestinal, sur la peau et dans d’autres organes, avec la plus grande population dans le côlon. Des scientifiques tels que Blaser ont montré au cours des dernières décennies que le microbiome joue un rôle central dans la santé humaine, interagissant avec le métabolisme, le système immunitaire et le système nerveux central.
Le microbiome a de nombreuses fonctions différentes. « L’une consiste à protéger le corps humain contre les agents pathogènes envahisseurs, qu’il s’agisse de bactéries, de virus ou de champignons », a déclaré Blaser. « Cela va profondément dans l’évolution, peut-être un milliard d’années d’évolution. »
Des problèmes médicaux surviennent souvent lorsque l’équilibre entre les microbes bénéfiques et pathogènes dans le microbiome d’une personne est rompu, une condition connue sous le nom de dysbiose.
Les scientifiques ont étudié les microbiomes en mesurant les populations de micro-organismes dans des échantillons de selles prélevés sur 60 sujets. Le groupe d’étude était composé de 20 patients COVID-19, 20 donneurs sains et 20 sujets COVID-19 récupérés. Ils ont trouvé des différences majeures dans le nombre de populations de 55 espèces différentes de bactéries en comparant les microbiomes des patients infectés avec les patients sains et récupérés.
Les scientifiques de Rutgers prévoient de continuer à tester et à suivre les microbiomes des patients dans l’étude pour déterminer l’effet à long terme sur les microbiomes individuels de COVID-19.
« Une enquête plus approfondie sur les patients améliorera la compréhension du rôle du microbiome intestinal dans la progression et la récupération de la maladie COVID-19 », a déclaré Blaser. « Ces découvertes peuvent aider à identifier des cibles microbiennes et des suppléments probiotiques pour améliorer le traitement COVID-19. »
Parmi les autres scientifiques de Rutgers participant à l’étude, citons Yue Sandra Yin, le premier auteur de l’étude et spécialiste de l’enseignement de la recherche au CABM; Veenat Parmar, administrateur du programme Rutgers Microbiome Program ; Vinod Rustgi, professeur émérite de médecine, directeur clinique de l’hépatologie et directeur du Center for Liver Diseases and Liver Masses de la Robert Wood Johnson Medical School ; ainsi que Carlos Minacapelli, Carolyn Catalano, Abhishek Bhurwal et Kapil Gupta, tous de la Division de gastroentérologie et d’hépatologie et du Centre des maladies du foie et des masses de la Robert Wood Johnson School of Medicine.
L’étude a été soutenue par Danone et par les National Institutes of Health (National Institute of Allergy and Infectious Diseases).