La diversité du microbiote nasal et les infections des voies respiratoires sont liées de manière différentielle. Le microbiote est connu pour influencer la réponse immunitaire, car la richesse en espèces du microbiote nasal d’un individu est corrélée à des symptômes plus légers lorsqu’il est infecté par le rhinovirus.
Étudier: Altération du profil du microbiote nasopharyngé chez les patients âgés atteints de COVID-19. Crédit d’image : goa novi/Shutterstock.com
Dans une étude récente, des chercheurs ont mené un parallélisme de profilage du microbiote nasopharyngé dans le but d’analyser les variations du microbiote chez les patients âgés atteints de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19). Les résultats de cette étude distinguent des schémas distincts dans le microbiote nasal des patients COVID-19, avec et sans symptômes, par rapport à ceux présents chez les individus négatifs pour le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2).
Fond
Le SARS-CoV-2, qui est l’agent étiologique du COVID-19, se transmet principalement par les gouttelettes respiratoires et les aérosols. Le SRAS-CoV-2 est associé à un large éventail de présentations, d’asymptomatiques à symptomatiques, impliquant fièvre, toux et détresse respiratoire.
Les patients symptomatiques COVID-19 peuvent présenter des symptômes légers de type rhume à une maladie grave nécessitant une hospitalisation ou une admission en unité de soins intensifs (USI) dans certains cas. À ce jour, plus de 4,8 millions de personnes dans le monde ont succombé au COVID-19.
Malgré les recherches sur la compréhension du COVID-19 en termes de pathologie, de pronostic, de prévention et de traitement, les connaissances actuelles sont encore limitées pour expliquer les variations de ses manifestations cliniques. Ainsi, la caractéristique la plus frappante de COVID-19 est le large spectre clinique observé chez les patients sans aspect distinct/spécifique qui influence la nature de la progression de la maladie chez un individu.
Étant donné que le microbiote joue un rôle important dans diverses maladies, dont certaines comprenant le syndrome inflammatoire chronique de l’intestin, les ulcères gastroduodénaux et les maladies virales, la présente étude visait à documenter les changements dans la diversité et la composition du bactériome nasal entre les trois cohortes. Ces cohortes comprenaient des patients atteints de COVID-19 sévère, des individus COVID-19 asymptomatiques et des individus en bonne santé.
À propos de l’étude
La cohorte de l’étude actuelle comprenait 84 individus du même âge, âgés de 48 à 70 ans, dont 27 étaient négatifs pour le SRAS-CoV-2, 30 étaient asymptomatiques et positifs pour le SRAS-CoV-2, et 27 étaient positifs pour le SRAS- CoV-2 et ont présenté des symptômes modérés n’ayant pas nécessité d’hospitalisation. Les chercheurs ont collecté les échantillons cliniques nasopharyngés (NPS) des patients dans des établissements de santé ou communautaires, qui ont ensuite été testés pour le SRAS-CoV-2. Le profilage de la communauté microbienne à l’aide du séquençage d’amplicon de l’acide ribonucléique ribosomique (ARNr) 16S a également été effectué sur les échantillons de NPS.
Les chercheurs ont trouvé une différence significative dans la population bactérienne entre chaque cohorte. Plus précisément, un faible niveau de la population bactérienne a été détecté chez les individus symptomatiques positifs (PSY) COVID-19 par rapport aux individus asymptomatiques ou sains.
Bien que cela puisse être dû aux lavages fréquents en raison d’un écoulement nasal et d’éternuements qui sont importants chez les patients symptomatiques de COVID-19, les chercheurs suggèrent également que le faible microbiote de ces patients pourrait les exposer à un risque élevé de gravité de la maladie. Pris ensemble, les chercheurs ne savaient pas si les micro-organismes étaient responsables du risque de gravité de la maladie ou si le SRAS-CoV-2 était responsable de l’altération du profil du microbiote.
Lors de l’identification des bactéries nasales associées à l’infection par le SRAS-CoV-2, les chercheurs ont découvert des niveaux élevés de cyanobactéries, également appelées algues bleu-vert. Cette bactérie est connue pour provoquer une pneumonie et des lésions hépatiques et est soupçonnée d’avoir un rôle dans la régulation de la réponse immunitaire. Les patients symptomatiques avaient deux fois plus de ces bactéries présentes dans leurs échantillons de NPS par rapport à la cohorte asymptomatique.
Les chercheurs ont également observé une tendance à la hausse de la population de Bacteroidota, Litoricola, Amylibacter, Balneola et Aeromonas par rapport aux groupes COVID-négatifs.
Conclusion
Les résultats de cette étude réaffirment la tendance croissante de la population de ces bactéries. En comparant les patients COVID-19 symptomatiques et asymptomatiques, l’étude a révélé que les patients symptomatiques (PSY) étaient enrichis des signatures de deux bactéries Cutibacterium et Lentimonas. Les chercheurs ont également noté une gamme de micro-organismes qui étaient significativement faibles chez les patients symptomatiques positifs au COVID-19.
Ainsi, sur la base de cette étude, on peut déduire que des altérations du microbiote chez les patients symptomatiques positifs au COVID-19 pourraient réguler la réponse immunitaire à la gravité des infections.
« La dysbiose du microbiote nasal pourrait être l’une des raisons de la susceptibilité et de la gravité accrues de l’infection au COVID-19. »
Notamment, cette étude démontre une forte association entre le profil du microbiote nasal et l’infection et la gravité du SRAS-CoV-2, qui se manifeste de manière variable chez les patients COVID-19. Les limites de l’étude comprennent une petite taille d’échantillon qui comprenait des patients d’un âge plus avancé. Les chercheurs demandent d’autres études sur des échantillons à grande échelle et en mettant l’accent sur la corrélation entre la réponse immunitaire et le microbiote nasal afin d’identifier les mécanismes sous-jacents.
« Nos résultats préliminaires montrent que le profil du microbiote nasal des patients atteints de COVID-19 fournit une information perspicace qui peut aider à développer à la fois des biomarqueurs pour évaluer la gravité de la maladie et de nouvelles stratégies thérapeutiques pour atténuer les résultats négatifs pour les patients. »
