Un article de synthèse récent publié dans le journal du MDPI Virus souligne comment les vaccins disponibles peuvent être efficaces pour protéger les individus contre les formes sévères de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), mais la protection contre l’infection par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) et sa transmission à d’autres peuvent être réduit – avec des conséquences pour la protection de la communauté et l’immunité collective.
À la suite de l’infection par le SRAS-CoV-2, un agent causal de la pandémie actuelle de COVID-19, il y a une activation des systèmes immunitaires innés et adaptatifs dans notre corps. Ainsi, à bien des égards, la gravité de la maladie dépend de la façon dont nous répondons à l’infection.
Les anticorps neutralisants générés sont hautement spécifiques des épitopes viraux principalement présents dans la glycoprotéine de pointe du SRAS-CoV-2, mais les cellules T sont également recrutées afin de sécréter des cytokines antivirales et de tuer les cellules infectées.
Si la réponse immunitaire précoce de l’hôte est incapable de contrôler et d’éliminer le virus, la maladie évolue vers une phase secondaire caractérisée par une réponse inflammatoire incontrôlée de l’hôte, qui est responsable de manifestations graves connues et peut finalement entraîner des dommages aux organes.
C’est pourquoi les vaccins ont vraiment changé la donne dans cette pandémie. Même si nous ne sommes qu’à un peu plus de 18 mois de la pandémie, quatre vaccins sont déjà largement utilisés dans le monde : le BNT162b2 de Pfizer/BioNtech2, l’ARNm-1273 de Moderna, l’Ad26.COV2S de Janssen et le ChAdOx1 d’AstraZeneca.
La structure génomique du SARS-CoV-2. Le génome code deux grands cadres de lecture ouverts (ORF), ORF1a et ORF1b, qui codent pour 16 protéines non structurelles (NSP1-NSP16). Les gènes structurels codent pour les protéines structurelles, pointe (S), enveloppe (E), membrane (M) et nucléocapside (N), et les gènes accessoires (3a, 3b, 6, 7a, 7b, 8, 9 et 10) (Créé avec Biorender.com consulté le 9 septembre 2021).
Une montée rapide des variantes virales
Cependant, vers la fin de 2020, il y avait déjà une émergence de plusieurs variantes différentes du SRAS-CoV-2 préoccupantes (en raison de changements mutationnels dans le génome viral) qui montraient une transmissibilité accrue et une évasion possible des réponses immunitaires générées par le SRAS antérieur. -Infection au CoV-2.
Il convient de noter que les variantes préoccupantes sont les souches de SRAS-CoV-2 qui ont des taux de transmissibilité plus élevés, des présentations cliniques plus graves, une réponse plus faible au traitement ou des rendements diagnostiques inadéquats avec l’utilisation de procédures et de tests établis.
De même, ces variantes virales sont également une menace pour l’efficacité des vaccins. En raison de la présence de mutations dans la glycoprotéine de pointe (en particulier dans les épitopes d’anticorps neutralisants), des expériences de laboratoire ont révélé une baisse de la capacité des échantillons de sérum post-vaccination à neutraliser les variantes préoccupantes.
La possibilité de réinfection
Même si les variantes préoccupantes portent des mutations qui échappent à la neutralisation complète par les anticorps, et qu’il existe plusieurs rapports de réinfections, il n’est toujours pas clair si le risque de réinfection est réellement augmenté. Théoriquement, le risque existe si la glycoprotéine de pointe change, principalement en raison de son rôle dans l’entrée dans les cellules et parce qu’elle est ciblée par des anticorps protecteurs.
Certaines études montrent que cela peut effectivement être le cas, mais cela dépend de la variante en question. Une étude du Royaume-Uni a prouvé la réinfection chez 0,7% des individus testés, mais cela n’était pas corrélé avec la proportion d’infections dans ces régions causées par la variante alpha – indiquant un effet mineur de cette variante sur le risque de réinfection.
D’autre part, une étude sérologique longitudinale de donneurs de sang répétés non vaccinés de Manaus au Brésil a montré qu’au milieu de l’émergence de la variante gamma, un total de 16,9% des infections présumées avaient une preuve sérologique d’une infection antérieure par le SRAS-CoV. -2.
Vaccins et variantes préoccupantes
Alors que l’efficacité des vaccins à protéger contre l’infection symptomatique avec des variantes préoccupantes peut être diminuée, tout porte à conclure qu’ils restent quelque peu efficaces pour prévenir les formes graves de COVID-19, l’hospitalisation et/ou la mort. On sait également que les réponses immunitaires cellulaires restent largement préservées.
Néanmoins, pour le moment, il n’est pas clair si des boosters spécifiques aux variantes seront nécessaires à l’avenir. De tels vaccins de rappel pourraient soit utiliser la glycoprotéine de pointe de la souche originale du SRAS-CoV-2 Wuhan, soit celle dérivée d’une variante préoccupante. Les données d’Israël démontrent qu’une troisième injection au cours de la circulation généralisée du variant delta peut certainement fournir une protection à court terme contre une infection confirmée et une maladie grave.
Cependant, il reste à voir si la protéine de pointe sera capable de muter davantage pour échapper aux réponses immunitaires tout en préservant des niveaux élevés d’infectivité. Avec la cinétique des réponses immunitaires, cela déterminera finalement si des vaccins ou des rappels mis à jour seront nécessaires et à quelle fréquence
