Des chercheurs menant une étude de sérosurveillance d’une espèce de cerf d’Amérique du Nord ont fourni des preuves d’exposition au coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) parmi les animaux de quatre États américains.
Le virus SARS-CoV-2 est l’agent responsable de la pandémie actuelle de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) qui continue de constituer une menace pour la santé publique mondiale et l’économie mondiale.
L’équipe des USDA-APHIS Wildlife Services à Fort Collins, Colorado et des USDA-APHIS Veterinary Services à Ames, Iowa, a découvert que 40 % des échantillons prélevés sur des cerfs de Virginie dans le Michigan, la Pennsylvanie, l’Illinois et l’État de New York, en 2021 contenait des anticorps neutralisants contre le SRAS-CoV-2.
Susan Shriner et ses collègues affirment que les résultats soulignent la nécessité de programmes dédiés de surveillance des maladies de la faune pour surveiller le potentiel de propagation zoonotique inverse (humaine à animale) du SRAS-CoV-2 dans de nouveaux réservoirs fauniques.
Ce potentiel « débordement » dans les espèces sauvages qui vivent en étroite association avec l’homme pourrait affecter l’adaptation, l’évolution et la transmission du virus, selon l’équipe.
Une version pré-imprimée du document de recherche est disponible sur le site bioRxiv* serveur, tandis que l’article est soumis à une évaluation par les pairs.
Sommaire
De nouveaux réservoirs d’animaux sauvages pourraient stimuler l’évolution du SRAS-CoV-2
Étant donné qu’il a été démontré que le SRAS-CoV-2 infecte plusieurs espèces animales domestiques et sauvages, de nouveaux réservoirs animaux pourraient émerger avec le potentiel de disséminer et de conduire l’évolution du virus. Les espèces fauniques abondantes qui vivent à proximité des humains représentent une préoccupation particulière.
« La pression des agents pathogènes produite par des infections humaines importantes combinées à des hôtes fauniques sensibles à l’interface faune-humain a conduit plusieurs auteurs à signaler un appel urgent à une surveillance proactive de la faune pour la détection précoce d’une potentielle zoonose inverse du SRAS-CoV-2 dans la faune. populations », déclare Shriner et ses collègues.
Outre les effets néfastes potentiels sur la santé de la faune, des infections persistantes au sein d’un nouveau réservoir hôte pourraient permettre au virus de s’adapter et d’évoluer en de nouvelles souches avec une transmissibilité, une pathogénicité et des capacités d’échappement immunitaire accrues.
Des preuves ont déjà montré que le cerf de Virginie (Odocoileus virginianus) sont permissifs à l’infection par le SRAS-CoV-2, présentent une excrétion virale soutenue et peuvent transmettre le virus aux membres de la même espèce.
« La répartition géographique de cette espèce englobe la majeure partie de l’Amérique du Nord et ces animaux sont particulièrement abondants à proximité des centres de population urbains situés dans l’est des États-Unis », écrit l’équipe. « De plus, le cerf de Virginie peut former des groupes sociaux, une structure de contact avec le potentiel de favoriser la transmission intraspécifique de multiples agents pathogènes. »
Qu’ont fait les chercheurs ?
L’USDA/APHIS/Wildlife Services National Wildlife Disease Program (NDWP) surveille une variété d’agents pathogènes chez les espèces sauvages aux États-Unis En janvier 2021, Shriner et ses collègues ont tiré parti de cette ressource pour lancer un programme pilote de sérosurveillance pour l’exposition au SRAS-CoV-2 en blanc -le cerf de Virginie.
L’équipe a examiné 624 échantillons de sérum pré- et post-pandémiques provenant de cerfs de Virginie sauvages dans quatre États américains.
Détection d’anticorps SARS-CoV-2 chez des cerfs de Virginie échantillonnés en 2021 aux États-Unis. La taille du cercle indique le nombre relatif d’échantillons testés. La couleur représente la séroprévalence relative, et les chiffres sont la prévalence spécifique dans un comté.
Au total, 385 échantillons post-pandémiques ont été collectés entre janvier et mars 2021, dont 113 du Michigan, 142 de Pennsylvanie, 101 de l’Illinois et 29 de New York.
Étant donné que le NWDP conserve de vastes archives d’échantillons d’animaux sauvages pour plusieurs espèces, l’équipe a utilisé ce référentiel pour sélectionner 239 échantillons de cerfs de Virginie collectés entre 2011 et 2020 dans cinq États : Illinois, Michigan, Pennsylvanie, New York et New Jersey. La majorité (182) des échantillons d’archives étaient de 2018-2020 (pré-pandémie et début de la pandémie).
Tous les échantillons ont été criblés à l’aide d’un test de neutralisation virale de substitution (sVNT) indépendant de l’espèce. Cependant, comme ce sVNT n’a pas été validé pour les cerfs, les chercheurs ont également testé un sous-ensemble d’échantillons à l’aide d’un test de neutralisation du virus SARS-CoV-2 (VNT) hautement spécifique.
Qu’ont-ils trouvé ?
Des anticorps neutralisants contre le SRAS-CoV-2 ont été détectés dans 152 (40 %) des échantillons de 2021, dans trois des échantillons de 2020 et un des échantillons de 2019. Aucun anticorps n’a été détecté dans les échantillons prélevés entre 2011 et 2018.
Les résultats du sVNT ont montré une concordance élevée avec les résultats du VNT ; les 24 résultats de tests positifs et 24 négatifs des échantillons de 2021 étaient concordants entre les écrans sVNT et VNT.
La séroprévalence la plus faible a été observée dans l’Illinois (7 %) et la plus élevée dans le Michigan (67 %). La séroprévalence à New York et en Pennsylvanie était intermédiaire, à 31 % et 44 %, respectivement.
« Dans l’ensemble, ces résultats indiquent que les populations de cerfs de Virginie examinées dans le Michigan, la Pennsylvanie, l’Illinois et New York ont été exposées au SRAS-CoV-2 », écrit l’équipe.
Une surveillance accrue des cerfs en liberté est nécessaire
Les chercheurs soulignent que de multiples activités pourraient mettre les cerfs sauvages en contact avec les humains, telles que la recherche sur le terrain, les travaux de conservation, le tourisme faunique, l’alimentation supplémentaire et la chasse.
Les résultats rapportés ici soulignent la nécessité d’une surveillance continue et élargie de la faune pour déterminer l’importance du SRAS-CoV-2 chez les cerfs en liberté, disent-ils.
L’équipe recommande également la surveillance du SRAS-CoV-2 des prédateurs et des charognards sensibles avec une forte probabilité d’interagir avec le cerf.
« La future surveillance de la faune devrait intégrer des méthodes spécifiquement conçues pour détecter, isoler et caractériser génétiquement le SRAS-CoV-2 et pour identifier les variantes potentielles, ainsi que d’autres coronavirus endémiques », écrivent Shriner et ses collègues.
« Ces méthodes, combinées à des programmes dédiés de surveillance des maladies de la faune, peuvent faire la lumière sur la façon dont le retour d’agents pathogènes zoonotiques dans de nouveaux réservoirs fauniques peut affecter l’adaptation, l’évolution et la transmission des agents pathogènes. »
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ou traités comme des informations établies.
