New England Biolabs (NEB®) a annoncé aujourd'hui le lancement du kit NEBNext Enzymatic 5hmC-seq (E5hmC-seq™), une nouvelle méthode enzymatique pour la détection spécifique des sites 5hmC. L’approche douce basée sur les enzymes permet des rendements élevés et des données de haute qualité, avec une plage d’entrée de 100 pg à 200 ng.
Bien que l'importance biologique de la modification de 5hmC soit moins claire que celle de 5mC, l'abondance de 5hmC varie considérablement d'un tissu à l'autre, ce qui suggère qu'elle pourrait jouer un rôle essentiel dans la régulation des gènes et d'autres processus biologiques.
« Jusqu'à présent, l'étude du 5hmC a été entravée par le manque de méthodes de détection précises », a déclaré Fiona Stewart, directrice associée de NEBNext Portfolio Management. « Alors que NEBNext Enzymatic Méthyl-seq (EM-seq™), notre référence en matière de détection de méthylation, détecte à la fois 5 mC et 5 hmC, il ne fait pas de distinction entre eux. De plus, les méthodes basées sur le bisulfite souffrent d’une qualité de données réduite en raison de la fragmentation des échantillons et de la perte d’ADN résultant du traitement nocif au bisulfite, limitant ainsi leur utilité pratique.
« Pour relever ces défis, nous avons développé le kit NEBNext Enzymatic 5hmC-seq, qui permet la détection spécifique des sites 5hmC à l'aide d'un flux de travail de conversion enzymatique en deux étapes », a déclaré Stewart. « La méthode enzymatique minimise les dommages à l'ADN et permet de distinguer 5hmC de la cytosine non modifiée et 5mC après Illumina® séquençage. De plus, les données E5hmC-seq peuvent être soustraites des données EM-seq, permettant une détermination précise des sites individuels 5mC et 5hmC. »
Le kit comprend les réactifs requis pour la conversion E5hmC-seq et la préparation de bibliothèques compatibles avec le séquençage Illumina ; Les amorces d'index pour le multiplexage sont disponibles séparément. Un module de conversion est également disponible, pour les applications au-delà de la préparation de bibliothèques.
Pour plus d’informations, visitez www.NEBNext.com.
