Dans un manuscrit publié aujourd'hui dans le American Journal of Psychiatry intitulé Séquençage du génome à longue lecture en psychiatrie clinique: haploinsuffisance RFX3 chez un adolescent hospitalisé avec l'autisme, la déficience intellectuelle et la décompensation comportementale, Les auteurs décrivent comment ils ont exploité le séquençage génomique à lecture longue (LRS) pour établir un diagnostic génétique chez un homme âgé d'un spectre autistique, une déficience intellectuelle et une décompensation comportementale aiguë qui n'aurait pas été possible par des méthodes standard. Grâce à l'utilisation de LR, une technologie de pointe qui lit étendu des étendues d'ADN en un seul pass, permettant une détection plus précise de changements génétiques compliqués, les auteurs décrivent un réarrangement complexe qui a entraîné une inactivation de la Rfx3 gène. Le diagnostic clinique résultant de Rfx3 Le syndrome d'haplo-insuffisance, qui a été précédemment associé au trouble du spectre autistique (TSA) et à une déficience intellectuelle, n'était pas possible avec la technologie conventionnelle actuellement utilisée dans le séquençage clinique.
Pendant l'hospitalisation psychiatrique du patient, il a présenté une gamme de symptômes graves, notamment la psychose, la dépression, l'anxiété et la catatonie. Ses tuteurs légaux ont donné leur consentement à l'inscrire à l'étude des auteurs «Crises de santé mentale chez les jeunes ayant une déficience intellectuelle et du développement».
Les tests génétiques cliniques standard avec séquençage du génome entier à lecture courte (WGS) ont initialement révélé une duplication sur le Rfx3 gène et une autre duplication plus grande dans un gène adjacent. Les échantillons parentaux de séquençage ont déterminé l'hérédité des régions dupliquées, mais il ne restait pas clair s'il y avait un changement génomique supplémentaire entre les deux duplications qui n'était pas détectable par WGS. Les auteurs ont ensuite décidé de poursuivre LRS, qui s'est avéré détecter plus de variations structurelles génomiques par rapport au séquençage à lecture courte. Les auteurs ont pu conclure que l'un des parents n'avait pas simplement de Rfx3 la duplication, comme l'origine à l'origine de WGS, mais avait en fait un réarrangement structurel complexe qui comprenait à la fois des suppressions et des duplications des régions adjacentes de l'ADN Rfx3 perte de fonction et diagnostic de Rfx3 Syndrome d'haplo-insuffisance.
Les tests génétiques ont historiquement joué un rôle limité dans la psychiatrie clinique. Cependant, alors que notre compréhension de l'architecture génétique des troubles psychiatriques continue de se développer, les cliniciens de santé mentale devront de plus en plus avoir une compétence fondamentale en génétique médicale et être conscient du moment où les tests génétiques sont indiqués et comment il peut avoir un impact sur leurs patients. «
Aaron D. Besterman, MD, chercheur clinique au Rady Children's Institute for Genomic Medicine et auteur d'étude
Les auteurs ont également observé que, bien que les LR ne devraient pas actuellement être considérées comme un test génétique de première ligne, il doit être pris en compte dans les cas où les tests génétiques traditionnels, y compris les WGS, ne parviennent pas à identifier une variante causale mais la suspicion clinique pour une cause génétique reste élevée ou une variante d'intérêt est détectée mais ne peut être élucidée par d'autres moyens.
« Les mutations structurelles dans le génome peuvent souvent être plus complexes qu'elles ne paraissent d'abord », a déclaré Jonathan Sebat, Ph.D., directeur du Verge Center de l'Université de Californie à San Diego et co-auteur de l'étude. « Les LR nous ont permis de démêler la conséquence fonctionnelle de la mutation, qui ne pouvait pas être déterminée par le séquençage du génome standard. Le nouveau séquençage à longue lecture est très prometteur en tant que test génétique complet potentiel de première intention qui peut détecter une grande variété de variantes génétiques grandes et petites, mais le coût reste une barrière à une utilisation générale. »
Les auteurs ont noté que ce cas met en évidence d'autres avantages potentiels de la réalisation de tests génétiques lors des admissions psychiatriques pour patients hospitalisés, comme cela a été fait avec le patient décrit dans l'article, y compris les avantages potentiels de l'accélération considérablement d'un bilan génétique pour une population dans le besoin avec de nombreux obstacles aux soins et facilitant l'accès direct à des services génétiques hospitaliers pour les cliniciens de santé mentale en recherchant des conseils supplémentaires.
