Dans une étude récente publiée dans le Journal d’allergie et d’immunologie cliniqueles chercheurs ont examiné les interactions gène-environnement (GxE) entre la possession d’un animal domestique pendant la petite enfance et le locus 17q12-21 (risque d’asthme) concernant la respiration sifflante.
L’héritabilité de l’asthme expliquée par des variantes génétiques dans les récentes études d’association à l’échelle du génome (GWAS) a été d’environ 9 %, contre 60 % à 90 % estimé dans des études approfondies sur les jumeaux. Les interactions GxE et les définitions larges de l’asthme contribuent probablement à l’héritabilité « manquante ». L’équipe d’étude du consortium de recherche sur l’asthme précoce (STELAR) a été créée à l’aide de cinq cohortes de naissance non sélectionnées au Royaume-Uni.
Dix-sept polymorphismes mononucléotidiques (SNP) dans différents gènes du locus 17q12-q21 ont été liés à l’asthme, bien qu’aucune variante causale n’ait été confirmée. Néanmoins, rs2305480, la variante faux-sens de la gasdermine-B, était le principal SNP dans une étude sur les exacerbations de l’asthme. La sensibilisation aux animaux de compagnie (chats/chiens) est fréquente dans l’asthme infantile.
À propos de l’étude
La présente étude a évalué les interactions GxE entre la variante rs2305480 dans le locus 17q12-q21 et la possession d’un animal domestique (chien/chat) pendant la petite enfance. Les données ont été recueillies de la naissance à l’adolescence au moyen de questionnaires validés dans cinq cohortes du consortium STELAR. Les auteurs se sont concentrés séparément sur la possession de chats et de chiens au cours de la première année de vie en limitant l’analyse aux propriétaires de chiens, aux propriétaires de chats et à ceux qui ne possédaient aucun animal.
À titre de comparaison, un groupe de propriétaires de chiens et de chats a été utilisé. Les chercheurs ont utilisé cinq classes de respiration sifflante à partir d’une analyse de classe latente sur des données longitudinales de respiration sifflante. Ceux-ci étaient – a) une respiration sifflante jamais/peu fréquente, b) une respiration sifflante rémittente d’âge préscolaire précoce, c) une respiration sifflante rémittente précoce au milieu de l’enfance, d) une respiration sifflante persistante et e) une respiration sifflante tardive.
Le variant rs2305480 a été génotypé dans cinq cohortes. La définition binaire large de l’asthme, à savoir l’asthme jamais atteint à l’âge de 16 ans (AE16), a été utilisée. Les cinq cohortes étaient Ashford (ASHFORD), Avon longitudinal study of parents and children (ALSPAC), Aberdeen study of eczema and asthma to observe the effects of nutrition (SEATON), Manchester asthma and allergy study (MAAS) et Isle of Wight ( IOW).
La cohorte ALSPAC a été analysée séparément, tandis que les autres ont été étudiées conjointement (désormais, cohorte conjointe). Une méta-analyse a été réalisée sur les statistiques sommaires de l’ALSPAC et des cohortes conjointes. Les interactions entre le génotype rs2305480 et la possession d’un animal de compagnie ont été examinées à l’aide d’une régression logistique.
Une régression multinomiale a été effectuée pour évaluer l’association et les interactions entre rs2305480 et la possession d’un animal de compagnie. La poussière de sol a été obtenue à l’âge de 5 ans pour la cohorte MAAS, et les niveaux d’endotoxines ont été déterminés. Les niveaux d’endotoxines ont été testés pour les associations avec les classes de respiration sifflante et la possession d’animaux domestiques, en utilisant respectivement la régression multinomiale et le test de Wilcoxon.
Résultats
La cohorte conjointe comptait 2587 enfants alors que la cohorte ALSPAC comptait 6149 enfants. Notamment, 90 % des personnes classées non asthmatiques selon la définition de l’AE16 appartenaient à la classe « jamais/peu fréquente de respiration sifflante ». À l’inverse, 89 % des asthmatiques appartenaient à la classe des sifflements persistants. La méta-analyse a montré que la variante rs2305480 était liée à l’AE16 et à une respiration sifflante persistante et tardive.
Cependant, la méta-analyse pour la possession d’un animal de compagnie n’a montré aucune association entre la possession d’un chat ou d’un chien au cours de la première année de vie et l’asthme ou le type de respiration sifflante. Chez les non-propriétaires d’animaux, l’allèle G de rs2305480 était associé à un risque élevé d’EI16, de respiration sifflante persistante et de respiration sifflante d’apparition tardive. De même, pour les propriétaires de chats, l’allèle G était associé à un risque accru de respiration sifflante persistante et d’EI16.
Aucune association n’a été observée entre le génotype rs2305480 et l’AE16 ou la classe de respiration sifflante chez les propriétaires de chiens. La méta-analyse des modèles logistiques a révélé que les propriétaires de chiens porteurs de l’allèle à risque rs2305480 présentaient un risque significativement atténué de respiration sifflante persistante. Les non-propriétaires d’animaux porteurs du phénotype à risque (GG) ont montré une prévalence accrue de respiration sifflante persistante.
Comme les non-propriétaires d’animaux, les propriétaires de chats avec le phénotype GG avaient un risque plus élevé de respiration sifflante persistante. En revanche, les propriétaires de chiens avec le phénotype GG n’avaient pas une prévalence plus élevée de respiration sifflante persistante par rapport aux autres groupes. Notamment, des niveaux d’endotoxines plus élevés ont été observés dans les maisons des propriétaires d’animaux que dans les maisons des non-propriétaires d’animaux. Plus précisément, des niveaux élevés d’endotoxines étaient associés à un risque plus faible de respiration sifflante persistante.
conclusion
En résumé, l’étude a montré l’association entre l’allèle de risque rs2305480 et le risque élevé d’asthme pour l’ensemble de la population. L’allèle rs2305480 a également augmenté le risque de respiration sifflante persistante et d’apparition tardive. Les auteurs n’ont trouvé aucune association entre la possession d’un animal de compagnie et l’asthme ou la respiration sifflante au cours de la première année de vie dans l’ensemble de la population. Cependant, lorsque les interactions GxE entre la possession d’un animal de compagnie et le génotype ont été testées, les propriétaires de chiens (seulement) n’étaient plus associés à un risque plus élevé d’asthme ou de respiration sifflante.
