Première épidémie connue de grippe aviaire hautement pathogène H5N1 chez le vison d’élevage

L’influenza aviaire hautement pathogène (IAHP) A(H5N1) est une souche du virus de l’influenza aviaire qui affecte principalement les oiseaux, en particulier la volaille. L’IAHP A(H5N1) est un virus hautement contagieux et mortel qui peut causer des maladies graves et la mort chez les oiseaux, y compris les poulets, les canards, les oies et les dindes. Il a fait une résurgence après plusieurs mois de prévalence extrêmement faible lors de la pandémie de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19). Un article récent dans la revue Eurosurveillance décrit un foyer dans un élevage de visons en Espagne causé par le clade 2.3.4.4b.

Communication rapide : infection par le virus de la grippe aviaire hautement pathogène A(H5N1) chez les visons d’élevage, Espagne, octobre 2022. Crédit d’image : Cergios / Shutterstock

L’épidémie

L’élevage de visons décrit ici se trouve en Galice, au nord-ouest de l’Espagne. Les premiers signes de l’épidémie se sont accompagnés d’une augmentation soudaine du nombre de décès par rapport au nombre total de visons, le taux de mortalité passant à 0,77 % par rapport au taux attendu de 0,2 à 0,3 %. Cela s’est produit début octobre 2022 et a conduit à la collecte d’écouvillons oropharyngés de deux animaux malades.

Ceux-ci ont été testés au Laboratoire Central Vétérinaire (LCV) d’Algete (Ministère de l’Agriculture, de la Pêche et de l’Alimentation (MAPA)). Alors que les échantillons de vison n’ont montré aucune trace du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) par le test de réaction en chaîne par polymérase (PCR), ils étaient positifs pour le virus HPAI. Cela a été corroboré par l’identification d’une pneumonie chez les animaux affectés, qui a entraîné des saignements dans les poumons.

Les animaux malades présentaient des signes tels que anorexie, bave, bave de salive, manque d’énergie, saignement du museau et tremblements ou perte d’équilibre et de coordination, indiquant l’implication du système nerveux.

Les décès ont augmenté de semaine en semaine, atteignant un pic à la troisième semaine d’octobre lorsque plus de 4% des animaux mouraient. Dans un premier temps, une mortalité a été observée chez les animaux vivant à proximité de l’étable d’entreposage du fumier. Ces poulaillers présentaient plusieurs points chauds de mortalité, c’est-à-dire des grappes de 2 à 4 enclos avec 100 % de mortalité en une semaine ou deux.

Les décès se sont propagés aux granges adjacentes jusqu’à ce qu’ils se produisent partout où il y avait des visons. Au fur et à mesure que de plus en plus d’échantillons étaient prélevés dans les étables où le nombre le plus important d’animaux semblaient mourir, des niveaux élevés de H5N1 ont été détectés, évalués par un seuil de cycle bas (Ct) dans des échantillons rectaux, oropharyngés ou pulmonaires.

Au cours de la deuxième semaine d’octobre de cette année-là, le recensement des services de santé animale a montré plus de 51 000 visons dans des cages grillagées dans des granges couvertes mais pas complètement murées. Les animaux ont été nourris de poisson cru, de sous-produits de volaille, de farines de sang et de céréales. Les déchets de volaille provenaient de fermes et d’abattoirs de Galice.

Comment a-t-il été détecté ?

Fait intéressant, aucune épidémie de grippe aviaire parmi les oiseaux d’élevage n’était connue jusqu’à présent dans cette région, jusqu’au 10 janvier 2023. Cependant, dans les semaines précédant l’épidémie de vison, plusieurs oiseaux sauvages se sont avérés malades ou morts de Infection HPAI, dont quelques goélands et plusieurs fous de Bassan. C’était un signal d’alarme pour les experts en santé publique de soupçonner que les décès de visons étaient liés à ce virus.

Parallèlement aux tests PCR pour exclure l’infection par le SRAS-CoV-2, cela a conduit à des tests spécifiques pour l’IAHP, dont il a été confirmé qu’il était le coupable.

Le virus

Les tests génomiques du Laboratoire européen de référence ont révélé que les souches appartenaient au clade 2.3.4.4b. Il a été noté que cela infectait des oiseaux sauvages, en particulier des goélands argentés, en Belgique, aux Pays-Bas et en France, à la fois dans le passé et pendant quelques semaines avant l’épidémie espagnole. Cependant, il n’a pas été signalé en Espagne avant ce foyer.

Le clade 2.3.4.4b semble être le résultat d’événements de réassortiment de plusieurs gènes de H5N1 avec le sous-type H13 adapté aux goélands. Les souches génotypées des visons différaient de 8 à 9 acides aminés des variants H5N1 génétiquement apparentés les plus proches. La substitution d’alanine dans le gène PB2 qui provoque une augmentation de l’activité de la polymérase virale suite à son infection des cellules de mammifères est particulièrement remarquable.

Jusqu’à présent, cette substitution n’a été observée qu’une seule fois chez un putois européen des Pays-Bas, en mars 2022. Les autres mutations de ce clade n’ont encore été trouvées nulle part ailleurs, et des études sont attendues pour démêler leur rôle dans le cycle de vie du virus.

Éviter une nouvelle propagation

Suite à l’identification du virus, l’abattage des visons a commencé le 18 octobre 2022, éliminant tous les animaux dans les locaux de la ferme avant le 17 novembre de la même année. La ferme a été nettoyée avec la destruction de tous les déchets et carcasses. La plupart des 12 ouvriers de la ferme ont participé à l’abattage, ayant déjà été en contact avec les animaux avant cette étape. Ils ont été testés le 13^e et 14^e d’octobre par prélèvement nasopharyngé alors qu’ils étaient asymptomatiques, et tous ont été testés négatifs pour le virus.

Par prudence, ils étaient tenus de rester à l’écart des personnes pendant dix jours à compter du dernier contact avec la ferme ou le vison. Ils ont également auto-surveillé les symptômes pseudo-grippaux. Un seul a montré des symptômes le 2 novembre mais a été testé négatif pour le virus.

Notamment, les travailleurs des élevages de visons sont tenus de porter des masques faciaux depuis avril 2020, lorsqu’il a été découvert que des visons d’élevage étaient infectés par le SRAS-CoV-2. Plus tard, des équipements de protection supplémentaires ont été ajoutés, ainsi que le lavage des mains plusieurs fois par jour, tandis que les vêtements de travail étaient lavés et que des douches étaient prises aussi fréquemment à la ferme. Les travailleurs ont également passé moins de temps libre dans les fermes, réduisant leur période de contact.

Quelles sont les implications ?

Le vison semble permettre l’infection par les virus de la grippe, à la fois humaine et aviaire. « Cette espèce pourrait servir de récipient de mélange potentiel pour la transmission interspécifique entre les oiseaux, les mammifères et les humains. » Avec le H5N1 signalé chez les oiseaux dans le monde entier, il faut veiller à prévenir l’infection des visons dans des fermes comme celle-ci. Il est important de noter que, bien que rare, l’infection humaine par la grippe aviaire a un taux de mortalité très élevé de 50 à 60 %.

Des préoccupations antérieures ont été soulevées car le vison s’est avéré sensible au SRAS-CoV-2, la transmission se produisant de manière bidirectionnelle entre les humains et le vison. De tels événements pourraient entraîner la propagation d’agents pathogènes similaires depuis ou vers des animaux sauvages par le biais de visons d’élevage, ce qui constituerait une menace pour la santé humaine.

Cela souligne la nécessité de « renforcer la culture de la biosûreté et de la biosécurité dans ce système d’élevage et favoriser la mise en place de programmes de surveillance ad hoc des virus influenza A et autres pathogènes zoonotiques au niveau mondial. »