Un diagnostic précis de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) peut interrompre la transmission, faciliter la gestion clinique et aider à allouer correctement les ressources à l’isolement, à la recherche des contacts et à la thérapie. Dans de nombreux milieux à revenu faible et intermédiaire avec d’énormes flambées, les efforts de diagnostic du COVID-19 utilisant des tests moléculaires très sensibles ont dépassé la capacité des laboratoires.
Les tests de diagnostic rapide de détection d’antigène (Ag-RDT) ne nécessitent pas de traitement de laboratoire centralisé et peuvent être effectués en moins d’une heure à un coût inférieur par rapport aux tests d’amplification des acides nucléiques (TAAN). Ainsi, les Ag-RDT peuvent faciliter des tests de plus grand volume et offrir des résultats rapides. Cependant, la sensibilité plus faible de l’Ag-RDT a limité leurs applications en milieu clinique.
Il existe un besoin pressant de comprendre les conditions dans lesquelles l’utilisation des Ag-RDT pour le diagnostic du COVID-19 serait préférable à d’autres méthodes telles que le TAAN et / ou le jugement du clinicien seul.
Sommaire
Comparaison de l’efficacité de l’Ag-RDT, du TAAN et du jugement clinique seul dans le diagnostic du COVID-19
Une équipe de chercheurs de l’Université Johns Hopkins, États-Unis; Imperial College London, Royaume-Uni; et Foundation for Innovative New Diagnostics, Suisse, ont récemment comparé l’efficacité de l’Ag-RDT, du TAAN et du jugement clinique seul dans le diagnostic du COVID-19 chez des patients symptomatiques. Ils ont étudié 2 scénarios:
- Un milieu hospitalier à forte prévalence avec un temps de rotation TAAN de 24 heures
- Un milieu ambulatoire avec une prévalence plus faible avec un retournement de 3 jours TAAN.
Leur étude a été publiée sur le serveur de pré-impression, medRxiv*.
Les chercheurs ont simulé la transmission à partir de cas et de contacts et les relations entre le temps, la transmission, la charge virale et la détection des cas. Ils ont utilisé l’analyse de la courbe de décision pour comparer différentes approches diagnostiques et ont estimé le bénéfice en fonction du temps et de l’infectivité de chaque diagnostic positif.
Les résultats montrent un bénéfice net plus important avec le TAAN en milieu hospitalier et avec l’Ag-RDT en ambulatoire
Dans l’analyse principale qui comparait l’Ag-RDT et le TAAN, ils ont constaté qu’un bénéfice net plus important était obtenu avec le TAAN en milieu hospitalier et avec l’Ag-RDT en ambulatoire. En milieu hospitalier, l’Ag-RDT est devenu plus bénéfique lorsque les délais d’exécution du TAAN dépassaient 2 jours ou lorsque la sensibilité relative de l’Ag-RDT augmentait à au moins 95% pendant une maladie aiguë.
«Les Ag-RDT peuvent également offrir un plus grand avantage que les tests basés sur le TAAN dans les populations hospitalisées lorsque les retards du TAAN sont longs ou que la sensibilité de l’AG-RDT dépasse 95% celle du TAAN.
De même, en ambulatoire, le TAAN s’est avéré plus bénéfique lorsque le délai d’exécution du TAAN restait inférieur à 2 jours ou lorsque les patients étaient correctement isolés en attendant les résultats des tests. Le jugement clinique n’était préféré que si les diagnostics cliniques généraient une forte réponse clinique et de santé publique et si les diagnostics faussement positifs causaient un préjudice minime.
« Bien que le TAAN offre une sensibilité plus élevée… que l’Ag-RDT, le fait que l’Ag-RDT donne des résultats plus rapidement et identifie les individus les plus infectieux peut le rendre équivalent ou supérieur au TAAN pour éviter la transmission.«
Moment des tests, résultats des tests et événements de transmission évités par chaque test, en ambulatoire. Toutes les heures sont indiquées par rapport à l’apparition des symptômes. Le panneau supérieur montre quand les patients atteints de COVID-19 sont évalués (c’est-à-dire lorsqu’ils se présentent aux soins et que les échantillons de diagnostic sont collectés) et quand les résultats du diagnostic sont reçus (avec «Résultat du test» montrant tous les résultats et «COVID-19 diagnostiqué» indiquant le proportion cumulée de patients avec un résultat positif). Alors que 50% des patients sont évalués dans les 3,5 jours suivant l’apparition des symptômes, certains patients se présentent après plus de deux semaines de symptômes (ligne orange en pointillés). Ces retards réduisent la proportion globale de cas détectés par TAAN et Ag-RDT de 90% et 77% (leur sensibilité absolue au début de la maladie) à 80% et 62%, respectivement (lignes pleines). Bien que le TAAN détecte finalement une plus grande proportion de cas que l’Ag-RDT, ceux détectés par l’Ag-RDT sont détectés plus tôt que le TAAN, sont en moyenne plus infectieux et sont à un stade plus aigu de la maladie, ce qui permet à l’Ag-RDT d’avoir un effet plus important sur la transmission que le NAAT (panneau inférieur).
L’Ag-RDT peut offrir plus d’avantages nets que le TAAN ou le jugement clinique avec des délais d’exécution de TAAN> 2 jours
À mesure que les TDR Ag pour le diagnostic du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) deviennent plus largement disponibles, il est essentiel d’identifier les contextes dans lesquels ils offrent un plus grand bénéfice par rapport au TAAN ou au jugement clinique seul. Les chercheurs ont utilisé une nouvelle adaptation de l’analyse des avantages nets et ont démontré que l’Ag-RDT pouvait surpasser le TAAN dans des conditions ambulatoires qui incluent des délais d’exécution de plusieurs jours pour le TAAN, même si l’Ag-RDT a une sensibilité comparativement plus faible.
«Notre nouvelle application de l’analyse de la courbe de décision au COVID-19 démontre l’importance de tenir compte des facteurs au-delà de la sensibilité et de la spécificité lors de l’utilisation de cet outil pour évaluer le diagnostic des maladies infectieuses.»
Ils ont également démontré quand Ag-RDT serait préférable au TAAN en milieu hospitalier, y compris les délais d’exécution du TAAN de plus de 48 heures ou les dosages Ag-RDT qui ont une sensibilité relative> 95% par rapport au TAAN pendant la maladie aiguë.
Sur la base de ces résultats, les auteurs ont conclu que l’Ag-RDT peut apporter un bénéfice net plus important que le TAAN ou le jugement clinique dans le diagnostic du COVID-19 symptomatique, lorsque les délais d’exécution du TAAN sont supérieurs à 2 jours. Le TAAN est susceptible d’être optimal pour les patients hospitalisés avec des symptômes prolongés avant l’admission.
«En conclusion, notre analyse de la courbe de décision modifiée démontre que pour les individus symptomatiques, un Ag-RDT modérément sensible pourrait offrir un bénéfice net plus important que le test TAAN ou le diagnostic clinique pour le COVID-19.»
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique / les comportements liés à la santé ou être traités comme des informations établies.
