Dans un récent rapport de cas publié dans la revue des Centers for Disease Control and Prevention (CDC) des États-Unis Maladies infectieuses émergentesles chercheurs ont signalé un cas de coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) et Nocardia pseudobrasiliensis infection concomitante.
Rapport de cas : Nocardia pseudobrasiliensis Co-infection chez des patients atteints du SRAS-CoV-2. Crédit d’image : Kateryna Kon/Shutterstock
Arrière-plan
Nocardie sont des espèces d’actinomycètes de type aérobie à coloration Gram positive et légèrement acido-résistantes qui peuvent provoquer une maladie disséminée chez les individus immunodéprimés. Noncardiose doivent être inclus dans les diagnostics différentiels de pneumonie chez les personnes immunodéprimées, indépendamment des autres infections concomitantes.
Le traitement combiné carbapénème/sulfamide est utilisé pour le traitement empirique des infections à Nocardia, et l’identification de l’espèce causale est essentielle pour choisir la stratégie thérapeutique la plus optimale. Les co-infections avec d’autres organismes pathogènes pendant ou après la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) ne sont pas courantes, et en particulier, Nocardie et les co-infections par le SRAS-CoV-2 ont rarement été documentées.
À propos du rapport de cas
Dans le présent rapport de cas, les chercheurs ont présenté un patient masculin immunodéprimé COVID-19, âgé de 52 ans, diagnostiqué avec Causée par Nocardia pseudobrasiliensis pneumonie aux États-Unis d’Amérique (USA).
En juillet 2022, le patient de sexe masculin s’est rendu au service des urgences du système de santé de l’université du Commonwealth de Virginie en raison de difficultés respiratoires suite au résultat positif au SRAS-CoV-2 d’un test à domicile. Il a développé des symptômes 10,0 jours avant d’être hospitalisé dans un état hypoxique résultant d’une pneumonie associée au COVID-19. Les symptômes n’incluaient pas les maux de gorge, les frissons, la fièvre, la diarrhée ou les douleurs abdominales.
Le patient prenait de l’empagliflozine pour le diabète sucré de type 2 et avait des antécédents de bronchectasie et de sarcoïdose systémique, y compris une sarcoïdose pulmonaire à un stade avancé et une sarcoïdose cardiaque, gérée par de l’hydroxychloroquine administrée par voie orale (200,0 mg deux fois par jour), administrée par voie intraveineuse (IV) infliximab (à la dose de 800,0 mg à huit semaines d’intervalle) et un défibrillateur automatique implanté. Il avait arrêté de fumer pendant 30 ans et travaillait dans le service d’entretien des appartements.
Lors de l’hospitalisation, une détresse respiratoire et une respiration sifflante ont été documentées, avec des résultats de radiographie pulmonaire associés à une sarcoïdose sans aucune maladie cardio-pulmonaire aiguë. Le remdesivir IV (200,0 mg par jour) et la dexaméthasone (six mg par jour) ont été initiés ; cependant, l’hypoxie s’est aggravée et le lendemain, il a reçu 5,0 L d’oxygène par minute via un masque facial. Par la suite, les médecins ont arrêté le remdesivir en raison d’effets indésirables associés au tractus gastro-intestinal (GIT). Rapport de réaction en chaîne par polymérase (PCR) SARS-CoV-2-positif, nombre élevé de leucocytes de 10 × 109 leucocytes/L, et des taux de protéine C-réactive de 15 mg par dL ont été obtenus.
Trois jours plus tard, des résultats de tomodensitométrie à contraste amélioré de consolidation bilatérale progressive, plus proéminente à la base des poumons, sans aspect de type verre dépoli, ont été observés. Des cultures d’expectorations ont été obtenues et le patient a reçu du tazobactam/pipéracilline IV (3,40 grammes toutes les six heures). Après une semaine d’hospitalisation, les rapports de culture d’expectoration ont indiqué la présence de bâtonnets perlés à Gram positif, évocateurs de Nocardie. Le patient a été transféré à l’imipénem (500,0 mg toutes les six heures) et au sulfaméthoxazole/triméthoprime IV (SMX/TMP) (cinq mg/kg toutes les huit heures). Malgré la bithérapie, l’hypoxie était persistante et au jour 12,0 d’hospitalisation, des opacités nodulaires de consolidation progressive ont été observées dans la région basale du lobe gauche des poumons. En l’absence de réponse au traitement, les médecins ont incorporé du linézolide administré par voie orale (600,0 mg toutes les 12 heures) dans la région antibiotique, après quoi l’hypoxie s’est résolue.
Quatre jours plus tard, les résultats de la spectrométrie de masse à temps de vol avec désorption/ionisation laser assistée par matrice (MALDI-TOF) ont été confirmés Infection à Nocardia pseudobrasiliensis, et colonies blanc crayeux, ayant une pigmentation de couleur orange, du microbe ont été observés. Les tests de sensibilité ont indiqué une résistance à l’imipénème. Le patient a reçu sa sortie de l’hôpital après 20 jours d’hospitalisation, avec une prescription de ciprofloxacine (500,0 mg deux fois par jour) et de linézolide (600 mg deux fois par jour), pendant > 6,0 semaines. L’imagerie par résonance magnétique (IRM) cérébrale avant la sortie n’a montré aucune amélioration de l’anneau ni aucune atteinte du système nerveux central (SNC).
Deux semaines après la sortie, une diminution de l’inconfort respiratoire a été observée, avec seulement une supplémentation intermittente en oxygène nécessaire, après l’effort, et quatre semaines après la sortie, l’imagerie a montré une amélioration nodulaire pulmonaire. L’amélioration symptomatique s’est poursuivie jusqu’à un mois après la sortie. Le patient a temporairement arrêté le traitement en raison de contraintes économiques et est passé au SMX/TMP (deux comprimés de SMX 800,0 mg et de TMP 160,0 mg toutes les huit heures) avec de la ciprofloxacine administrée par voie orale (500,0 mg deux fois par jour). La bithérapie antibiotique a été poursuivie car le patient était sous traitement aux glucocorticoïdes pour une sarcoïdose. Quatre mois après sa sortie de l’hôpital, l’homme n’a ressenti de dyspnée qu’après un effort considérable. Il devait passer à la monothérapie SMX ou TMP suite à une amélioration significative des nodules pulmonaires.
A l’heure actuelle, 10 Nocardie des infections ont été signalées pendant ou après une infection par le SRAS-CoV-2. La majorité des patients ont développé une nocardiose cinq à 50,0 jours après le diagnostic du SRAS-CoV-2, et le délai moyen d’identification de la co-infection était de 17,0 jours. La nocardiose de type pulmonaire a été le plus fréquemment observée, la plupart des infections ont été causées par Nocardia farcinica, et toutes les personnes concernées ont reçu un traitement aux glucocorticoïdes pendant l’hospitalisation. Le linézolide, la clarithromycine et la ciprofloxacine sont généralement efficaces dans la prise en charge Nocardia pseudobrasiliensis infections. Dans l’ensemble, le risque d’infections concomitantes par le SRAS-CoV-2 est faible ; cependant, concernant les patients positifs pour le SRAS-CoV-2 nécessitant une ventilation mécanique invasive, les taux d’incidence de co-infection sont plus élevés.
Sur la base du rapport de cas, des co-infections par Nocardia et SARS-CoV-2 peuvent survenir, en particulier chez les personnes immunodéprimées présentant des comorbidités et des antécédents d’utilisation de glucocorticoïdes. L’amélioration tardive des signes cliniques et des symptômes après l’administration de linézolide souligne l’importance d’une identification rapide de Nocardia et de ses sensibilités aux antibiotiques.
