Avec l'épidémie de coronavirus (COVID-19) en Chine qui se propage à d'autres pays du monde, avec de nombreux décès, les scientifiques recherchent de nouvelles méthodes pour un diagnostic plus efficace et plus précis. Une nouvelle étude publiée dans la revue Radiologie en février 2020, la réalisation d'une tomodensitométrie (TDM) du thorax augmente le taux de diagnostic et surpasse les tests de réaction en chaîne par polymérase à transcription inverse (RT-PCR) actuellement utilisés. Les chercheurs recommandent d'utiliser la tomodensitométrie thoracique pour dépister les patients symptomatiques pour les infections à COVID-19 plutôt que la RT-PCR moins sensible.
Tomodensitométrie thoracique et abdominale. Crédit d'image: Shidlovski / Shutterstock
Sommaire
Le problème
On estime que l'épidémie de COVID-19 a atteint près de 78 500 cas en Chine (cas confirmés). Environ 9 100 d'entre eux étaient graves et plus de 2 744 patients sont décédés d'une pneumonie au COVID-19. Dans d'autres pays, le nombre de cas confirmés est d'environ 4 258, avec 70 décès.
Sans médicaments ou vaccins spécifiques ciblant le virus, la détection précoce et l'isolement des cas sont la seule voie de confinement disponible. La détection, selon les dernières directives chinoises, est confirmée par RT-PCR ou par séquençage de gènes à partir de sécrétions sanguines ou d'expectorations. Les difficultés à prélever des échantillons dans des conditions idéales et à les transporter dans des laboratoires qualifiés pour examen, le temps nécessaire pour obtenir un résultat, ainsi que les limites du kit de test lui-même, ont limité la sensibilité du test RT-PCR effectué sur un écouvillonnage de la gorge échantillons prélevés lors de la première visite à environ 30% à 60%. Ce taux est loin d'être acceptable, étant donné que de nombreux cas peuvent être laissés non diagnostiqués et non traités. Non seulement ces patients sont à risque, mais ils peuvent également infecter la population qui les entoure.
Dans ce contexte, les chercheurs de la présente étude ont décidé d'étudier l'utilité diagnostique de la TDM thoracique, déjà utilisée pour diagnostiquer la pneumonie. Chez la grande majorité des patients atteints de pneumonie au COVID-19, le scanner thoracique montre des résultats typiques, à savoir, quatre opacités en verre dépoli, plusieurs plaques de consolidation, avec ou sans changements interstitiels à la périphérie pulmonaire. De plus, de telles caractéristiques ont également été trouvées chez des patients présentant des symptômes mais avec une RT-PCR initiale négative.
La présente étude a été réalisée afin de tester les performances diagnostiques de la TDM thoracique en tant que mesure complémentaire chez les patients cliniquement symptomatiques avec un premier résultat RT-PCR négatif.
L'étude
L'étude a été menée à Wuhan, en Chine, à partir du 6 janvier 2020, sur plus de 1 000 patients suspectés d'être infectés par COVID-19. Des tests RT-PCR en série et des tomodensitogrammes ont été examinés.
Les résultats des deux tests ont été extraits de la base de données électronique d'un seul hôpital en Chine. Plusieurs tests RT-PCR le jour de la présentation et jusqu'à 3 jours après ont été traités comme des tests de diagnostic. Des tests répétés après cette date ont été utilisés pour vérifier la conversion du résultat négatif en positif ou positif en négatif.
De même, les tomodensitogrammes effectués dans les 7 jours suivant le test de diagnostic RT-PCR ont été inclus dans l'étude. Cela comprenait le premier de plusieurs scans effectués au cours de cette période. Des analyses après l'analyse initiale ont été utilisées pour évaluer le changement de l'activité de la maladie au fil du temps.
Les resultats
Environ 60% se sont révélés positifs avec la RT-PCR, mais 88% avec la tomodensitométrie thoracique. Sur ces 60%, il est possible de déceler 97% des cas en utilisant la TDM thoracique seule. De plus, lorsque le test RT-PCR est négatif, la tomodensitométrie thoracique positive a permis de détecter environ 300 patients de plus qui étaient très susceptibles d'avoir l'infection, et 33% d'entre eux auraient une infection à COVID-19.
Parmi les patients négatifs pour la RT-PCR, 75% ont montré des résultats de TDM thoracique, ce qui suggère une infection au COVID-19. Au total, environ 900 patients ont présenté des résultats positifs de TDM thoracique, avec un âge moyen de 60 ans. Un peu plus de 300 d'entre eux avaient des résultats positifs de TDM thoracique mais des résultats RT-PCR négatifs. Parmi ces patients, 83% présentaient des signes pulmonaires caractéristiques.
Environ la moitié de ces cas étaient très probables, et un autre tiers des cas probables – ce qui signifie que, selon les mots de l'auteur, «environ 81% des patients avec des résultats négatifs de RT-PCR mais des tomodensitogrammes positifs ont été reclassifiés comme hautement cas probables ou probables avec COVID-19.
La détection précoce
Lorsque les patients ont subi plusieurs tests RT-PCR en raison d'un test négatif initial, les enquêteurs ont montré qu'il fallait environ cinq jours avant que les résultats de la RT-PCR soient passés de négatifs à positifs. 15 patients ont subi une séroconversion, et chez 2 patients sur 3, les modifications de la TDM thoracique ont précédé la conversion RT-PCR, avec 93% montrant des signes d'imagerie typiques avant ou simultanément avec un résultat RT-PCR positif.
Dans 57 cas, la première tomodensitométrie thoracique a montré des signes d'infection au COVID-19 avant ou parallèlement aux résultats positifs de la RT-PCR initiale, et près de 100% avaient une tomodensitométrie thoracique positive avant ou dans les six jours suivant la première RT positive -Résultat PCR. Dans 42%, les premiers signes d'amélioration ont été sur la TDM thoracique, avec moins de 4% montrant la tendance inverse.
Concernant la surveillance, les cas positifs de RT-PCR sont devenus négatifs en sept jours environ, alors que les tomodensitogrammes de suivi ont montré une résolution des signes thoraciques avant les résultats de RT-PCR.
Implications
Les tomodensitogrammes thoraciques ont montré une sensibilité plus élevée pour le diagnostic de l'infection au COVID-19 que les résultats initiaux de la RT-PCR. Il a détecté presque tous les cas détectés par RT-PCR, ainsi que 75% des cas initialement manqués avec le test sérologique. Le taux de détection de 88% pourrait aider à contenir la maladie plus efficacement.
La TDM thoracique a donc une valeur prédictive positive et une valeur prédictive négative de 65% et 83%, respectivement. Bien qu'il y ait un nombre relativement élevé de faux positifs, dans une situation d'urgence comme la présente, la priorité est à juste titre d'identifier le plus grand nombre de cas le plus rapidement possible plutôt que l'exactitude absolue du diagnostic. De plus, certains cas de faux positifs dans cette étude pourraient bien avoir été de vrais positifs, étant donné la faible sensibilité du test RT-PCR.
Les chercheurs recommandent l'utilisation de plusieurs paramètres dans de tels cas, y compris les antécédents d'exposition, les symptômes cliniques, les changements CT et les changements évoluant au fil du temps, en disant: «Un diagnostic précoce de COVID-19 est crucial pour le traitement et le contrôle de la maladie. Par rapport à la RT-PCR, la tomodensitométrie thoracique peut être une méthode plus fiable, pratique et rapide pour diagnostiquer et évaluer COVID-19, en particulier dans la zone épidémique. »
Référence de la revue:
Corrélation des tests CT thoraciques et RT-PCR dans la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) en Chine: un rapport de 1014 cas Tao Ai, Zhenlu Yang, Hongyan Hou, Chenao Zhan, Chong Chen, Wenzhi Lv, Qian Tao, Ziyong Sun, et Liming Xia Radiology, https://pubs.rsna.org/doi/10.1148/radiol.2020200642